109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2800 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0623  AMP nucleosidase  66.6 
 
 		 500 aa  659    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.625588  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1387  AMP nucleosidase  75.57 
 
 		 492 aa  754    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0347338  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0337  AMP nucleosidase  77.57 
 
 		 494 aa  769    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2800  AMP nucleosidase  100 
 
 		 488 aa  1009    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.955099 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0916  AMP nucleosidase  64.69 
 
 		 499 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0206359  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0404  AMP nucleosidase  74.69 
 
 		 494 aa  749    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0054  AMP nucleosidase  75.57 
 
 		 492 aa  754    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2794  AMP nucleosidase  77.02 
 
 		 483 aa  768    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.859407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0622  AMP nucleosidase  66.6 
 
 		 500 aa  659    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0658  AMP nucleosidase  65.03 
 
 		 500 aa  645    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2656  AMP nucleosidase  67.81 
 
 		 500 aa  664    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3289  AMP nucleosidase  74.9 
 
 		 489 aa  751    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0963  AMP nucleosidase  64.69 
 
 		 500 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1414  AMP nucleosidase  64.83 
 
 		 504 aa  647    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1114  AMP nucleosidase  65.1 
 
 		 500 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2838  AMP nucleosidase  63.6 
 
 		 510 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0309  AMP nucleosidase  63.38 
 
 		 508 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0857  AMP nucleosidase  63.38 
 
 		 508 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0315968  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1489  AMP nucleosidase  63.38 
 
 		 508 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1685  AMP nucleosidase  63.38 
 
 		 508 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2553  AMP nucleosidase  63.38 
 
 		 508 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.325528  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2416  AMP nucleosidase  63.38 
 
 		 508 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0341  AMP nucleosidase  63.38 
 
 		 508 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824127  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6793  AMP nucleosidase  62.99 
 
 		 508 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00470693  hitchhiker  0.00000107596 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0602  AMP nucleosidase  63.05 
 
 		 508 aa  599  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4496  AMP nucleosidase  61.65 
 
 		 508 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.168653  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3237  AMP nucleosidase  62.02 
 
 		 508 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0388268 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3869  AMP nucleosidase  61.65 
 
 		 508 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0650151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4876  AMP nucleosidase  62.1 
 
 		 526 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000501622 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3658  AMP nucleosidase  61.65 
 
 		 508 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3766  AMP nucleosidase  62.02 
 
 		 508 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00262282  decreased coverage  0.000373765 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4414  AMP nucleosidase  62.99 
 
 		 518 aa  598  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2227  AMP nucleosidase  61.45 
 
 		 508 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2704  AMP nucleosidase  61.37 
 
 		 494 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.564034 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3569  AMP nucleosidase  60.08 
 
 		 512 aa  570  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0254113  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3701  AMP nucleosidase  59.84 
 
 		 495 aa  569  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.507304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1155  AMP nucleosidase  57.93 
 
 		 493 aa  557  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4246  AMP nucleosidase  56.8 
 
 		 493 aa  553  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.565959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3709  AMP nucleosidase  57.2 
 
 		 493 aa  552  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.456072  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1201  AMP nucleosidase  57.91 
 
 		 498 aa  554  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0088  AMP nucleosidase  59.88 
 
 		 499 aa  553  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0485  AMP nucleosidase  57.2 
 
 		 493 aa  553  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486442  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0642  AMP nucleosidase  58.06 
 
 		 498 aa  550  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3545  AMP nucleosidase  56.65 
 
 		 506 aa  542  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.502164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4957  AMP nucleosidase  56.37 
 
 		 505 aa  541  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3401  AMP nucleosidase  55.13 
 
 		 517 aa  527  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0546432 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0214  AMP nucleosidase  57.11 
 
 		 493 aa  502  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.939033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5425  AMP nucleosidase  56.76 
 
 		 496 aa  502  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528321  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3922  AMP nucleosidase  56.9 
 
