More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2847 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2847  thioredoxin  100 
 
 		 106 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.300873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3439  thioredoxin  77.36 
 
 		 106 aa  174  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  76.42 
 
 		 106 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4067  thioredoxin  74.53 
 
 		 106 aa  171  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  76.19 
 
 		 107 aa  169  7.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  74.53 
 
 		 106 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  74.53 
 
 		 106 aa  169  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0139  thioredoxin  59.43 
 
 		 106 aa  141  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  59.43 
 
 		 106 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  60 
 
 		 119 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4956  thioredoxin  60 
 
 		 106 aa  137  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  60 
 
 		 106 aa  137  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2682  thioredoxin  57.28 
 
 		 106 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.899838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  61.76 
 
 		 107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  54.72 
 
 		 106 aa  134  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  57.14 
 
 		 107 aa  133  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  58.25 
 
 		 107 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  57.14 
 
 		 108 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3433  thioredoxin  56.44 
 
 		 104 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.513588  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1996  thioredoxin  59.22 
 
 		 106 aa  130  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  58.1 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  58.1 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1411  thioredoxin  62.86 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  57.14 
 
 		 107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  55.45 
 
 		 108 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2292  thioredoxin  59.22 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.345169  normal  0.308955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4174  thioredoxin  55.66 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4854  thioredoxin  51.43 
 
 		 111 aa  128  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.188061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  52.83 
 
 		 106 aa  128  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1989  thioredoxin  58.25 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.154515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  55.45 
 
 		 108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  53.47 
 
 		 108 aa  127  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  52.43 
 
 		 108 aa  126  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1344  thioredoxin  53.92 
 
 		 107 aa  126  9.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00788637  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1294  thioredoxin  52.38 
 
 		 108 aa  125  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0091  thioredoxin 1, redox factor  53.77 
 
 		 106 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal  0.939622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  55.66 
 
 		 107 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  55.66 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2149  thioredoxin  59.38 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3301  thioredoxin  50 
 
 		 106 aa  124  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00133271  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  58.82 
 
 		 106 aa  124  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0051  thioredoxin  51.89 
 
 		 106 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.155345 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  50.98 
 
 		 107 aa  124  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  50.49 
 
 		 108 aa  124  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2548  thioredoxin  53.92 
 
 		 109 aa  123  7e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.543523  normal  0.158534 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  51.43 
 
 		 108 aa  123  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  122  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0201  thioredoxin  52.83 
 
 		 106 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0059  thioredoxin  51.89 
 
 		 106 aa  123  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0076  thioredoxin  53.77 
 
 		 106 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0551582  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  52.48 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0388  thioredoxin  50.94 
 
 		 106 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2263  thioredoxin  52.48 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  54.37 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2195  thioredoxin  52.48 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  120  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  47.62 
 
 		 107 aa  120  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  51.49 
 
 		 108 aa  120  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3311  thioredoxin  49.5 
 
 		 125 aa  121  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.105882  normal  0.0734612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  56.84 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2898  thioredoxin  50.5 
 
 		 133 aa  120  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  58.76 
 
 		 108 aa  120  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1358  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0630  thioredoxin  51.89 
 
 		 106 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  46.6 
 
 		 110 aa  120  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2997  thioredoxin  52.48 
 
 		 108 aa  120  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  56.86 
 
 		 106 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  49.51 
 
 		 110 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  50.48 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3584  thioredoxin  50.48 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2805  thioredoxin  51.49 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686799 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2309  thioredoxin  53.4 
 
 		 108 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000756824  normal  0.11067 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  49.02 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0513  thioredoxin  52.43 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  49.53 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  50.5 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  52.43 
 
 		 109 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  50.48 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  50.5 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  49.53 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9377  thioredoxin  59.14 
 
 		 107 aa  118  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1908  thioredoxin  52.53 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00177252  normal  0.288463 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  50.5 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  47.57 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3655  thioredoxin  51.43 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000417679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11291  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  48.57 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.554772 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2185  thioredoxin  49 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000121318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>