More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2305 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2397  phosphoglucosamine mutase  73.32 
 
 
447 aa  639    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.793208  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1863  phosphoglucosamine mutase  74.1 
 
 
447 aa  659    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2725  phosphoglucosamine mutase  74.55 
 
 
447 aa  657    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.949023  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2305  phosphoglucosamine mutase  100 
 
 
447 aa  899    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0512  phosphoglucosamine mutase  74.32 
 
 
447 aa  661    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0649  phosphoglucosamine mutase  74.32 
 
 
447 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.19519 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  74.32 
 
 
447 aa  674    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  64.8 
 
 
444 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4597  phosphoglucosamine mutase  61.57 
 
 
448 aa  559  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  62.39 
 
 
445 aa  552  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  60.05 
 
 
450 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2622  phosphoglucosamine mutase  60.9 
 
 
451 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.412287  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  59.59 
 
 
450 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  62.16 
 
 
466 aa  549  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3166  phosphoglucosamine mutase  60.91 
 
 
465 aa  550  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  59.38 
 
 
451 aa  546  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0081  phosphoglucosamine mutase  62.61 
 
 
445 aa  545  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.494438  normal  0.513534 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  60.05 
 
 
450 aa  545  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  60.22 
 
 
459 aa  547  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  59.38 
 
 
451 aa  546  1e-154  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1100  phosphoglucosamine mutase  61.42 
 
 
452 aa  543  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.445304  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0817  phosphoglucosamine mutase  62.64 
 
 
456 aa  536  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0832094  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4838  phosphoglucosamine mutase  62.7 
 
 
446 aa  536  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530312  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2973  phosphoglucosamine mutase  58.92 
 
 
448 aa  535  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5384  phosphoglucosamine mutase  63.19 
 
 
446 aa  537  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5306  phosphoglucosamine mutase  62.7 
 
 
446 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.462537  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1817  phosphoglucosamine mutase  60.05 
 
 
449 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1307  phosphoglucosamine mutase  60.05 
 
 
450 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.537701  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4113  phosphoglucosamine mutase  59.82 
 
 
450 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0304964  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1114  phosphoglucosamine mutase  59.14 
 
 
448 aa  531  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1205  phosphoglucosamine mutase  59.87 
 
 
452 aa  530  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.713344  normal  0.913107 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2131  phosphoglucosamine mutase  60.14 
 
 
448 aa  531  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361612  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  60.27 
 
 
449 aa  531  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3067  phosphoglucosamine mutase  62 
 
 
446 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4337  phosphoglucosamine mutase  61.29 
 
 
447 aa  527  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163728  normal  0.0707849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4549  phosphoglucosamine mutase  62 
 
 
446 aa  524  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4798  phosphoglucosamine mutase  58.92 
 
 
450 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624556  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3914  phosphoglucosamine mutase  60.09 
 
 
450 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3635  phosphoglucosamine mutase  57.49 
 
 
451 aa  512  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0777  phosphoglucosamine mutase  56.25 
 
 
449 aa  502  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0601478 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  55.63 
 
 
450 aa  503  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  54.52 
 
 
452 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  53.83 
 
 
454 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  54.24 
 
 
483 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  54.06 
 
 
451 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  54.69 
 
 
496 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2368  phosphoglucosamine mutase  54.69 
 
 
496 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.529976  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  54.61 
 
 
450 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  52.35 
 
 
454 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  53.02 
 
 
460 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  53.02 
 
 
449 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  54.82 
 
 
450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  54.61 
 
 
450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  52.35 
 
 
454 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  54.78 
 
 
450 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0956  phosphoglucosamine mutase  51.46 
 
 
445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0280063  normal  0.292928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  51.45 
 
 
451 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  50.9 
 
 
453 aa  448  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  52.7 
 
 
469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1499  phosphoglucosamine mutase  54.55 
 
 
458 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1713  phosphoglucosamine mutase  53.15 
 
 
450 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2832  phosphoglucosamine mutase  51.41 
 
 
443 aa  432  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0011182  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3566  phosphoglucosamine mutase  51.64 
 
 
445 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0054919  hitchhiker  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1022  phosphoglucosamine mutase  50.8 
 
 
448 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00540573  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1573  phosphoglucosamine mutase  48.09 
 
 
447 aa  429  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126154  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3394  phosphoglucosamine mutase  51.17 
 
 
443 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000763461  hitchhiker  0.000140936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4495  phosphoglucosamine mutase  50.12 
 
 
447 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.235157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4185  phosphoglucosamine mutase  49.88 
 
 
447 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1086  phosphoglucosamine mutase  50.34 
 
 
445 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00718811  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0985  phosphoglucosamine mutase  51.69 
 
 
445 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000240064  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3065  phosphoglucosamine mutase  49.77 
 
 
445 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1002  phosphoglucosamine mutase  50 
 
 
445 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0206827  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1021  phosphoglucosamine mutase  50.34 
 
 
445 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107828  hitchhiker  0.000573147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1025  phosphoglucosamine mutase  50.11 
 
 
445 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0055133  hitchhiker  0.0000634577 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1123  phosphoglucosamine mutase  50.94 
 
 
445 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000138646  unclonable  0.0000000000053894 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1199  phosphoglucosamine mutase  49.89 
 
 
445 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3422  phosphoglucosamine mutase  49.44 
 
 
445 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000143803  decreased coverage  0.000132803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5469  phosphoglucosamine mutase  49.77 
 
 
445 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3244  phosphoglucosamine mutase  49.44 
 
 
445 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000220965  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3604  phosphoglucosamine mutase  51.29 
 
 
454 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  hitchhiker  0.000672034 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2839  phosphoglucosamine mutase  49.66 
 
 
445 aa  414  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000184945  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62840  phosphoglucosamine mutase  50 
 
 
445 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3285  phosphoglucosamine mutase  50.94 
 
 
445 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526752  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4716  phosphoglucosamine mutase  48.24 
 
 
446 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4582  phosphoglucosamine mutase  48.24 
 
 
446 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.922342  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1768  phosphoglucosamine mutase  50.78 
 
 
455 aa  411  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3610  phosphoglucosamine mutase  47.64 
 
 
445 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00189073  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0730  phosphoglucosamine mutase  47.86 
 
 
444 aa  410  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1398  phosphoglucosamine mutase  47.67 
 
 
450 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.033665 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1504  phosphoglucosamine mutase  46.74 
 
 
446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2840  phosphoglucosamine mutase  48.7 
 
 
455 aa  408  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2709  phosphoglucosamine mutase  48.7 
 
 
455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3469  phosphoglucosamine mutase  48.42 
 
 
445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1333  phosphoglucosamine mutase  47.67 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.951592  hitchhiker  0.00110502 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1438  phosphoglucosamine mutase  46.74 
 
 
446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.628979  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0716  phosphoglucosamine mutase  47.54 
 
 
446 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.149315 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1847  phosphoglucosamine mutase  48.2 
 
 
447 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.310353  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3449  phosphoglucosamine mutase  45.84 
 
 
445 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2718  phosphoglucosamine mutase  49.31 
 
 
446 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.286925  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3079  phosphoglucosamine mutase  49.55 
 
 
453 aa  402  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.7667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>