250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2635 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2635  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 		 394 aa  813    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.574688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0121  aromatic amino acid aminotransferase  67.35 
 
 		 406 aa  547  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0630  aromatic amino acid aminotransferase  64.47 
 
 		 394 aa  545  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.302559 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2545  aromatic amino acid aminotransferase  67.1 
 
 		 406 aa  544  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0886  aromatic amino acid aminotransferase  66.58 
 
 		 394 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0028  aromatic amino acid aminotransferase  50.13 
 
 		 399 aa  425  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7524  aromatic amino acid aminotransferase  49.23 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4005  aromatic amino acid aminotransferase  49.23 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143022  normal  0.2013 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0447  aromatic amino acid aminotransferase  46.41 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05719  aromatic amino acid aminotransferase  47.3 
 
 		 398 aa  391  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1320  aromatic amino acid aminotransferase  47.7 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000111  aspartate aminotransferase  46.27 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4016  aromatic amino acid aminotransferase  46.31 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000187367  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0789  aromatic amino acid aminotransferase  45.5 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2063  aromatic amino acid aminotransferase  46.31 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0705193  unclonable  0.00000000000361956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2282  aromatic amino acid aminotransferase  46.31 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00982578  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1951  aromatic amino acid aminotransferase  45.92 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0169777  hitchhiker  0.00556928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3114  aromatic amino acid aminotransferase  48.34 
 
 		 398 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.384285 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2067  aromatic amino acid aminotransferase  46.31 
 
 		 396 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.217652  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2399  aromatic amino acid aminotransferase  46.31 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000566266  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2057  aromatic amino acid aminotransferase  45.55 
 
 		 396 aa  362  6e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00131277  unclonable  0.0000291193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1974  aromatic amino acid aminotransferase  45.55 
 
 		 396 aa  362  9e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00339161  hitchhiker  0.0000000366479 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1921  aromatic amino acid aminotransferase  45.55 
 
 		 396 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0115062  hitchhiker  0.00000000119915 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2045  aromatic amino acid aminotransferase  44.9 
 
 		 396 aa  359  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00201234  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3509  aromatic amino acid aminotransferase  47.62 
 
 		 389 aa  358  9e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1733  aromatic amino acid aminotransferase  45.55 
 
 		 396 aa  358  9e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162633  hitchhiker  0.000702513 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2406  aromatic amino acid aminotransferase  44.9 
 
 		 396 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4970  aromatic amino acid aminotransferase  44.39 
 
 		 396 aa  355  7.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0763  aromatic amino acid aminotransferase  47.09 
 
 		 401 aa  354  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615005  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2126  aromatic amino acid aminotransferase  45.29 
 
 		 396 aa  353  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.621421  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1805  aromatic amino acid aminotransferase  43.11 
 
 		 397 aa  353  4e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0271034  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1232  aromatic amino acid aminotransferase  44.53 
 
 		 397 aa  352  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1750  aromatic amino acid aminotransferase  43.88 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.270408  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4445  aromatic amino acid aminotransferase  43.11 
 
 		 398 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  43.11 
 
 		 397 aa  349  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1497  aromatic amino acid aminotransferase  44.76 
 
 		 397 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2308  aromatic amino acid aminotransferase  44.08 
 
 		 401 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0907189  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2020  aromatic amino acid aminotransferase  42.86 
 
 		 397 aa  346  3e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00317803  hitchhiker  0.00000201349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2301  aromatic amino acid aminotransferase  43.83 
 
 		 401 aa  346  4e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.359356  hitchhiker  0.0000000291416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01010  aromatic amino acid aminotransferase  42.75 
 
 		 396 aa  345  6e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00165068  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2411  aromatic amino acid aminotransferase  42.78 
 
 		 397 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0265912  hitchhiker  0.0000197761 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2228  aromatic amino acid aminotransferase  42.6 
 
 		 397 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000156913  normal  0.0325247 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2070  aromatic amino acid aminotransferase  43.37 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0652807  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1955  aromatic amino acid aminotransferase  42.6 
 
 		 397 aa  343  4e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2228  aromatic amino acid aminotransferase  40.56 
 
 		 397 aa  342  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.207544  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4646  aromatic amino acid aminotransferase  43.73 
 
 		 399 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198884  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1945  aromatic amino acid aminotransferase  41.84 
 
 		 397 aa  342  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2156  aromatic amino acid aminotransferase  42.09 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0020376  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1668  aromatic amino acid aminotransferase  41.84 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0301688  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5386  aromatic amino acid aminotransferase  43.51 
 
