218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1598 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 426 aa  835    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  68.48 
 
 		 421 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  47.56 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  48.05 
 
 		 429 aa  362  6e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 416 aa  355  5.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  46.08 
 
 		 418 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 418 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 418 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  46.9 
 
 		 424 aa  340  4e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  37.44 
 
 		 397 aa  246  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  33.81 
 
 		 410 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  36.52 
 
 		 429 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  39.04 
 
 		 443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  33.41 
 
 		 412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 427 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 409 aa  211  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  33.1 
 
 		 412 aa  211  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 412 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 447 aa  209  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  34.5 
 
 		 432 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  30.9 
 
 		 726 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 444 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  34.84 
 
 		 418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  34.59 
 
 		 418 aa  196  7e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 		 436 aa  194  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 412 aa  190  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 713 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 417 aa  187  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 408 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  31.9 
 
 		 404 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  32.3 
 
 		 411 aa  181  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  32.36 
 
 		 443 aa  178  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  31.99 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 471 aa  170  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 415 aa  169  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 430 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  32.59 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 444 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  31.23 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 452 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 431 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  31.67 
 
 		 429 aa  152  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  31.28 
 
 		 438 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  27.97 
 
 		 427 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 436 aa  146  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  29.65 
 
 		 412 aa  146  8.000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  28.25 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 473 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 443 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 446 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 432 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 447 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  28.64 
 
 		 520 aa  143  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 454 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  29.36 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0101  major facilitator transporter  37.46 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  27.38 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  28.07 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 480 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 481 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 446 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 446 aa  137  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 474 aa  137  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 446 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  27 
 
 		 480 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  27.69 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 476 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 459 aa  133  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  31.07 
 
 		 385 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 380 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  28.37 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  28.03 
 
 		 380 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  25.6 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  23.74 
 
 		 412 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  25.6 
 
 		 395 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 421 aa  109  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 474 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0467  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 439 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.677382 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  25.66 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  25.32 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  23.76 
 
 		 414 aa  103  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  26.42 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>