85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1352 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1352  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  100 
 
 		 190 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  58.24 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  55.74 
 
 		 191 aa  209  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  56.84 
 
 		 189 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  58.24 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  51.1 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  52.17 
 
 		 190 aa  178  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  42.19 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  46.71 
 
 		 198 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  48 
 
 		 194 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  48 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  47.33 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  47.33 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  47.33 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  48 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  48 
 
 		 194 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  47.33 
 
 		 194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  40.57 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  45.33 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  48 
 
 		 195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  42.11 
 
 		 192 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  38.34 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  45.33 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  43.05 
 
 		 196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  37.82 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  46 
 
 		 195 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  46 
 
 		 195 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  46 
 
 		 195 aa  128  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  44.37 
 
 		 196 aa  128  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  46 
 
 		 195 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 195 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 195 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 195 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 195 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 195 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 195 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  46.67 
 
 		 195 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  45.33 
 
 		 195 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  45.33 
 
 		 195 aa  124  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  44.67 
 
 		 195 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  43.05 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  42.48 
 
 		 183 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  41.06 
 
 		 195 aa  121  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  36.79 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  39.6 
 
 		 200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  39.07 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  36.7 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  35.2 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  41.06 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  37.58 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  38.26 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  37.33 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2684  twin-arginine translocation pathway signal  36.13 
 
 		 197 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.407299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  37.25 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  37.5 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  34.44 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  35.94 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  34 
 
 		 187 aa  104  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  40.41 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3754  putative lipoprotein  44.67 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0557  putative lipoprotein  41.18 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  30.15 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  28.57 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  25.54 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0249  hypothetical protein  25.82 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00691872  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  27.22 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  25.68 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  25.73 
 
 		 260 aa  48.5  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  30.3 
 
 		 327 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2313  hypothetical protein  31.65 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00418629  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  36.71 
 
 		 249 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  29.23 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  28.68 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  24.87 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  36.36 
 
 		 274 aa  41.6  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  29.55 
 
 		 225 aa  41.2  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>