More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1910 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  100 
 
 
324 aa  647    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  57.99 
 
 
319 aa  349  3e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.36 
 
 
319 aa  340  2e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  58.62 
 
 
319 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  58.62 
 
 
319 aa  333  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  57.68 
 
 
319 aa  332  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  53.67 
 
 
322 aa  261  8.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  45.85 
 
 
325 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.42 
 
 
325 aa  252  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  44.27 
 
 
325 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  43.95 
 
 
325 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  45.28 
 
 
325 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  46.31 
 
 
325 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  45.97 
 
 
325 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  45.58 
 
 
325 aa  245  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  45.34 
 
 
326 aa  246  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.7 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  43.32 
 
 
325 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  46.28 
 
 
323 aa  236  6e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.42 
 
 
324 aa  235  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  44.01 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  42.81 
 
 
324 aa  231  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.59 
 
 
326 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  43 
 
 
324 aa  230  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  46.43 
 
 
326 aa  229  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.13 
 
 
326 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  45.13 
 
 
326 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.48 
 
 
325 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  44.13 
 
 
334 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.79 
 
 
324 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  46.43 
 
 
326 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.26 
 
 
326 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  46.43 
 
 
326 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.37 
 
 
324 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  43.37 
 
 
324 aa  222  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  43.93 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.34 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  44.81 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.92 
 
 
325 aa  219  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.41 
 
 
324 aa  219  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  45.3 
 
 
324 aa  218  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.59 
 
 
324 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.5 
 
 
324 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  45 
 
 
324 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  42.07 
 
 
324 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  44.63 
 
 
324 aa  217  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.08 
 
 
324 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.81 
 
 
324 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  40.99 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.04 
 
 
361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.41 
 
 
324 aa  212  7e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  43.21 
 
 
324 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  37.97 
 
 
333 aa  206  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  40.78 
 
 
324 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.04 
 
 
324 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
337 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.97 
 
 
325 aa  200  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.37 
 
 
324 aa  199  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.51 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  39.09 
 
 
322 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 
324 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1917  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.37 
 
 
336 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.820902  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  42.16 
 
 
325 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  42.28 
 
 
324 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  41.12 
 
 
324 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.72 
 
 
324 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  43.83 
 
 
324 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.45 
 
 
324 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  41.75 
 
 
331 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  40.98 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  39.2 
 
 
323 aa  188  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.18 
 
 
327 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.650426  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1251  NADPH quinone oxidoreductase, putative  40.81 
 
 
325 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158811  normal  0.0547149 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2478  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.95 
 
 
324 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46705  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  41.1 
 
 
329 aa  186  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2248  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.19 
 
 
324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.711128  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  42.38 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.61 
 
 
328 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.51 
 
 
329 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  36.36 
 
 
327 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  40.73 
 
 
325 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.86 
 
 
335 aa  179  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  39.17 
 
 
340 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.58 
 
 
335 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2406  alcohol dehydrogenase  38.7 
 
 
326 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4852  putative Zinc-dependent dehydrogenase  40.79 
 
 
336 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.249579  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3287  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.2 
 
 
327 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4910  alcohol dehydrogenase  38.71 
 
 
331 aa  175  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2911  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  39.14 
 
 
333 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0128316  hitchhiker  0.0057385 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  38.54 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.86 
 
 
327 aa  172  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5243  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36 
 
 
329 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244024  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  35.22 
 
 
328 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  35.55 
 
 
328 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.57 
 
 
322 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3810  alcohol dehydrogenase  40.46 
 
 
325 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.272499 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.95 
 
 
326 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3737  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.46 
 
 
325 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.392288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>