More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2137 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2137  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  296  7e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.435583  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2680  protein of unknown function UPF0047  64.23 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.686166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2940  protein of unknown function UPF0047  62.04 
 
 		 140 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2219  hypothetical protein  58.99 
 
 		 140 aa  187  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.334245  normal  0.457573 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3095  hypothetical protein  63.2 
 
 		 126 aa  184  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0121064  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1467  hypothetical protein  61.59 
 
 		 144 aa  184  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2258  hypothetical protein  60.87 
 
 		 139 aa  181  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.479021 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2128  hypothetical protein  61.83 
 
 		 140 aa  176  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.594367  normal  0.370679 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4069  hypothetical protein  57.14 
 
 		 141 aa  173  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.491688  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2851  protein of unknown function UPF0047  56.69 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2118  protein of unknown function UPF0047  54.81 
 
 		 139 aa  153  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0643  protein of unknown function UPF0047  55.73 
 
 		 142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5144  hypothetical protein  57.25 
 
 		 139 aa  151  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1587  hypothetical protein  54.14 
 
 		 139 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.185989  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0099  hypothetical protein  54.14 
 
 		 139 aa  148  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0131  hypothetical protein  54.14 
 
 		 139 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0104  hypothetical protein  54.14 
 
 		 139 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0627  hypothetical protein  51.03 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  decreased coverage  0.00428994 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1762  hypothetical protein  53.85 
 
 		 142 aa  147  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3301  hypothetical protein  56.49 
 
 		 139 aa  146  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0121064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1542  protein of unknown function UPF0047  50.68 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5282  protein of unknown function UPF0047  54.14 
 
 		 139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4149  hypothetical protein  54.2 
 
 		 139 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  54.2 
 
 		 139 aa  145  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4801  hypothetical protein  54.2 
 
 		 139 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639835  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3367  hypothetical protein  54.2 
 
 		 139 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00750068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  49.29 
 
 		 138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  49.29 
 
 		 138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3983  hypothetical protein  51.85 
 
 		 139 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000552293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1335  hypothetical protein  52.63 
 
 		 140 aa  144  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970106  decreased coverage  0.00476745 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2889  hypothetical protein  54.2 
 
 		 139 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1124  hypothetical protein  50.38 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1302  protein of unknown function UPF0047  45.32 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4874  hypothetical protein  48.91 
 
 		 137 aa  137  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903926  hitchhiker  0.00000135956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  48.18 
 
 		 138 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0081  protein of unknown function UPF0047  50.38 
 
 		 139 aa  136  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0686334  normal  0.0165253 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4457  hypothetical protein  45.26 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  49.61 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  45.65 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  47.45 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0078  hypothetical protein  45.45 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0632  hypothetical protein  42.96 
 
 		 139 aa  130  6.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  49.23 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  49.62 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  44.53 
 
 		 137 aa  128  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  49.22 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1102  hypothetical protein  44.12 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  47.33 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  43.7 
 
 		 139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6559  protein of unknown function UPF0047  47.29 
 
 		 143 aa  126  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552252  normal  0.186603 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  45.93 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  46.56 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  45.19 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  46.56 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05561  hypothetical protein  43.07 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0889  protein of unknown function UPF0047  45.04 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4360  hypothetical protein  44.44 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0742  conserved hypothetical protein TIGR00149  45.04 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1688  hypothetical protein  45.86 
 
 		 195 aa  120  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  45.97 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0674  hypothetical protein  45.86 
 
 		 205 aa  119  9e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.798458  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  43.07 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1665  hypothetical protein  43.8 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0725  protein of unknown function UPF0047  44.93 
 
 		 141 aa  118  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1293  hypothetical protein  43.28 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2650  hypothetical protein  45.99 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  46.03 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1152  protein of unknown function UPF0047  43.28 
 
 		 139 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  hitchhiker  0.00000047058 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1264  hypothetical cytosolic protein  39.71 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08050  UPF0047 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G02090)  42.22 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.823848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  41.3 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1691  hypothetical protein  41.79 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00156174  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2246  protein of unknown function UPF0047  44.12 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  41.91 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04921  hypothetical protein  37.68 
 
 		 212 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0925424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  42.34 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1322  hypothetical protein  39.85 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  44.44 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1889  protein of unknown function UPF0047  46.72 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2351  hypothetical protein  44.93 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0140381  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49270  predicted protein  40 
 
 		 154 aa  113  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0188  hypothetical protein  43.07 
 
 		 141 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  46.4 
 
 		 157 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5504  hypothetical protein  42.03 
 
 		 141 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387087  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0219  hypothetical protein  42.34 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  40.3 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  44.44 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47770  hypothetical protein  43.48 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32835  conserved hypothetical protein  40.71 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.805601  normal  0.755477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1039  protein of unknown function UPF0047  43.7 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0261  hypothetical protein  42.75 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05191  hypothetical protein  41.18 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0327196  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0493  hypothetical protein  39.71 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  43.28 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.46172 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03928  hypothetical protein  43.07 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3936  protein of unknown function UPF0047  43.07 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4518  hypothetical protein  43.07 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03888  hypothetical protein  43.07 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.143638  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5559  conserved hypothetical protein TIGR00149  43.07 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.484103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3971  hypothetical protein  43.07 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.147621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>