240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2269 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2269  lipolytic enzyme, G-D-S-L  100 
 
 		 225 aa  450  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00077116  normal  0.478679 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2677  lipolytic protein  56.12 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0490394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3286  GDSL family lipase  53.3 
 
 		 208 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3601  GDSL family lipase  53.3 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.105176  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3955  hypothetical protein  52.08 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0133158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3685  lipolytic enzyme, G-D-S-L  47.06 
 
 		 228 aa  184  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3073  GDSL family lipase  41.82 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4054  lipolytic protein G-D-S-L family  41.55 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3650  lipolytic protein  45.77 
 
 		 201 aa  161  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1759  GDSL family lipase  44.1 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.740812  normal  0.107758 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3350  lipolytic enzyme, G-D-S-L  44.27 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  42.36 
 
 		 210 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0190  lipolytic protein G-D-S-L family  43.52 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00452588  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3731  lipolytic protein G-D-S-L family  39.45 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  47.89 
 
 		 240 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2220  lipolytic protein G-D-S-L family  45.05 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  42.11 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.09 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3994  GDSL family lipase  41.63 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1392  GDSL family lipase  42.33 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4363  lipolytic protein G-D-S-L family  41.63 
 
 		 216 aa  149  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4178  esterase  40.69 
 
 		 255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0335834  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  42.05 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0085  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  38 
 
 		 241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.68478  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0083  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  38 
 
 		 241 aa  144  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0097  GDSL family lipase  37.5 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.221693  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1776  lipolytic protein G-D-S-L family  37.91 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4475  lipolytic protein G-D-S-L family  40.1 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5471  GDSL family lipase  42.71 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1673  lipolytic protein G-D-S-L family  40.43 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0516704  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1921  lipolytic protein G-D-S-L family  39.2 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0548  lipolytic enzyme, G-D-S-L  42.05 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.386484  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0532  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.68 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.245304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3020  GDSL family lipase  43.55 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242695 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1014  GDSL family lipase  40.41 
 
 		 255 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0520  GDSL family lipase  41.27 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0831  GDSL family lipase  40.48 
 
 		 248 aa  135  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.386587  normal  0.0593626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0429  arylesterase  40.93 
 
 		 202 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0540  lipolytic protein G-D-S-L family  40.95 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621057  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1603  lipolytic protein G-D-S-L family  43.01 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2271  GDSL family lipase  43.01 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  41.5 
 
 		 204 aa  132  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  39.79 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926755 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1931  lipolytic protein G-D-S-L family  39.69 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.403169 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  40.96 
 
 		 184 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  41.4 
 
 		 201 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2205  Arylesterase  40.64 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1912  Arylesterase  40.7 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  41.71 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  41.54 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  43.37 
 
 		 201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  41.54 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  42.11 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  40.32 
 
 		 201 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  41.18 
 
 		 205 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  39.51 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  41.54 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  41.54 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  41.54 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  41.54 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  40.62 
 
 		 224 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  39.89 
 
 		 201 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  43.86 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  40.74 
 
 		 216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  38.55 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  39.02 
 
 		 222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  45.06 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2289  arylesterase  40.2 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.85039  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  39.89 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  39.66 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  43.98 
 
 		 201 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1973  arylesterase  40.82 
 
 		 208 aa  125  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1017  lysophospholipase  39.9 
 
 		 214 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2298  acyl-CoA thioesterase I  41.44 
 
 		 201 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.014502  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.89 
 
 		 184 aa  124  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27160  acyl-CoA thioesterase I precursor  41.44 
 
 		 201 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3805  GDSL family lipase  40.31 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2068  arylesterase  38.71 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.05326  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2424  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.53 
 
 		 178 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  38.17 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2318  GDSL family lipase  43.37 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0286486  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2415  lipase/acylhydrolase, putative  38.64 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.30697  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1815  acyl-CoA thioesterase I precursor  37.96 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  39.25 
 
 		 201 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1888  GDSL family lipase  41.21 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.172385  normal  0.431638 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2207  arylesterase  34.12 
 
 		 209 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.547508 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2688  arylesterase  39.79 
 
 		 199 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1068  Arylesterase  36.84 
 
 		 255 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2568  arylesterase  40.24 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1152  lipolytic enzyme, G-D-S-L  43.93 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.398188  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5710  lipolytic protein G-D-S-L family  40 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  36.89 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3031  arylesterase  42.47 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0119221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  38.89 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1250  arylesterase  36.59 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2914  arylesterase  38.5 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2709  arylesterase  39.49 
 
 		 216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0700  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.76 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.948885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1881  lipolytic protein  40 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  36.46 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>