44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1299 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1299  peptidase U35, phage prohead HK97  100 
 
 		 663 aa  1342    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.284846 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  42.29 
 
 		 624 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  42.29 
 
 		 624 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  41.22 
 
 		 624 aa  450  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  41.22 
 
 		 624 aa  451  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3173  peptidase S49  28.77 
 
 		 781 aa  170  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.792634 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  30.1 
 
 		 416 aa  125  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  28.97 
 
 		 409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  32.05 
 
 		 600 aa  111  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1844  peptidase U35, phage prohead HK97  42.48 
 
 		 612 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0734  hypothetical protein  41.04 
 
 		 624 aa  91.3  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.747813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5508  hypothetical protein  25.9 
 
 		 438 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2821  peptidase U35, phage prohead HK97  41.1 
 
 		 599 aa  88.2  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.445416 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0807  peptidase U35, phage prohead HK97  36.26 
 
 		 689 aa  82  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0140399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1157  peptidase U35 phage prohead HK97  37.11 
 
 		 286 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.206732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1173  peptidase U35 phage prohead HK97  37.06 
 
 		 687 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1504  peptidase U35 phage prohead HK97  37.93 
 
 		 696 aa  72.8  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0137  peptidase U35, phage prohead HK97  36.96 
 
 		 586 aa  67.4  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3337  phage terminase GpA  26.32 
 
 		 1179 aa  64.7  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.27063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4683  peptidase U35 phage prohead HK97  29.12 
 
 		 693 aa  63.9  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  23.89 
 
 		 403 aa  63.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  33.33 
 
 		 427 aa  63.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  33.33 
 
 		 427 aa  63.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  33.33 
 
 		 427 aa  63.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3693  peptidase U35 phage prohead HK97  34.75 
 
 		 623 aa  59.3  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.854012  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2686  phage major capsid protein, HK97 family  32.26 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0211  hypothetical protein  23.1 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2151  hypothetical protein  24.27 
 
 		 398 aa  57  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.870388  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2635  hypothetical protein  27.36 
 
 		 411 aa  53.5  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00371999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  25.35 
 
 		 279 aa  50.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  30.48 
 
 		 384 aa  48.9  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  24.48 
 
 		 490 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  23.65 
 
 		 382 aa  48.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  23.65 
 
 		 382 aa  48.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  23.29 
 
 		 382 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0562  hypothetical protein  30.5 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.123092  hitchhiker  0.000000108718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  24.9 
 
 		 661 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  24.9 
 
 		 661 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  22.09 
 
 		 420 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0240  putative major head protein/prohead protease  25.56 
 
 		 469 aa  44.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  23.15 
 
 		 446 aa  44.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  29.12 
 
 		 417 aa  44.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  22.39 
 
 		 397 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  22.39 
 
 		 397 aa  43.9  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>