More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1750 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1750  ThiJ/PfpI  100 
 
 		 226 aa  448  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.45981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  53.57 
 
 		 224 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0640  ThiJ/PfpI domain-containing protein  57.78 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500929  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.15 
 
 		 242 aa  225  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50 
 
 		 224 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50 
 
 		 229 aa  222  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50 
 
 		 230 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  49.55 
 
 		 225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  51.79 
 
 		 225 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  51.77 
 
 		 226 aa  214  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2230  ThiJ/PfpI  50.45 
 
 		 225 aa  214  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.346275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  52.44 
 
 		 228 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.77 
 
 		 227 aa  211  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6825  ThiJ/PfpI domain protein  47.32 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.397498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  49.11 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  50.67 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  48.67 
 
 		 228 aa  208  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  49.55 
 
 		 246 aa  208  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  47.32 
 
 		 225 aa  207  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  49.11 
 
 		 227 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.67 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.34 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.35 
 
 		 228 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  46.88 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.32 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  47.32 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  47.32 
 
 		 267 aa  201  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  50.89 
 
 		 225 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  49.56 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  49.56 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5801  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.32 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  0.558329 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  47.32 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  49.56 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  49.56 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1352  ThiJ/PfpI domain protein  47.32 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  49.12 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  49.56 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  49.56 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  49.56 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  47.58 
 
 		 230 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  45.98 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  47.14 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02417  ThiJ/PfpI family protein  47.53 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.847717  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  48.23 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  48.2 
 
 		 225 aa  198  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  48.25 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  48.65 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4323  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.48 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.224439 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.09 
 
 		 230 aa  194  7e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.09 
 
 		 232 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.09 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  47.42 
 
 		 229 aa  193  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  44.64 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  46.02 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1386  ThiJ/PfpI  45.09 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.694621  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  44.64 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.64 
 
 		 230 aa  192  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4837  ThiJ/PfpI domain protein  49.11 
 
 		 227 aa  191  9e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  48.8 
 
 		 226 aa  191  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  45.54 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  45.7 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  45.78 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  47.85 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.95 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4396  ThiJ/PfpI domain protein  50.45 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.817185  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.44 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.09 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4094  ThiJ/PfpI  51.11 
 
 		 228 aa  184  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4272  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.11 
 
 		 228 aa  184  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.75 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  45.29 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  44.2 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  44.2 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3245  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.67 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433904  normal  0.585476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.73 
 
 		 229 aa  181  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.61 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  42.92 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1312  ThiJ/PfpI  43.11 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  39.29 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17365  predicted protein  46.64 
 
 		 234 aa  176  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0260674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  39.29 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  40.81 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  44.89 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  40.89 
 
 		 230 aa  162  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0944  ThiJ/PfpI family protein  38.07 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0627  thiJ/pfpI family protein  39.64 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  39.19 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  38.74 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  36.28 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4627  thiJ/pfpI family protein  39.19 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4383  thiJ/pfpI family protein  38.74 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4722  thiJ/pfpI family protein  38.74 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477028  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4593  thiJ/pfpI family protein  38.05 
 
 		 220 aa  154  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3087  ThiJ/PfpI domain protein  38.77 
 
 		 230 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00619766  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.38 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.84 
 
 		 232 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4578  thiJ/pfpI family protein  38.29 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  38.22 
 
 		 257 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4797  ThiJ/PfpI domain protein  36.61 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  hitchhiker  0.0019745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1710  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.09 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>