213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2386 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
154 aa  324  3e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  42.57 
 
 
161 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195178  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2702  GCN5-related N-acetyltransferase  39.16 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.492621  normal  0.727576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4578  putative GCN5-related N-acetyltransferase (GNAT)  40.48 
 
 
148 aa  84  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140894  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1335  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000497288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
164 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.169215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
237 aa  77  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609857  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2672  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3879  GCN5-related N-acetyltransferase  39.5 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.444089  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4188  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487702  normal  0.251974 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2415  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00150831  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0298  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2531  GCN5-related N-acetyltransferase  29.69 
 
 
291 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.801418  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1677  GCN5-related N-acetyltransferase  41.03 
 
 
171 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00114671  hitchhiker  0.00451269 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  38.83 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.795815  normal  0.63662 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1998  acetyltransferase (GNAT) family protein  39.06 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0762765  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5293  hypothetical protein  33.72 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0283195 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.135178  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2005  hypothetical protein  38.16 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3377  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
143 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  24.82 
 
 
165 aa  52  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  34.95 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2607  acetyltransferase  35.38 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4128  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 
163 aa  51.2  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000338404  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2137  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
167 aa  50.8  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2585  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000324557 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3135  GCN5-related N-acetyltransferase  32.85 
 
 
179 aa  50.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707341  decreased coverage  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17910  acetyltransferase  43.4 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.501427  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2038  acetyltransferase  33.73 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4376  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.246785 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0750  GCN5-related N-acetyltransferase  33.73 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.620129  normal  0.699411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2933  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0253991  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  34.92 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0922659  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26100  predicted acetyltransferase  32.24 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3468  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
197 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5388  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
179 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.395987 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4898  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
197 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2282  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0914667  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0469  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.714441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  33.04 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187348  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0526  acetyltransferase  24 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.012203  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1598  GCN5-related protein N-acetyltransferase  43.4 
 
 
192 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1736  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6096  hypothetical protein  33.73 
 
 
149 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.164941  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1981  hypothetical protein  33.73 
 
 
149 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4246  hypothetical protein  34.18 
 
 
147 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4554  hypothetical protein  34.18 
 
 
147 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.321988  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0839  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.020664 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1398  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2393  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
170 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0945541  hitchhiker  0.000263761 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03884  predicted acetyltransferase  34.18 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3985  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03844  hypothetical protein  34.18 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.194334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5482  hypothetical protein  34.18 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4018  hypothetical protein  34.18 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.131237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 
147 aa  47  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0731728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6850  GCN5-related N-acetyltransferase  33.01 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1581  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0579775  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11190  sortase-like acyltransferase  40.74 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0130683  normal  0.626288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0063  hypothetical protein  35.35 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800795  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2117  GCN5-related N-acetyltransferase  32.59 
 
 
187 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1583  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4489  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.410319  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01144  histone acetyltransferase HPA2-like acetyltransferase  36.11 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0271075  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0821  GCN5-related N-acetyltransferase  34.58 
 
 
190 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0847  GCN5-related N-acetyltransferase  27.15 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4277  GCN5-related N-acetyltransferase  32.38 
 
 
174 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.206769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03080  putative acetyltransferase  36.49 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.043111  hitchhiker  0.000000418367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3512  beta-lactamase  29.17 
 
 
547 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265184  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0463  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
168 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0436  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189459  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0333  putative acetyltransferase  36.84 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0736  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3709  GCN5-related N-acetyltransferase  26.59 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13780  acetyltransferase (GNAT) family protein  36.47 
 
 
164 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.657204 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2577  acetyltransferase  26.25 
 
 
180 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000295975  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2533  acetyltransferase  26.88 
 
 
180 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000193156  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0811  GCN5-related N-acetyltransferase  43.86 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.214529 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0166  hypothetical protein  28.24 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2764  acetyltransferase  26.25 
 
 
180 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.824722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2771  acetyltransferase, GNAT family  26.25 
 
 
180 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0074365 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2478  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.263988  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 
188 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2061  acetyltransferase  30.3 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1433  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0432  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617149  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3901  acetyltransferase  32.58 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0744234  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3751  hypothetical protein  28.24 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4046  hypothetical protein  28.24 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2797  acetyltransferase  28.76 
 
 
180 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00286655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2497  acetyltransferase  26.25 
 
 
180 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000399882  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0724  acetyltransferase  26.14 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.268912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2818  acetyltransferase, GNAT family  27.56 
 
 
180 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0553675  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3786  hypothetical protein  31.46 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0312  GCN5-related N-acetyltransferase  29.1 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.648752  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0020  hypothetical protein  31.46 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>