97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2090 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2090  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  508  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2938  conserved hypohtetical protein  65.06 
 
 		 256 aa  338  5e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406539  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0970  hypothetical protein  60.08 
 
 		 262 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2295  hypothetical protein  60.08 
 
 		 262 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2205  hypothetical protein  58.7 
 
 		 262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1043  hypothetical protein  56.73 
 
 		 253 aa  297  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3814  methyltransferase type 11  59.18 
 
 		 260 aa  292  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1579  methyltransferase type 11  43.38 
 
 		 252 aa  178  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0374  hypothetical protein  42.01 
 
 		 246 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0509  methyltransferase type 11  43.12 
 
 		 257 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0467  hypothetical protein  41.55 
 
 		 246 aa  175  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  41.74 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7608  hypothetical protein  41.47 
 
 		 255 aa  171  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000430811  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  39.91 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0613  Methyltransferase type 11  42.66 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  42.92 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  42.92 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  42.92 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  40.91 
 
 		 257 aa  168  9e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  40.34 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  40 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  36.48 
 
 		 259 aa  165  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  35.92 
 
 		 259 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  38.96 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  39.92 
 
 		 258 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  39.09 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3269  hypothetical protein  38.62 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  40.83 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  42.36 
 
 		 277 aa  159  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 250 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  40.18 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  40.64 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2018  methyltransferase type 11  39.82 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  38.36 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  35.05 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  35.02 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2380  methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.311987 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3063  hypothetical protein  33.48 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000585579  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  28.74 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29610  hypothetical protein  28.21 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  26.75 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  26.58 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  27.47 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  27.47 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  27.47 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  27.47 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  27.47 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  27.47 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  27.47 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  26.44 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  28.29 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  31.72 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  25.82 
 
 		 270 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  28.77 
 
 		 259 aa  52  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1762  hypothetical protein  27.89 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.479103  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 274 aa  52  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  25.82 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2290  hypothetical protein  26.79 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.272643  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1463  hypothetical protein  26.32 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0975839  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  28.67 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  25.52 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3468  hypothetical protein  28 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3482  hypothetical protein  27.46 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  25.52 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  25.52 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3713  hypothetical protein  26.98 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  25.52 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 272 aa  49.3  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  27.27 
 
 		 278 aa  49.3  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2065  hypothetical protein  30.14 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.13247  normal  0.0779555 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41070  hypothetical protein  27.46 
 
 		 253 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  29.41 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1722  hypothetical protein  26.96 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  27.65 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3715  hypothetical protein  26.96 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944001  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4143  hypothetical protein  26.96 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1703  SAM-dependent methyltransferase  24.11 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112357  normal  0.713631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2185  hypothetical protein  26.61 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  30.3 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  25.69 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 272 aa  45.4  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  30.4 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  28.4 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1535  methyltransferase type 11  26.11 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11733  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  22.15 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  22.15 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  26.59 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1830  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 281 aa  42.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>