 		 391 aa  340  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.773593  normal  0.409565 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2350  aromatic amino acid aminotransferase  41.58 
 
 		 397 aa  339  5e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2206  aromatic amino acid aminotransferase  41.84 
 
 		 397 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000624444  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53010  aromatic amino acid aminotransferase  43.73 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4501  aromatic amino acid aminotransferase  42.09 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2215  aromatic amino acid aminotransferase  42.09 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106889  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1729  aromatic amino acid aminotransferase  41.22 
 
 		 401 aa  337  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0015695  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00932  aspartate aminotransferase, PLP-dependent  42.68 
 
 		 396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2715  Aspartate transaminase  42.68 
 
 		 396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0131246  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2668  aromatic amino acid aminotransferase  42.68 
 
 		 396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0040813  normal  0.145428 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1036  aromatic amino acid aminotransferase  42.68 
 
 		 396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0142367  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2192  aromatic amino acid aminotransferase  42.68 
 
 		 396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.330977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2390  aromatic amino acid aminotransferase  42.68 
 
 		 396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0218945  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00939  hypothetical protein  42.68 
 
 		 396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00958049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1027  aromatic amino acid aminotransferase  42.68 
 
 		 396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0212839  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0145  aromatic amino acid aminotransferase  45.76 
 
 		 392 aa  335  9e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2225  aromatic amino acid aminotransferase  41.84 
 
 		 398 aa  335  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1113  aromatic amino acid aminotransferase  42.42 
 
 		 396 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.614481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1063  aromatic amino acid aminotransferase  41.22 
 
 		 396 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000263956 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1976  aromatic amino acid aminotransferase  40.71 
 
 		 396 aa  333  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0279387  normal  0.804208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1096  aromatic amino acid aminotransferase  41.22 
 
 		 396 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1031  aromatic amino acid aminotransferase  41.22 
 
 		 396 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.643394  hitchhiker  0.0066077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1004  aromatic amino acid aminotransferase  41.22 
 
 		 396 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0709004  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2560  aromatic amino acid aminotransferase  40.71 
 
 		 396 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000517501  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1999  aromatic amino acid aminotransferase  41.58 
 
 		 397 aa  333  4e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1089  aromatic amino acid aminotransferase  42.42 
 
 		 396 aa  333  4e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00147404  normal  0.202333 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3552  aromatic amino acid aminotransferase  43.51 
 
 		 398 aa  333  4e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.571583  normal  0.0997527 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2650  aromatic amino acid aminotransferase  40.71 
 
 		 396 aa  332  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000706287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4224  aromatic amino acid aminotransferase  45.65 
 
 		 388 aa  332  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1687  aromatic amino acid aminotransferase  40.31 
 
 		 399 aa  332  9e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.262918  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4192  aromatic amino acid aminotransferase  43.54 
 
 		 396 aa  330  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516062  normal  0.0204387 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1447  aromatic amino acid aminotransferase  42.36 
 
 		 396 aa  329  6e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.295787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2024  aromatic amino acid aminotransferase  41.07 
 
 		 397 aa  329  6e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1783  aromatic amino acid aminotransferase  40.71 
 
 		 396 aa  328  7e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00163536  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2055  aromatic amino acid aminotransferase  40.97 
 
 		 396 aa  328  7e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0474207  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003143  aspartate aminotransferase  40.61 
 
 		 396 aa  326  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1635  aromatic amino acid aminotransferase  40.71 
 
 		 396 aa  327  3e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0826561  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0911  aromatic amino acid aminotransferase  42.13 
 
 		 411 aa  325  9e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0838  aromatic amino acid aminotransferase  40.2 
 
 		 396 aa  325  1e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01890  aromatic amino acid aminotransferase  41.12 
 
 		 399 aa  323  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0792  aromatic amino acid aminotransferase  41.69 
 
 		 415 aa  323  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  41.73 
 
 		 400 aa  321  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000117324 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3504  aromatic amino acid aminotransferase  40.15 
 
 		 397 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1976  aromatic amino acid aminotransferase  38.68 
 
 		 396 aa  318  7e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0721225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1664  aromatic amino acid aminotransferase  39.19 
 
 		 396 aa  317  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.233263  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3642  aromatic amino acid aminotransferase  40.2 
 
 		 397 aa  315  8e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.463621  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2171  aromatic amino acid aminotransferase  40.46 
 
 		 401 aa  312  6.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  39.8 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03926  tyrosine aminotransferase, tyrosine-repressible, PLP-dependent  39.95 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0286494  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03886  hypothetical protein  39.95 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0274153  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4294  aromatic amino acid aminotransferase  39.69 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.820451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>