64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2663 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2663  penicillin-insensitive murein endopeptidase  100 
 
 		 307 aa  627  1e-179  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3338  penicillin-insensitive murein endopeptidase  60.29 
 
 		 296 aa  333  3e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0021  penicillin-insensitive murein endopeptidase  59.14 
 
 		 293 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0031  penicillin-insensitive murein endopeptidase  60.66 
 
 		 294 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1363  penicillin-insensitive murein endopeptidase  60.66 
 
 		 294 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2659  penicillin-insensitive murein endopeptidase  58.49 
 
 		 290 aa  311  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.578281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0344  penicillin-insensitive murein endopeptidase  53.75 
 
 		 300 aa  299  4e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1047  penicillin-insensitive murein endopeptidase  51.01 
 
 		 340 aa  275  7e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.203239  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0985  penicillin-insensitive murein endopeptidase  51.01 
 
 		 340 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3596  penicillin-insensitive murein endopeptidase  53.01 
 
 		 345 aa  269  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1334  penicillin-insensitive murein endopeptidase  50.66 
 
 		 310 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3367  penicillin-insensitive murein endopeptidase  51.7 
 
 		 355 aa  262  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5739  penicillin-insensitive murein endopeptidase  49.64 
 
 		 324 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3098  penicillin-insensitive murein endopeptidase  48.87 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0450  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.45 
 
 		 318 aa  252  6e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.0724042 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3296  penicillin-insensitive murein endopeptidase  52.19 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00347762 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0394  penicillin-insensitive murein endopeptidase  46.69 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1139  penicillin-insensitive murein endopeptidase  47.79 
 
 		 307 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0305084  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4445  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.78 
 
 		 358 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.710373 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2176  penicillin-insensitive murein endopeptidase  47.6 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0437  penicillin-insensitive murein endopeptidase  46.89 
 
 		 320 aa  239  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.374633  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4131  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.05 
 
 		 358 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0461915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0241  penicillin-insensitive murein endopeptidase  49.63 
 
 		 336 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.264656  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0341  penicillin-insensitive murein endopeptidase  47.78 
 
 		 350 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.453841 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3607  penicillin-insensitive murein endopeptidase  47.97 
 
 		 309 aa  232  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0158  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.52 
 
 		 317 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0051  penicillin-insensitive murein endopeptidase  45.72 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7377  penicillin-insensitive murein endopeptidase  42.77 
 
 		 313 aa  229  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3284  penicillin-insensitive murein endopeptidase  46.86 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3484  penicillin-insensitive murein endopeptidase  46.49 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.395907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0581  penicillin-insensitive murein endopeptidase  46.38 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.29607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4516  penicillin-insensitive murein endopeptidase  46.35 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004390  murein endopeptidase  41.98 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1204  penicillin-insensitive murein endopeptidase  39.18 
 
 		 279 aa  191  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.107398  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0560  penicillin-insensitive murein endopeptidase  42.27 
 
 		 278 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1690  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.94 
 
 		 279 aa  189  7e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01020  penicillin-insensitive murein endopeptidase  44.34 
 
 		 282 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0543  penicillin-insensitive murein endopeptidase  40.65 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3373  penicillin-insensitive murein endopeptidase  41.38 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.903399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2592  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.89 
 
 		 276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6120  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.11 
 
 		 299 aa  162  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1515  penicillin-insensitive murein endopeptidase  39.53 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0376  penicillin-insensitive murein endopeptidase  39.53 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1406  penicillin-insensitive murein endopeptidase  39.53 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.277424  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1454  penicillin-insensitive murein endopeptidase  39.37 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2810  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.98 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1346  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.29 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2572  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.62 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2625  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.62 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.644795  hitchhiker  0.000000497544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2612  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.62 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.728479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2523  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.62 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2736  penicillin-insensitive murein endopeptidase  38.62 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1328  peptidase U6 penicillin-insensitive murein endopeptidase  36.99 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02213  hypothetical protein  36.99 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02253  penicillin-insensitive murein endopeptidase  36.99 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3469  penicillin-insensitive murein endopeptidase  36.84 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2706  penicillin-insensitive murein endopeptidase  37.25 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2485  penicillin-insensitive murein endopeptidase  37.1 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.765276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2480  penicillin-insensitive murein endopeptidase  36.99 
 
 		 274 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2623  penicillin-insensitive murein endopeptidase  36.99 
 
 		 274 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1324  penicillin-insensitive murein endopeptidase  36.99 
 
 		 274 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2876  penicillin-insensitive murein endopeptidase  34.77 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0818548  normal  0.124229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  28.64 
 
 		 377 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2785  peptidoglycan-binding LysM  27.45 
 
 		 647 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>