More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1548 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3711  5prime-nucleotidase  57.6 
 
 		 638 aa  635    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165492  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  61.13 
 
 		 523 aa  634    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  62.43 
 
 		 532 aa  660    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0849  5'-Nucleotidase domain protein  71.21 
 
 		 529 aa  784    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0123925  normal  0.173542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1548  5'-nucleotidase-like  100 
 
 		 526 aa  1064    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00999704  normal  0.364034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  59.62 
 
 		 659 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  62.36 
 
 		 533 aa  664    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  61.13 
 
 		 523 aa  636    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  58.1 
 
 		 657 aa  646    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  55.62 
 
 		 627 aa  622  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  59.77 
 
 		 663 aa  621  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  40.41 
 
 		 558 aa  394  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  41.37 
 
 		 587 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.78 
 
 		 605 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.44 
 
 		 607 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  40.76 
 
 		 555 aa  382  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  39.96 
 
 		 520 aa  361  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2431  5'-nucleotidase precursor  35.25 
 
 		 619 aa  300  6e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157561  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05939  conserved hypothetical protein  34.17 
 
 		 582 aa  276  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1134  5'-nucleotidase  35.22 
 
 		 625 aa  265  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00179734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2800  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.85 
 
 		 601 aa  265  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.906182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2375  5'-Nucleotidase domain protein  33.63 
 
 		 581 aa  257  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0357  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  32.74 
 
 		 607 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0349  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  32.01 
 
 		 591 aa  242  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0670  5'-nucleotidase  34.09 
 
 		 637 aa  230  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.785834  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2370  5'-nucleotidase, putative  29.57 
 
 		 573 aa  229  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.405664 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0692  5'-nucleotidase  34.09 
 
 		 637 aa  230  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0157449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.09 
 
 		 508 aa  229  8e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5725  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.82 
 
 		 672 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695831 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43694  predicted protein  32.33 
 
 		 663 aa  228  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.553489  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2995  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.14 
 
 		 581 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3010  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.95 
 
 		 581 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1368  metallophosphoesterase  29 
 
 		 580 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.198191  normal  0.0110218 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0538  NAD pyrophosphatase/5'-nucleotidase NadN  29.57 
 
 		 584 aa  223  7e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4022  5'-nucleotidase  32.12 
 
 		 641 aa  223  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.887399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1300  5'-nucleotidase  29.57 
 
 		 592 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.291258  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3153  5'-nucleotidase domain protein  28.68 
 
 		 581 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867594 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1111  metallophosphoesterase  29.11 
 
 		 578 aa  219  7e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.443136  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2657  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.3 
 
 		 581 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1285  5'-nucleotidase  29.48 
 
 		 586 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.64405 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1294  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 583 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.260824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1539  metallophosphoesterase  29.72 
 
 		 577 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.337659 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3317  5'-nucleotidase, putative  28.11 
 
 		 583 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1223  metallophosphoesterase  28.17 
 
 		 583 aa  213  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1224  metallophosphoesterase  28.17 
 
 		 583 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.618653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1427  5'-nucleotidase  28.75 
 
 		 581 aa  210  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.232685 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  30.57 
 
 		 504 aa  209  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2483  5'-nucleotidase  33.2 
 
 		 512 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0854  5'-Nucleotidase domain protein  30.91 
 
 		 619 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0825  5'-Nucleotidase domain protein  30.91 
 
 		 619 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1252  5'-nucleotidase-like protein  28.01 
 
 		 580 aa  206  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05914  5'-nucleotidase  26.71 
 
 		 585 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000189  5'-nucleotidase  26.57 
 
 		 578 aa  203  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000310598  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0123  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.4 
 
 		 515 aa  200  5e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0639  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  29.94 
 
 		 509 aa  199  7e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.38757  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2772  putative 5'-nucleotidase  28.86 
 
 		 664 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000553351  hitchhiker  0.00604315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1235  5'-Nucleotidase domain protein  31.48 
 
 		 613 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.798144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2519  5'-Nucleotidase domain protein  29.09 
 
 		 523 aa  196  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0478  putative 5`-nucleotidase  28.76 
 
 		 580 aa  194  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000584896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  28.79 
 
 		 529 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0601  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  30.67 
 
 		 503 aa  192  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  28.6 
 
 		 529 aa  191  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.95 
 
 		 529 aa  191  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0450  5'-nucleotidase  25.13 
 
 		 579 aa  188  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  28.57 
 
 		 529 aa  189  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  28.2 
 
 		 529 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  28.2 
 
 		 529 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  30.94 
 
 		 508 aa  188  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  30.94 
 
 		 508 aa  188  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  28.2 
 
 		 529 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  28.01 
 
 		 529 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  28.01 
 
 		 529 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  30.54 
 
 		 515 aa  186  6e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  28.2 
 
 		 529 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0023  cell wall anchor domain-containing protein  28.98 
 
 		 772 aa  183  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.244704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0023  cell wall anchor domain-containing protein  28.98 
 
 		 772 aa  183  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0275377  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.36 
 
 		 530 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0581  5'-Nucleotidase domain protein  28.06 
 
 		 504 aa  181  4e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  29.94 
 
 		 1202 aa  179  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0441  5'-Nucleotidase domain protein  30.07 
 
 		 520 aa  177  3e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000373841  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1472  5'-nucleotidase  30.92 
 
 		 517 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.150971 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  27.67 
 
 		 530 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  29.75 
 
 		 1215 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1464  5'-Nucleotidase domain protein  27.18 
 
 		 657 aa  173  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  27.77 
 
 		 529 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1750  5'-nucleotidase  30.72 
 
 		 500 aa  172  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.398789 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  28.11 
 
 		 529 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1472  5'-nucleotidase  30.53 
 
 		 505 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633021  normal  0.092078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  27.74 
 
 		 529 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  27.94 
 
 		 1355 aa  171  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  27.92 
 
 		 529 aa  171  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  27.92 
 
 		 529 aa  171  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  27.92 
 
 		 529 aa  171  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  27.92 
 
 		 529 aa  170  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  27.4 
 
 		 529 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.29 
 
 		 517 aa  169  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  27.59 
 
 		 529 aa  169  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3478  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.91 
 
 		 508 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622587  normal  0.226915 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4357  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  28.75 
 
 		 535 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000122656  decreased coverage  0.0000528459 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  29.92 
 
 		 1181 aa  167  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>