More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2245 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  100 
 
 
220 aa  447  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  47.89 
 
 
214 aa  230  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3224  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.88 
 
 
208 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.395203  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.5 
 
 
209 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1162  glutathione S-transferase family protein  57 
 
 
209 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.72 
 
 
205 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.38 
 
 
207 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1196  glutathione S-transferase domain-containing protein  57 
 
 
209 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  56.16 
 
 
300 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  56.16 
 
 
266 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.95 
 
 
221 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1106  Glutathione S-transferase domain  52.74 
 
 
203 aa  218  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  56.16 
 
 
214 aa  218  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  56.16 
 
 
214 aa  218  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  55.35 
 
 
219 aa  217  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  53.47 
 
 
203 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  56.16 
 
 
217 aa  216  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  55.67 
 
 
297 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.73 
 
 
205 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  53.47 
 
 
203 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4051  putative glutathione S-transferase  54.29 
 
 
223 aa  215  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  55.67 
 
 
214 aa  214  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  55 
 
 
214 aa  214  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  56.44 
 
 
227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.72 
 
 
203 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.47 
 
 
205 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  54 
 
 
214 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  52.71 
 
 
225 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  54 
 
 
214 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  54 
 
 
214 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  56.06 
 
 
206 aa  209  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.54 
 
 
214 aa  208  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.54 
 
 
214 aa  207  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  52.48 
 
 
203 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5568  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.48 
 
 
205 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  50 
 
 
205 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.63 
 
 
208 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0925  putative glutathione S-transferase  50 
 
 
203 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324873  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  52.15 
 
 
208 aa  199  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  53.47 
 
 
208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.25 
 
 
227 aa  195  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  48.54 
 
 
213 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4729  glutathione S-transferase  51.24 
 
 
203 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0556098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  50.75 
 
 
207 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.32 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  44.78 
 
 
206 aa  177  9e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1904  Glutathione S-transferase domain protein  46.19 
 
 
199 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142458  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3947  Glutathione S-transferase domain protein  45.15 
 
 
207 aa  167  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.07 
 
 
205 aa  167  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  41.54 
 
 
200 aa  155  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0462  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.33 
 
 
205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  39.7 
 
 
198 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3285  putative glutathione S-transferase  39.5 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.549218  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5869  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.68 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1708  Glutathione S-transferase domain  38.07 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  39.2 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  35.15 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.27 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.61 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1704  Glutathione S-transferase domain protein  35.78 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0690203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1429  glutathione S-transferase domain-containing protein  39 
 
 
200 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114439  normal  0.299107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  33.01 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  31.53 
 
 
199 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  37.31 
 
 
220 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  36.1 
 
 
204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  37.5 
 
 
200 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.5 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6467  Glutathione S-transferase domain protein  36.76 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  35 
 
 
200 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  37 
 
 
200 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  34.5 
 
 
200 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5423  Gst12 glutathione-S-transferase  31.4 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  33.5 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  36.87 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  32.21 
 
 
204 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  32.81 
 
 
201 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  33.5 
 
 
200 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4794  Glutathione S-transferase domain  34.69 
 
 
197 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.915466  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3700  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.66 
 
 
202 aa  105  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 
204 aa  105  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0503  Glutathione S-transferase domain protein  31.34 
 
 
208 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  35.15 
 
 
208 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1240  Glutathione S-transferase domain  30.88 
 
 
213 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.124818 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  31.77 
 
 
201 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2349  glutathione S-transferase-like protein  34.34 
 
 
208 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0771783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  32.66 
 
 
203 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  34.78 
 
 
256 aa  102  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  33.82 
 
 
216 aa  101  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  33.5 
 
 
207 aa  101  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.65 
 
 
198 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2073  Glutathione S-transferase domain  31.1 
 
 
213 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0456347 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  31.79 
 
 
198 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  30.35 
 
 
203 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1311  glutathione S-transferase-like protein  34.22 
 
 
196 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55458  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  33.97 
 
 
204 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  35.12 
 
 
217 aa  98.6  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0134  Glutathione S-transferase domain protein  34.64 
 
 
209 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  31.22 
 
 
216 aa  97.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  33.66 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.44 
 
 
203 aa  96.3  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>