More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2124 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2124  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 516 aa  1072    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  56.46 
 
 		 524 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  54.16 
 
 		 526 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  53.58 
 
 		 532 aa  526  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  54.24 
 
 		 526 aa  502  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  49.4 
 
 		 529 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  54.88 
 
 		 662 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  53.25 
 
 		 662 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  56.17 
 
 		 738 aa  272  9e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  51.48 
 
 		 561 aa  269  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  48.86 
 
 		 465 aa  253  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  50.67 
 
 		 479 aa  252  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  48.13 
 
 		 446 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  48.31 
 
 		 462 aa  249  9e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  50.41 
 
 		 463 aa  247  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  42.32 
 
 		 460 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1662  adenylate/guanylate cyclase  42.65 
 
 		 472 aa  184  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.491568  hitchhiker  0.000617786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  35.79 
 
 		 665 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  39.71 
 
 		 528 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.68 
 
 		 758 aa  147  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  39.22 
 
 		 672 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.58 
 
 		 611 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  37.38 
 
 		 864 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  44.17 
 
 		 694 aa  144  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.73 
 
 		 656 aa  144  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  37.9 
 
 		 1180 aa  144  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  38.79 
 
 		 1156 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  36.89 
 
 		 822 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  37.04 
 
 		 702 aa  139  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  38.79 
 
 		 936 aa  138  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.54 
 
 		 879 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  38.66 
 
 		 734 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  41.18 
 
 		 656 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  33.87 
 
 		 746 aa  138  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.5 
 
 		 658 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  36.22 
 
 		 636 aa  137  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  33.48 
 
 		 518 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  34.88 
 
 		 696 aa  136  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  37.79 
 
 		 859 aa  136  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  38.74 
 
 		 729 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  40.66 
 
 		 657 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  37.04 
 
 		 1172 aa  134  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  37.63 
 
 		 614 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  34.82 
 
 		 861 aa  134  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  36.89 
 
 		 546 aa  133  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  32.27 
 
 		 584 aa  133  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  34.22 
 
 		 1093 aa  132  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  40.65 
 
 		 761 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  31.87 
 
 		 584 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  41.15 
 
 		 752 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2387  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.19 
 
 		 604 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  33.09 
 
 		 667 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  35.91 
 
 		 513 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  37.09 
 
 		 518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.25 
 
 		 757 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  31.14 
 
 		 431 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.55 
 
 		 737 aa  128  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  34.25 
 
 		 860 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  39.39 
 
 		 638 aa  127  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  31.14 
 
 		 441 aa  126  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  34.82 
 
 		 717 aa  126  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3040  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.84 
 
 		 815 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  30.4 
 
 		 744 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  33.65 
 
 		 817 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  40.11 
 
 		 696 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  37.02 
 
 		 607 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.15 
 
 		 678 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  31.96 
 
 		 1207 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  28.83 
 
 		 735 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  36.62 
 
 		 515 aa  124  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.84 
 
 		 858 aa  123  9e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  33.18 
 
 		 701 aa  123  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  35.81 
 
 		 546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  38.24 
 
 		 741 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  31.6 
 
 		 403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6425  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.89 
 
 		 588 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  41.82 
 
 		 701 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  35.84 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  32.26 
 
 		 911 aa  121  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  32.71 
 
 		 701 aa  120  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.84 
 
 		 758 aa  120  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  36.19 
 
 		 794 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  36.12 
 
 		 744 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 		 536 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  37.5 
 
 		 971 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  32.33 
 
 		 591 aa  117  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  35.29 
 
 		 483 aa  116  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  34.76 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 		 712 aa  116  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  32.35 
 
 		 1020 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.12 
 
 		 577 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  34.97 
 
 		 681 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  36.56 
 
 		 651 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  37.77 
 
 		 903 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  33.65 
 
 		 713 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  33.48 
 
 		 699 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  34.72 
 
 		 645 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  35.48 
 
 		 641 aa  114  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  35.37 
 
 		 284 aa  114  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.86 
 
 		 465 aa  113  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>