More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2325 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 179 aa  358  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  76.27 
 
 		 178 aa  293  9e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  76.84 
 
 		 178 aa  292  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  76.27 
 
 		 178 aa  290  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  70.95 
 
 		 179 aa  275  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  73.71 
 
 		 187 aa  273  8e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  71.35 
 
 		 179 aa  271  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  60.34 
 
 		 181 aa  232  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  59.2 
 
 		 181 aa  231  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  59.2 
 
 		 181 aa  231  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  57.63 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  57.63 
 
 		 181 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  56.74 
 
 		 199 aa  225  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  59.52 
 
 		 180 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  60.47 
 
 		 175 aa  224  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  58.96 
 
 		 181 aa  224  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  58.19 
 
 		 181 aa  224  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  56.74 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  57.39 
 
 		 181 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  58.72 
 
 		 181 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  56.82 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  57.56 
 
 		 175 aa  218  3.9999999999999997e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  54.86 
 
 		 181 aa  217  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  55.23 
 
 		 181 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  55.62 
 
 		 179 aa  214  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  53.93 
 
 		 179 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  53.93 
 
 		 179 aa  209  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1540  adenine phosphoribosyltransferase  61.27 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1489  adenine phosphoribosyltransferase  61.27 
 
 		 181 aa  209  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3201  adenine phosphoribosyltransferase  59.62 
 
 		 157 aa  208  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.706653  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1626  adenine phosphoribosyltransferase  60.12 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0996441  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  54.07 
 
 		 186 aa  204  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  55.75 
 
 		 177 aa  203  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  55.43 
 
 		 177 aa  201  4e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  51.74 
 
 		 190 aa  200  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  53.98 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  53.98 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  53.98 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  53.98 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0935  adenine phosphoribosyltransferase  56.4 
 
 		 175 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  53.98 
 
 		 184 aa  197  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 		 197 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 202 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0417  adenine phosphoribosyltransferase  49.14 
 
 		 231 aa  195  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.572449  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 		 173 aa  195  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 		 187 aa  195  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 		 187 aa  195  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  49.44 
 
 		 184 aa  195  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 205 aa  194  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 		 187 aa  194  5.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  49.44 
 
 		 184 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  52.27 
 
 		 181 aa  194  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  54.65 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  48.89 
 
 		 184 aa  194  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 		 202 aa  193  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 180 aa  193  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  52.35 
 
 		 170 aa  193  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  52.27 
 
 		 183 aa  193  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  52.27 
 
 		 183 aa  193  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  52.27 
 
 		 183 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 		 183 aa  192  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  49.44 
 
 		 194 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2383  adenine phosphoribosyltransferase  56.98 
 
 		 176 aa  191  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 		 181 aa  191  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  51.14 
 
 		 181 aa  190  9e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  51.7 
 
 		 181 aa  190  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  52.27 
 
 		 181 aa  190  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 		 181 aa  190  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 		 181 aa  190  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  47.75 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  51.41 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 		 182 aa  188  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  51.16 
 
 		 182 aa  188  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  51.74 
 
 		 198 aa  187  9e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  50.58 
 
 		 177 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 		 183 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 		 183 aa  184  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 		 183 aa  184  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 		 183 aa  184  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 		 183 aa  184  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 		 183 aa  184  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  56.05 
 
 		 171 aa  185  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 		 183 aa  184  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 		 183 aa  184  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  52.33 
 
 		 183 aa  184  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  47.16 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6114  adenine phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 		 188 aa  182  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 183 aa  181  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 		 172 aa  181  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  53.49 
 
 		 172 aa  181  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0531  adenine phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0784653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 		 174 aa  181  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 		 171 aa  180  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2795  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 		 188 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2170  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2784  adenine phosphoribosyltransferase  48.21 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  48 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>