52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1622 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  76.2 
 
 		 435 aa  661    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  894    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  41.16 
 
 		 490 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  39.86 
 
 		 437 aa  277  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1645  putative phage-related protein  32.58 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2686  phage major capsid protein, HK97 family  27.41 
 
 		 466 aa  127  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3652  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  30.6 
 
 		 393 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  26.54 
 
 		 446 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  24.52 
 
 		 649 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  26.43 
 
 		 659 aa  100  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  26.32 
 
 		 659 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  24.74 
 
 		 645 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  24.74 
 
 		 645 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  24.74 
 
 		 645 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  23.64 
 
 		 661 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  23.64 
 
 		 661 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1640  hypothetical protein  25 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  24.84 
 
 		 646 aa  77.4  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0240  putative major head protein/prohead protease  24.58 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  22.54 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2954  phage major capsid protein, HK97  24.83 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.624972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2910  phage major capsid protein, HK97  24.83 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  24.21 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3078  phage major capsid protein, HK97  24.75 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  22.67 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  24.38 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  26.07 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  21.74 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  22.61 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  23.09 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0562  hypothetical protein  28.76 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.123092  hitchhiker  0.000000108718 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  23.18 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  23.38 
 
 		 409 aa  53.1  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  26.17 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  20.82 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  21.59 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  23.67 
 
 		 413 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  23.93 
 
 		 624 aa  49.7  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  23.93 
 
 		 624 aa  49.7  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2852  phage major capsid protein, HK97 family  25.74 
 
 		 466 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107077  normal  0.025439 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  22.75 
 
 		 386 aa  47.8  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  23.5 
 
 		 624 aa  47.4  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  25.21 
 
 		 781 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  28.46 
 
 		 514 aa  47  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7144  HK97 family phage major capsid protein  24.71 
 
 		 434 aa  47  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647338 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  22.55 
 
 		 400 aa  46.6  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  23.08 
 
 		 624 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  22.77 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  22.77 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  23.67 
 
 		 403 aa  44.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  27.06 
 
 		 385 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  21.58 
 
 		 337 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>