23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2707 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2707  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 527 aa  1036    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.458027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4444  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.64 
 
 		 501 aa  326  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2766  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.82 
 
 		 530 aa  293  6e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2810  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.82 
 
 		 530 aa  293  6e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2028  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.38 
 
 		 528 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0712084  hitchhiker  0.00921779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3054  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.25 
 
 		 533 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.951228  normal  0.199376 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3202  MFS transporter xanthine/uracil permease  35.54 
 
 		 518 aa  282  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0733  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.23 
 
 		 596 aa  279  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6447  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.69 
 
 		 530 aa  273  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.321531  normal  0.122542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2657  hypothetical protein  36.36 
 
 		 526 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.728518  normal  0.0923738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2756  hypothetical protein  35.77 
 
 		 551 aa  270  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1746  hypothetical protein  35.27 
 
 		 519 aa  260  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00122276  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18531  permease  32.83 
 
 		 533 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.632317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2322  hypothetical protein  32.81 
 
 		 589 aa  234  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3142  xanthine/uracil/vitamin C permease  30.64 
 
 		 514 aa  229  7e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.097798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 531 aa  228  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.528166  normal  0.285686 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3148  sulphate transporter  32.58 
 
 		 535 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.217521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13078  predicted protein  29.29 
 
 		 480 aa  195  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04862  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family protein  32.38 
 
 		 533 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10988  predicted protein  28.51 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03660  hypothetical protein  26.54 
 
 		 497 aa  134  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119535  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  26.63 
 
 		 520 aa  44.3  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1334  sulphate transporter  26.6 
 
 		 526 aa  43.5  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.457277  normal  0.0874584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>