More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2581 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2581  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 390 aa  817    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000560226 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  61.79 
 
 		 390 aa  522  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  61.03 
 
 		 390 aa  518  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  61.28 
 
 		 390 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  60 
 
 		 389 aa  507  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  60 
 
 		 394 aa  500  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  56.15 
 
 		 390 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  40.92 
 
 		 391 aa  302  7.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  38.32 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  37.6 
 
 		 393 aa  286  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  36.78 
 
 		 405 aa  286  5e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  37.88 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  37.88 
 
 		 393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  37.88 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  35.92 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  37.7 
 
 		 393 aa  279  5e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  35.75 
 
 		 386 aa  279  8e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  37.96 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  37.98 
 
 		 391 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  38.83 
 
 		 393 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  34.78 
 
 		 390 aa  275  8e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  38.24 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  34.68 
 
 		 397 aa  269  8e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  33.59 
 
 		 383 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  36.15 
 
 		 400 aa  268  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  37.63 
 
 		 399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  39.12 
 
 		 381 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  36.9 
 
 		 392 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  36.64 
 
 		 393 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  37.73 
 
 		 385 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  34.46 
 
 		 386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  34.44 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  37.73 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  34.61 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  32.4 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  34.34 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  34.02 
 
 		 401 aa  256  7e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  34.34 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  31.19 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  34.18 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  33.67 
 
 		 396 aa  254  3e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  34.2 
 
 		 392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  34.2 
 
 		 392 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  31.79 
 
 		 383 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  31.35 
 
 		 383 aa  252  6e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  31.89 
 
 		 383 aa  252  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  34.65 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  31.89 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  34.45 
 
 		 521 aa  250  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  31.89 
 
 		 383 aa  249  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  31.28 
 
 		 383 aa  249  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  31.63 
 
 		 383 aa  249  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  32.4 
 
 		 383 aa  249  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  36.86 
 
 		 383 aa  249  6e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  31.63 
 
 		 383 aa  248  9e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  31.97 
 
 		 395 aa  248  9e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  31.63 
 
 		 383 aa  248  9e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  36.95 
 
 		 386 aa  246  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  37.19 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  33.51 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  35.92 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  35.92 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  35.31 
 
 		 393 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  36.22 
 
 		 390 aa  240  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  34.97 
 
 		 385 aa  240  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  32.4 
 
 		 404 aa  238  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  34.65 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  34.77 
 
 		 387 aa  237  3e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  35.29 
 
 		 379 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  32.14 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1671  aminotransferase class I and II  34.11 
 
 		 400 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1669  aminotransferase class I and II  34.11 
 
 		 400 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1786  aminotransferase  34.11 
 
 		 400 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1608  aminotransferase class I and II  34.11 
 
 		 400 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1734  aminotransferase class I and II  33.85 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  33.25 
 
 		 383 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  33.84 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  30.59 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1587  aminotransferase, class I  29.72 
 
 		 389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0225377  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  34.45 
 
 		 390 aa  226  7e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  31.63 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  30.69 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  30.13 
 
 		 386 aa  219  6e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  30.53 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  29.34 
 
 		 399 aa  216  4e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  34.72 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  30 
 
 		 383 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  33.5 
 
 		 400 aa  212  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  30.46 
 
 		 390 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3736  aminotransferase, class I and II  32.33 
 
 		 392 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2960  aminotransferase, classes I and II  29.26 
 
 		 391 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1662  aminotransferase, class I and II  30.41 
 
 		 378 aa  210  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  30.87 
 
 		 393 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0792  aminotransferase  29.27 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.108928  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  30.18 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1347  aminotransferase class I and II  29.53 
 
 		 381 aa  205  1e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1562  protein MalY  31.22 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00682434  normal  0.389614 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1614  cystathionine beta-lyase  27.88 
 
 		 389 aa  202  8e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4129  aminotransferase, class I and II  34.55 
 
 		 376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  33.76 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>