34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2414 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  40.15 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  36.25 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  36.25 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  36.25 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  35.91 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  40.89 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  37.61 
 
 		 332 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  36.55 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  36.14 
 
 		 257 aa  131  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  34.78 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  35.92 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  33.33 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  33.33 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  35.63 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  34.65 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  36.68 
 
 		 270 aa  121  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  35.68 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  36.86 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  40.62 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  39.1 
 
 		 261 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  30.59 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  36.68 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  35.43 
 
 		 261 aa  111  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  29.13 
 
 		 259 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  32.33 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  28.74 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  28.24 
 
 		 264 aa  96.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  28.95 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  26.67 
 
 		 266 aa  95.1  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  29.57 
 
 		 306 aa  89.7  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  29.2 
 
 		 266 aa  89  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  37.93 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.24755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>