 		 493 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.890512 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4036  AMP nucleosidase  56.9 
 
 		 493 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.282397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5885  AMP nucleosidase  56.64 
 
 		 496 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1488  AMP nucleosidase  54.39 
 
 		 485 aa  487  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.504938 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2827  AMP nucleosidase  49.27 
 
 		 485 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1413  AMP nucleosidase  49.69 
 
 		 494 aa  422  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.43722  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0408  AMP nucleosidase  50.62 
 
 		 492 aa  424  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2112  AMP nucleosidase  49.27 
 
 		 484 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000296443  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1215  AMP nucleosidase  48.44 
 
 		 485 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2572  AMP nucleosidase  48.37 
 
 		 484 aa  418  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2669  AMP nucleosidase  48.86 
 
 		 482 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2179  AMP nucleosidase  49.27 
 
 		 484 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00600152  normal  0.598678 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2231  AMP nucleosidase  49.27 
 
 		 484 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.822424 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2167  AMP nucleosidase  49.27 
 
 		 484 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000113485  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2344  AMP nucleosidase  49.27 
 
 		 484 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0273914  hitchhiker  0.00120533 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01894  AMP nucleosidase  49.06 
 
 		 484 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1671  AMP nucleosidase  49.06 
 
 		 484 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4795  AMP nucleosidase  48.34 
 
 		 487 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4337  AMP nucleosidase  48.76 
 
 		 487 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.298005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4942  AMP nucleosidase  50 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12490  AMP nucleosidase  49.79 
 
 		 499 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4655  AMP nucleosidase  49.9 
 
 		 516 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.370825  normal  0.206703 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2264  AMP nucleosidase  49.06 
 
 		 484 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000140487  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3127  AMP nucleosidase  48.12 
 
 		 486 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4704  AMP nucleosidase  48.45 
 
 		 484 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.591798 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1661  AMP nucleosidase  49.06 
 
 		 484 aa  412  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00901346  normal  0.0509963 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1143  AMP nucleosidase  49.06 
 
 		 484 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000908375  hitchhiker  0.00000131711 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2824  AMP nucleosidase  49.06 
 
 		 484 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal  0.783783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1138  AMP nucleosidase  49.59 
 
 		 491 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351702  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2105  AMP nucleosidase  48.85 
 
 		 484 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125567  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4833  AMP nucleosidase  49.69 
 
 		 487 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0641  AMP nucleosidase  49.9 
 
 		 487 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4779  AMP nucleosidase  49.27 
 
 		 487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.549989  decreased coverage  0.00166711 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1423  AMP nucleosidase  47.5 
 
 		 484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0684636  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1955  AMP nucleosidase  49.08 
 
 		 496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1823  AMP nucleosidase  47.5 
 
 		 486 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3750  AMP nucleosidase  48.28 
 
 		 490 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.963566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1846  AMP nucleosidase  48.25 
 
 		 496 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0167  AMP nucleosidase  50.8 
 
 		 493 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4233  AMP nucleosidase  47.87 
 
 		 493 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00168339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4743  AMP nucleosidase  47.36 
 
 		 493 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0454  AMP nucleosidase  46.17 
 
 		 497 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0681  AMP nucleosidase  46.68 
 
 		 495 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.114731  normal  0.0716932 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09370  AMP nucleosidase  49.18 
 
 		 490 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0708  AMP nucleosidase  45.69 
 
 		 495 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188905  normal  0.140174 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0986  AMP nucleosidase  52.84 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000563719  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0721  AMP nucleosidase  45.69 
 
 		 495 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3407  AMP nucleosidase  38.83 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474921  hitchhiker  0.0063394 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0980  AMP nucleosidase  31.74 
 
 		 277 aa  111  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3372  AMP nucleosidase  30.87 
 
 		 258 aa  108  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.570748 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3079  AMP nucleosidase  34.29 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0103921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2420  AMP nucleosidase  30.18 
 
 		 257 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>