13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1825 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1825  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  384  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0697125  normal  0.518045 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3882  hypothetical protein  38.02 
 
 		 195 aa  124  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.116054 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3803  hypothetical protein  32.61 
 
 		 202 aa  94.7  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.9624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2769  hypothetical protein  41.18 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.878546 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2546  hypothetical protein  43.04 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2476  hypothetical protein  43.04 
 
 		 87 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610199  normal  0.0281385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2301  hypothetical protein  37.18 
 
 		 93 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0561  hypothetical protein  37.97 
 
 		 86 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00401695  hitchhiker  0.00987084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1183  hypothetical protein  35.9 
 
 		 93 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4197  hypothetical protein  36.14 
 
 		 95 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0280307  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0141  hypothetical protein  38.1 
 
 		 107 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2936  hypothetical protein  37.93 
 
 		 95 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0710  hypothetical protein  37.5 
 
 		 106 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>