More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1599 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 303 aa  589  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1087  hemolysin-type calcium-binding region  45.77 
 
 		 195 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  41.78 
 
 		 260 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  46.2 
 
 		 202 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  46.2 
 
 		 202 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  40.36 
 
 		 2667 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  49.68 
 
 		 1164 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.82 
 
 		 1236 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  39.91 
 
 		 2885 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  50 
 
 		 421 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  46.45 
 
 		 709 aa  116  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  40.57 
 
 		 460 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50 
 
 		 588 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  52.8 
 
 		 485 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  44.23 
 
 		 813 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  44.58 
 
 		 219 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  43.37 
 
 		 219 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  43.09 
 
 		 2105 aa  109  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  37.05 
 
 		 1079 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  44.19 
 
 		 2775 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  43.6 
 
 		 1712 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  48.87 
 
 		 3619 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  48.12 
 
 		 3619 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.22 
 
 		 1795 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.9 
 
 		 3427 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  48.61 
 
 		 1175 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  39.91 
 
 		 757 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  53.12 
 
 		 2678 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  40.31 
 
 		 1895 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  45.68 
 
 		 1424 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  54.87 
 
 		 1963 aa  99.4  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.24 
 
 		 980 aa  99  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  37.88 
 
 		 686 aa  99  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  48.36 
 
 		 280 aa  99  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  37.1 
 
 		 606 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  47.54 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  48.09 
 
 		 686 aa  97.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  42.6 
 
 		 4687 aa  96.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  50.82 
 
 		 946 aa  96.3  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  40.76 
 
 		 1017 aa  95.9  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  43.57 
 
 		 867 aa  95.9  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  40.76 
 
 		 1022 aa  95.9  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  42.59 
 
 		 475 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  51.24 
 
 		 950 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  42.59 
 
 		 475 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  42.24 
 
 		 2329 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  52.34 
 
 		 556 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  46.38 
 
 		 795 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  52.34 
 
 		 518 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.31 
 
 		 1016 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  39.44 
 
 		 460 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  45.58 
 
 		 424 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.71 
 
 		 2668 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  44.27 
 
 		 4798 aa  93.6  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  33.9 
 
 		 385 aa  93.2  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  48.09 
 
 		 652 aa  92.8  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  37.57 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  46.03 
 
 		 572 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  46.67 
 
 		 982 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  49.18 
 
 		 639 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  48.28 
 
 		 833 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  51.92 
 
 		 850 aa  89.4  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  47.54 
 
 		 724 aa  89.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  38.29 
 
 		 615 aa  89  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  50 
 
 		 833 aa  89  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  50 
 
 		 680 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  52.17 
 
 		 1532 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  39.2 
 
 		 526 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  35.53 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3106  hemolysin-type calcium-binding region  40.44 
 
 		 375 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  51.38 
 
 		 1544 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 		 387 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  37.32 
 
 		 361 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  39.35 
 
 		 2145 aa  87  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  38.81 
 
 		 1400 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  42.36 
 
 		 942 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  42.31 
 
 		 1534 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  37.84 
 
 		 741 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  38.51 
 
 		 1156 aa  85.9  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  41.18 
 
 		 938 aa  86.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  40.99 
 
 		 860 aa  85.9  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  46.49 
 
 		 595 aa  85.9  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  38.51 
 
 		 1499 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  46.9 
 
 		 729 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  38.67 
 
 		 589 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  41.03 
 
 		 959 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  33.94 
 
 		 3608 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  50.94 
 
 		 679 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  45.21 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  40.32 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6263  hemolysin-type calcium-binding region  44.03 
 
 		 260 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  33.62 
 
 		 1019 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  44.19 
 
 		 1043 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0568  hemolysin-type calcium-binding region  45.9 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.294597  hitchhiker  0.0000308959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  42.5 
 
 		 1197 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  55.21 
 
 		 2452 aa  84  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  51.85 
 
 		 561 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  45.38 
 
 		 1814 aa  84  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  45.04 
 
 		 1363 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2704  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  50 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0626056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>