251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2849 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2849  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.303381 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0185  ATP-dependent protease peptidase subunit  92.35 
 
 		 185 aa  346  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3440  ATP-dependent protease peptidase subunit  86.89 
 
 		 185 aa  325  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.952306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1531  ATP-dependent protease peptidase subunit  83.78 
 
 		 185 aa  317  7e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0181  ATP-dependent protease peptidase subunit  83.24 
 
 		 185 aa  315  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2949  ATP-dependent protease peptidase subunit  84.32 
 
 		 185 aa  315  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.156382  normal  0.168533 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2791  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.98 
 
 		 184 aa  311  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.21 
 
 		 184 aa  250  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.4 
 
 		 184 aa  248  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.14 
 
 		 190 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.57 
 
 		 184 aa  244  4e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.21 
 
 		 186 aa  244  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.4 
 
 		 185 aa  244  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.41 
 
 		 187 aa  243  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 		 175 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.39 
 
 		 182 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.57 
 
 		 184 aa  241  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.57 
 
 		 184 aa  241  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.57 
 
 		 189 aa  240  7.999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.8 
 
 		 206 aa  239  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.57 
 
 		 193 aa  239  1e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.54 
 
 		 186 aa  238  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.54 
 
 		 186 aa  237  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0310  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.93 
 
 		 189 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.94 
 
 		 176 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0032  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.96 
 
 		 186 aa  234  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.14 
 
 		 193 aa  233  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0404  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.14 
 
 		 187 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.52 
 
 		 176 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.8 
 
 		 183 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.43 
 
 		 182 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4309  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.35 
 
 		 175 aa  229  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.74 
 
 		 187 aa  226  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.14 
 
 		 188 aa  225  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.48 
 
 		 199 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.13 
 
 		 184 aa  225  3e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1239  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.48 
 
 		 182 aa  224  6e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426925 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 188 aa  223  1e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3080  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.96 
 
 		 191 aa  223  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2295  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.43 
 
 		 182 aa  221  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0250  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.25 
 
 		 197 aa  221  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505749  normal  0.814167 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0804  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.89 
 
 		 189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.169738  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.33 
 
 		 189 aa  217  7.999999999999999e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 182 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.66 
 
 		 182 aa  212  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2635  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.43 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.27 
 
 		 183 aa  209  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.3 
 
 		 183 aa  209  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.69 
 
 		 174 aa  206  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.69 
 
 		 184 aa  206  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2558  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 188 aa  206  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.95 
 
 		 204 aa  205  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.11 
 
 		 181 aa  204  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 		 181 aa  204  6e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.12 
 
 		 174 aa  203  9e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.63 
 
 		 176 aa  202  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.25 
 
 		 187 aa  202  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.39 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3764  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.8 
 
 		 174 aa  202  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000856229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.11 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.57 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.38 
 
 		 185 aa  201  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 174 aa  201  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2367  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.71 
 
 		 179 aa  200  9e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121979  hitchhiker  0.00000525467 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2747  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.71 
 
 		 173 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.68 
 
 		 179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.47 
 
 		 174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.23 
 
 		 176 aa  197  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3781  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.23 
 
 		 174 aa  197  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.5 
 
 		 176 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.54 
 
 		 176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.44 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0531  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.32 
 
 		 174 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00786303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3361  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.8 
 
 		 174 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2720  20S proteasome A and B subunits  54.19 
 
 		 179 aa  195  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4429  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.32 
 
 		 174 aa  194  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.82 
 
 		 177 aa  194  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1699  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 		 176 aa  193  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000408331  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.93 
 
 		 183 aa  194  9e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 		 178 aa  194  9e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.93 
 
 		 178 aa  193  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.43 
 
 		 196 aa  193  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0473  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.32 
 
 		 174 aa  193  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0463  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.32 
 
 		 174 aa  193  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3867  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.32 
 
 		 174 aa  193  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.49 
 
 		 172 aa  192  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4162  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.32 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3521  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.32 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0434  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.32 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3699  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.32 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.085186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  53.14 
 
 		 178 aa  192  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.91 
 
 		 172 aa  192  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0782  ATP-dependent protease peptidase subunit  50.54 
 
 		 182 aa  191  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  58.19 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  52.69 
 
 		 194 aa  191  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0447  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.32 
 
 		 174 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  55.37 
 
 		 188 aa  191  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0529  ATP-dependent protease peptidase subunit  56.32 
 
 		 174 aa  191  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  54.24 
 
 		 176 aa  191  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>