More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2654 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 517 aa  1064    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  38.75 
 
 		 399 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  32.19 
 
 		 410 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  36.01 
 
 		 404 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  35.94 
 
 		 421 aa  216  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 		 407 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  37.22 
 
 		 391 aa  207  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  35.08 
 
 		 464 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  34.84 
 
 		 396 aa  190  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.88 
 
 		 465 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  33.07 
 
 		 416 aa  183  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  32.62 
 
 		 381 aa  183  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  32.98 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  32.64 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  32.64 
 
 		 400 aa  177  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  34.38 
 
 		 426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  31.99 
 
 		 494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  31.55 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  32.45 
 
 		 406 aa  171  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  30.79 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  33.24 
 
 		 348 aa  166  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  30.87 
 
 		 450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  30.1 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  31.83 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.83 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  32.84 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  29.58 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  31.15 
 
 		 405 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  34.3 
 
 		 379 aa  156  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  28.75 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  29.38 
 
 		 420 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  31.13 
 
 		 367 aa  153  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  31.47 
 
 		 411 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  33.71 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.45 
 
 		 411 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  32.99 
 
 		 370 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  28.77 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  31.17 
 
 		 367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  26.85 
 
 		 406 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  38.5 
 
 		 641 aa  109  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  31.69 
 
 		 614 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  28.95 
 
 		 860 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  42.26 
 
 		 500 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  34.95 
 
 		 483 aa  106  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  39.07 
 
 		 864 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  31.76 
 
 		 577 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  39.87 
 
 		 859 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  38.24 
 
 		 536 aa  103  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  35.12 
 
 		 528 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  35.12 
 
 		 528 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.05 
 
 		 585 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  35.12 
 
 		 528 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  40.52 
 
 		 858 aa  101  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  39.41 
 
 		 549 aa  101  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  41.03 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  31.25 
 
 		 431 aa  100  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  34.5 
 
 		 532 aa  100  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  30.8 
 
 		 441 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3868  adenylate/guanylate cyclase  34.01 
 
 		 540 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0820885  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3854  putative adenylate/guanylate cyclase  34.01 
 
 		 540 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296872  hitchhiker  0.00729431 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3942  putative adenylate/guanylate cyclase  34.01 
 
 		 540 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0593664  normal  0.0915565 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 		 861 aa  98.6  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2183  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  41.29 
 
 		 539 aa  99  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000625001  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0786  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.08 
 
 		 539 aa  99  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  35 
 
 		 488 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  32.61 
 
 		 607 aa  97.4  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  30.11 
 
 		 701 aa  97.1  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.33 
 
 		 652 aa  97.1  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  28.8 
 
 		 741 aa  96.3  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11351  adenylate cyclase  34.34 
 
 		 567 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.959564 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2336  putative adenylate/guanylate cyclase  37.37 
 
 		 536 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  31.86 
 
 		 591 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  35.53 
 
 		 746 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4309  putative adenylate/guanylate cyclase  35.42 
 
 		 536 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  27.02 
 
 		 528 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.34 
 
 		 696 aa  95.1  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  32.63 
 
 		 358 aa  95.1  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  28.63 
 
 		 487 aa  94.4  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  27.81 
 
 		 734 aa  94  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  28.98 
 
 		 701 aa  94  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  38.55 
 
 		 571 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.77 
 
 		 465 aa  92.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  40.67 
 
 		 488 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 		 911 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  30.57 
 
 		 641 aa  90.9  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  30.04 
 
 		 701 aa  90.5  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  31.15 
 
 		 971 aa  90.9  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11346  adenylate cyclase  31.63 
 
 		 217 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.306360000000001e-28  normal  0.760848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  37.06 
 
 		 514 aa  90.1  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  32.8 
 
 		 735 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11350  adenylate cyclase  31.43 
 
 		 558 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000457389  normal  0.631682 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  29.82 
 
 		 636 aa  89.4  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.43 
 
 		 672 aa  89  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.12 
 
 		 737 aa  88.6  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  28 
 
 		 759 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.98 
 
 		 656 aa  89.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  29 
 
 		 760 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  29 
 
 		 513 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0730  hypothetical protein  35 
 
 		 437 aa  88.6  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>