More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1956 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  100 
 
 		 387 aa  769    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  69.6 
 
 		 382 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  67.15 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  66.57 
 
 		 393 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  66.38 
 
 		 394 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  60.06 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  60 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  41.12 
 
 		 383 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  41.62 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  41.34 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  43.06 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  43.52 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  41.96 
 
 		 407 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  40.41 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  40.92 
 
 		 382 aa  258  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  38.6 
 
 		 385 aa  257  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  40.52 
 
 		 376 aa  252  9.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  38.8 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  39.13 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  40.4 
 
 		 390 aa  250  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  41.14 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  43.69 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  39.82 
 
 		 362 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  38.81 
 
 		 385 aa  242  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  39.56 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  44.11 
 
 		 379 aa  233  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  35.16 
 
 		 405 aa  226  4e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  38.27 
 
 		 436 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  37.34 
 
 		 433 aa  223  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  37.2 
 
 		 395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  41.72 
 
 		 393 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  37.89 
 
 		 471 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  37.6 
 
 		 394 aa  219  7.999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  37.87 
 
 		 383 aa  216  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  36.69 
 
 		 379 aa  216  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  39.93 
 
 		 394 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0494  HflK protein  36.05 
 
 		 420 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  35.28 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  36.6 
 
 		 498 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  37.78 
 
 		 395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0537  HflK protein  35.59 
 
 		 418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.141396  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  30.79 
 
 		 503 aa  213  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  41.58 
 
 		 406 aa  212  7e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  36.08 
 
 		 451 aa  212  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  36.08 
 
 		 451 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  36.56 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  37.78 
 
 		 389 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  37.87 
 
 		 355 aa  210  4e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  36.17 
 
 		 447 aa  210  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  37.13 
 
 		 357 aa  209  7e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  36.68 
 
 		 477 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  36.24 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  37.46 
 
 		 456 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  36.34 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  34.11 
 
 		 386 aa  206  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  37.92 
 
 		 447 aa  206  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  32.87 
 
 		 344 aa  206  8e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  38.4 
 
 		 413 aa  206  8e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  34.86 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  38.71 
 
 		 333 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015812  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  37.46 
 
 		 475 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  39.86 
 
 		 399 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  32.66 
 
 		 452 aa  202  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  36.51 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  37.17 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00651  HflK complex with HflC  38.1 
 
 		 383 aa  201  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.763897  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  39.8 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  37.1 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  34.2 
 
 		 389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  37.63 
 
 		 464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  36.69 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  36.69 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4645  FtsH protease regulator HflK  37.59 
 
 		 419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14387 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04041  modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor  37.59 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.298849  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5690  FtsH protease regulator HflK  37.59 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  37.46 
 
 		 347 aa  197  3e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4732  FtsH protease regulator HflK  37.59 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.938149  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4416  FtsH protease regulator HflK  37.59 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953832  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3839  FtsH protease regulator HflK  37.59 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.910091  hitchhiker  0.000000232279 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04003  hypothetical protein  37.59 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4705  FtsH protease regulator HflK  37.59 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714132  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  35.75 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  35.75 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  36.1 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0487  HflK protein  31.68 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  34.44 
 
 		 360 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  36.42 
 
 		 395 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4724  FtsH protease regulator HflK  36.17 
 
 		 419 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4781  FtsH protease regulator HflK  36.17 
 
 		 419 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.932984  normal  0.393456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4631  FtsH protease regulator HflK  36.17 
 
 		 419 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4760  FtsH protease regulator HflK  36.3 
 
 		 419 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3980  HflK protein  37.59 
 
 		 382 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.758687  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4641  FtsH protease regulator HflK  36.17 
 
 		 419 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  37.15 
 
 		 401 aa  196  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  37.67 
 
 		 359 aa  196  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  37.58 
 
 		 387 aa  195  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  37.46 
 
 		 474 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3819  HflK protein  37.23 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0613795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  34.62 
 
 		 389 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  35.84 
 
 		 407 aa  192  6e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>