98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1966 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  100 
 
 
223 aa  434  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0879  thiamine pyrophosphokinase  54.22 
 
 
234 aa  222  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0363  hypothetical protein  51.58 
 
 
232 aa  208  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2007  thiamine pyrophosphokinase  51.58 
 
 
232 aa  208  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0983974  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0605  thiamine pyrophosphokinase  50.72 
 
 
211 aa  178  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681659  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3176  thiamine pyrophosphokinase  43.33 
 
 
231 aa  161  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2739  putative thiamine pyrophosphokinase  40.28 
 
 
229 aa  144  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.641586  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  26.67 
 
 
205 aa  71.6  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0627  thiamine pyrophosphokinase  29.81 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1795  thiamine pyrophosphokinase  28.8 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000771119  normal  0.210862 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0577  thiamine pyrophosphokinase  28.92 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2104  thiamine pyrophosphokinase  29.47 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2799  thiamine pyrophosphokinase  28.71 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1746  thiamine pyrophosphokinase  26.24 
 
 
211 aa  62.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511676  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4449  thiamine pyrophosphokinase  28.23 
 
 
221 aa  62.4  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359554  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0683  thiamine pyrophosphokinase  31.75 
 
 
212 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2175  thiamine pyrophosphokinase  26.7 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.227177  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  26.97 
 
 
209 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  31.22 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1225  thiamine pyrophosphokinase  28.27 
 
 
230 aa  59.7  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1262  thiamine pyrophosphokinase  28.43 
 
 
219 aa  58.5  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.208483  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1897  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  27.84 
 
 
225 aa  58.5  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.327287 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0036  thiamine pyrophosphokinase  24.72 
 
 
203 aa  58.5  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000794456  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08960  thiamine pyrophosphokinase  33.69 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000037051 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1805  thiamine pyrophosphokinase  27.03 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.219265  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1988  thiamine pyrophosphokinase  27.15 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3682  thiamine pyrophosphokinase  27.97 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000180795  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  25.59 
 
 
211 aa  55.5  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2564  hypothetical protein  30 
 
 
217 aa  55.1  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  24.86 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  32.8 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2418  hypothetical protein  30 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3202  thiamine pyrophosphokinase  28.77 
 
 
213 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3958  thiamine pyrophosphokinase  30.08 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00188574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1285  thiamine pyrophosphokinase  30.08 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000567984  hitchhiker  0.0000616024 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2483  thiamine pyrophosphokinase  26.7 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2676  thiamine pyrophosphokinase  31.09 
 
 
217 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09380  thiamine pyrophosphokinase  28.89 
 
 
222 aa  52.4  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1694  thiamin pyrophosphokinase catalytic subunit  27.94 
 
 
297 aa  52  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.391798  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  28.57 
 
 
454 aa  51.6  0.000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_004310  BR1756  hypothetical protein  27.94 
 
 
218 aa  51.6  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.416332  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  47.73 
 
 
404 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1143  thiamine pyrophosphokinase  28.79 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0929  thiamine pyrophosphokinase  29.82 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10040  thiamine pyrophosphokinase  26.55 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  40.58 
 
 
371 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  47.73 
 
 
382 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2073  thiamine pyrophosphokinase  28.72 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.852638  hitchhiker  0.00000141899 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0128  thiamine pyrophosphokinase  27.06 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1363  thiamine pyrophosphokinase  25.51 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3907  thiamine pyrophosphokinase  28.57 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000037625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2511  thiamine pyrophosphokinase  26.49 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_5423  predicted protein  28.21 
 
 
226 aa  49.7  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2042  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  32.91 
 
 
373 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.978362  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  24.86 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3873  thiamine pyrophosphokinase  28.57 
 
 
213 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54961e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3710  hypothetical protein  28.57 
 
 
213 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607891  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3600  thiamine pyrophosphokinase  28.57 
 
 
213 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.86754e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3997  hypothetical protein  28.57 
 
 
213 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000013843  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3105  thiamine pyrophosphokinase  30.61 
 
 
220 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3618  thiamine pyrophosphokinase  28.57 
 
 
213 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000017674  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0906  thiamine pyrophosphokinase  28.41 
 
 
234 aa  48.9  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000103792  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0789  hypothetical protein  37.36 
 
 
211 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  43.48 
 
 
239 aa  48.5  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3901  hypothetical protein  28.57 
 
 
213 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000344688  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  39.29 
 
 
365 aa  48.5  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  45.65 
 
 
413 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3809  thiamine pyrophosphokinase  28.43 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0039  thiamine pyrophosphokinase  27.07 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000099633  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0039  thiamine pyrophosphokinase  27.07 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1614  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  42.86 
 
 
375 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1939  thiamine pyrophosphokinase  31.32 
 
 
212 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611863  normal  0.701767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  46.67 
 
 
373 aa  47  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0473  thiamine diphosphokinase  31.62 
 
 
272 aa  46.6  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  25 
 
 
203 aa  46.2  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156762  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  32.88 
 
 
399 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3146  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  43.48 
 
 
407 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0465351  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  45.65 
 
 
399 aa  46.2  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  43.48 
 
 
395 aa  45.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  43.48 
 
 
389 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  40 
 
 
395 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6055  membrane protein  39.13 
 
 
403 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501104  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  47.73 
 
 
372 aa  45.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2014  thiamine pyrophosphokinase  31.3 
 
 
211 aa  45.1  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3841  thiamine pyrophosphokinase  25.62 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000017039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4138  thiamine pyrophosphokinase  27.84 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0791  thiamine pyrophosphokinase  26.15 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1508  thiamine pyrophosphokinase  30.3 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3933  thiamine pyrophosphokinase  27.42 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1070  thiamine pyrophosphokinase  25.93 
 
 
215 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1088  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  40.91 
 
 
373 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.626516  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  43.48 
 
 
407 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5425  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  36.21 
 
 
398 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.519507 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1775  hypothetical protein  21.33 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  40.91 
 
 
396 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1960  thiamine pyrophosphokinase  30.63 
 
 
216 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  38.98 
 
 
390 aa  42  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1166  thiamine pyrophosphokinase  28.95 
 
 
216 aa  42  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>