More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1191 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1191  aldo/keto reductase  100 
 
 		 331 aa  678    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0223212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  69.09 
 
 		 331 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3076  aldo/keto reductase  68.28 
 
 		 331 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  65.76 
 
 		 331 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  55.14 
 
 		 327 aa  359  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0370  aldo/keto reductase  58.28 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  48.91 
 
 		 330 aa  285  8e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  45.99 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  45.06 
 
 		 333 aa  261  8.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4616  aldo/keto reductase  43.38 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0526321  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  40.69 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  41.99 
 
 		 329 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1723  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  45.08 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  41.05 
 
 		 326 aa  229  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1414  aldo/keto reductase  44.75 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.825593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  41.12 
 
 		 319 aa  224  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0873  aldo/keto reductase  42.62 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.107654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  40.32 
 
 		 329 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4242  oxidoreductase  40.66 
 
 		 329 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  40.75 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  39.18 
 
 		 319 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  39.18 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.96 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  37.89 
 
 		 329 aa  215  7e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.546872 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  41.96 
 
 		 326 aa  215  9e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  41.96 
 
 		 326 aa  215  9e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.96 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  41.64 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.64 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.64 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  39.31 
 
 		 327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  41.11 
 
 		 342 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  36.5 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.03 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0382  aldo/keto reductase  38.56 
 
 		 332 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0771671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  36.56 
 
 		 319 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  35 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4829  aldo/keto reductase  39.45 
 
 		 328 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1283  aldo/keto reductase  36.56 
 
 		 306 aa  202  8e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  40.39 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  37.27 
 
 		 319 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1920  aldo/keto reductase  33.74 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0036  aldo/keto reductase  36.01 
 
 		 314 aa  196  7e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  37.23 
 
 		 327 aa  195  8.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6983  aldo/keto reductase  37.5 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0500537  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2050  aldo/keto reductase  38.36 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.495803  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  35.62 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  34.29 
 
 		 319 aa  192  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  39.34 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  36.25 
 
 		 326 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  37.18 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7726  aldo/keto reductase  36.71 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  37.9 
 
 		 329 aa  189  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1378  aldo/keto reductase  37.58 
 
 		 331 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0679596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2904  aldo/keto reductase  37.58 
 
 		 331 aa  189  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.96128e-16 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  33.96 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  38.36 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 311 aa  187  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  37.46 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0544  aldo/keto reductase  35.56 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  37.34 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2255  aldo/keto reductase  36.13 
 
 		 331 aa  185  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  36.59 
 
 		 328 aa  185  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2608  aldo/keto reductase  37.11 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000730826  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  35.22 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  36.34 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  34.23 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  34.77 
 
 		 341 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0687  aldo/keto reductase  34.49 
 
 		 319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  36.16 
 
 		 324 aa  182  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  36.2 
 
 		 318 aa  182  6e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  34.19 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  35.11 
 
 		 328 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  35.33 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1459  aldo/keto reductase  37.22 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.829072 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  35.44 
 
 		 331 aa  180  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0797  putative aldo/keto reductase  36.59 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  35.78 
 
 		 328 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  34.08 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  35.22 
 
 		 328 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  34.08 
 
 		 308 aa  179  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.89 
 
 		 327 aa  179  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  36.01 
 
 		 338 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6576  aldo/keto reductase  37.33 
 
 		 349 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  36.25 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14360  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  38.56 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  36.45 
 
 		 323 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  36.62 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  34.89 
 
 		 328 aa  176  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.74 
 
 		 312 aa  176  7e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3323  aldo/keto reductase  35.14 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  34.29 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0444  aldo/keto reductase  34.06 
 
 		 325 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1734  aldo/keto reductase  35.03 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0633258  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  33.02 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  34.37 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  34.69 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3432  aldo/keto reductase  34.38 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237598  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4586  aldo/keto reductase  36.79 
 
 		 330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00281248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>