More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1768 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  682    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  62.58 
 
 		 323 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  62.19 
 
 		 318 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  61.49 
 
 		 323 aa  352  5e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  59.44 
 
 		 329 aa  351  8.999999999999999e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  48.73 
 
 		 376 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  48.72 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  47.48 
 
 		 340 aa  272  7e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  45.67 
 
 		 388 aa  270  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  48.72 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  48.4 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  46.54 
 
 		 356 aa  239  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  46.13 
 
 		 313 aa  239  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  41.42 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  67.44 
 
 		 176 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  40.78 
 
 		 340 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  39.87 
 
 		 345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  54.67 
 
 		 242 aa  220  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  41.21 
 
 		 341 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  51.34 
 
 		 225 aa  219  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  58.79 
 
 		 243 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  40.89 
 
 		 341 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  39.16 
 
 		 340 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  40.97 
 
 		 338 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  40.32 
 
 		 453 aa  215  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  53.78 
 
 		 242 aa  215  9e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  40.65 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  41.86 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  41.1 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  48.65 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  49.78 
 
 		 233 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  40.97 
 
 		 343 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  40.97 
 
 		 343 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  42.27 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  51.14 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  42.81 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  37.82 
 
 		 319 aa  209  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  39.81 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  39.81 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  49.78 
 
 		 233 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  40.8 
 
 		 315 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  41.14 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  40.9 
 
 		 368 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1293  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  50.68 
 
 		 235 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126009  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  41.24 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  50.22 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  38.8 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  39.87 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  39.87 
 
 		 341 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  40.2 
 
 		 341 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  40.2 
 
 		 342 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  39.68 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  49.33 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  40.2 
 
 		 341 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  40.2 
 
 		 341 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  39.39 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  48.88 
 
 		 234 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  41.46 
 
 		 340 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  39.54 
 
 		 341 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  38.94 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  40.78 
 
 		 343 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  38.92 
 
 		 333 aa  196  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  38.85 
 
 		 357 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  48.43 
 
 		 230 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  48.4 
 
 		 230 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  37.86 
 
 		 386 aa  195  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  38.08 
 
 		 366 aa  195  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  40.31 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  39.36 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  39 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  39.26 
 
 		 334 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  40.37 
 
 		 357 aa  193  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  39.33 
 
 		 369 aa  192  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  39.33 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  39.33 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  39.33 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  55.43 
 
 		 228 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  39.61 
 
 		 334 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  55.81 
 
 		 228 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3469  xanthine dehydrogenase accessory factor  55.31 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  39.47 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  39.03 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  40.29 
 
 		 363 aa  185  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  36.54 
 
 		 390 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  40 
 
 		 389 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  45.98 
 
 		 242 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  39.33 
 
 		 360 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1482  xanthine dehydrogenase accessory factor  47.22 
 
 		 235 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0236654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  37.74 
 
 		 370 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0970  hypothetical protein  56.96 
 
 		 216 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  38.32 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  31.03 
 
 		 367 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  38.29 
 
 		 337 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  37.46 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  38.44 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  40.18 
 
 		 368 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6028  hypothetical protein  43.69 
 
 		 231 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  36.81 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  37.98 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  35.96 
 
 		 323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>