96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1061 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  100 
 
 		 398 aa  805    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  68.53 
 
 		 405 aa  560  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  71.96 
 
 		 393 aa  552  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  66.32 
 
 		 387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  65.26 
 
 		 387 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  65.53 
 
 		 398 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  62.5 
 
 		 388 aa  467  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  41.5 
 
 		 416 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  39.86 
 
 		 420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  40.57 
 
 		 421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  46.72 
 
 		 417 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  43.8 
 
 		 403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  40 
 
 		 421 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  45.63 
 
 		 417 aa  302  8.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  40.38 
 
 		 431 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  38.94 
 
 		 435 aa  300  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  40.19 
 
 		 428 aa  293  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  40.58 
 
 		 417 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  40.09 
 
 		 421 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  39.14 
 
 		 430 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  41.2 
 
 		 418 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  38.81 
 
 		 471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  46.73 
 
 		 380 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  41.69 
 
 		 380 aa  267  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  43.45 
 
 		 450 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  40.4 
 
 		 408 aa  266  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  39.35 
 
 		 424 aa  265  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  38.46 
 
 		 407 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  41.39 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  37.5 
 
 		 406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  40.52 
 
 		 419 aa  237  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  35.04 
 
 		 401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  35.04 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  34.86 
 
 		 401 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  36.27 
 
 		 379 aa  224  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  35.75 
 
 		 379 aa  223  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  37.42 
 
 		 441 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  34.51 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  36.2 
 
 		 416 aa  210  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  35.71 
 
 		 425 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  33.89 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  32.59 
 
 		 383 aa  206  8e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  35.57 
 
 		 389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  34.15 
 
 		 389 aa  190  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  30.38 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  34.47 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  31.17 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  34.28 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  31.69 
 
 		 382 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  31.27 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  31.27 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  31.37 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  32.26 
 
 		 424 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  30.52 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  33.07 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  33.07 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  32.01 
 
 		 400 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  30.06 
 
 		 385 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  30.03 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  33.11 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  30.03 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  31.85 
 
 		 392 aa  137  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  27.89 
 
 		 390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  35.97 
 
 		 411 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  27.3 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  26 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  25.09 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  28.26 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  26.3 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  26.3 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  26.3 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  29.41 
 
 		 413 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  26.37 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  28.67 
 
 		 417 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  24.26 
 
 		 562 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  26.64 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  29.65 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  23.49 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  23.49 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  27.61 
 
 		 412 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  25.1 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  28.25 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  26.51 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1114  HK97 family phage major capsid protein  26.87 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  22.6 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  27.16 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0569  phage major capsid protein, HK97 family  28.25 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.361307  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12666  phiRv2 prophage protein  25.49 
 
 		 479 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.5272e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2474  major capsid protein HK97  23.57 
 
 		 483 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  23.62 
 
 		 396 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  23.62 
 
 		 400 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  25.59 
 
 		 438 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08230  phage major capsid protein, HK97 family  23.13 
 
 		 403 aa  47.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0061868  hitchhiker  0.00502474 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3666  major capsid protein HK97  24.08 
 
 		 337 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.017941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  24.73 
 
 		 279 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0627  phage major capsid protein, HK97 family  20.97 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>