298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0995 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  100 
 
 		 94 aa  186  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  73.86 
 
 		 109 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  75 
 
 		 105 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  72.73 
 
 		 108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  72.73 
 
 		 108 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  68.89 
 
 		 93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  66.67 
 
 		 110 aa  128  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  61.8 
 
 		 143 aa  116  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  54.55 
 
 		 111 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  55.68 
 
 		 111 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  54.08 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  55.06 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  55.06 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  55.43 
 
 		 110 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  55.21 
 
 		 104 aa  107  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  54.55 
 
 		 123 aa  106  8.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  55.17 
 
 		 114 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  55.81 
 
 		 115 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  54.65 
 
 		 110 aa  105  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  54.65 
 
 		 110 aa  105  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  55.29 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  56.04 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  56.32 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  52.33 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  47.87 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  53.49 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  52.38 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  49.41 
 
 		 146 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  56.79 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  59.76 
 
 		 107 aa  99  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  49.43 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  53.01 
 
 		 110 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  52.94 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  47.13 
 
 		 142 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 107 aa  97.1  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 107 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 107 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 107 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 107 aa  97.1  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  50 
 
 		 107 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  53.57 
 
 		 115 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  48.84 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  51.61 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  48.89 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  48.84 
 
 		 109 aa  94.7  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  48.84 
 
 		 110 aa  94.7  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  47.67 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  47.67 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  47.67 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  47.67 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  47.67 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  47.67 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  47.67 
 
 		 108 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  47.06 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  46.43 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  46.43 
 
 		 109 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  55.95 
 
 		 105 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  51.76 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  48.24 
 
 		 108 aa  91.3  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  51.04 
 
 		 102 aa  90.5  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  53.16 
 
 		 178 aa  90.9  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  44.83 
 
 		 127 aa  90.9  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  54.76 
 
 		 106 aa  90.5  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  50.57 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  50.63 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  48.84 
 
 		 108 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  45.88 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  39.42 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  52.56 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  42.71 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  52.44 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  49.38 
 
 		 93 aa  87  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  47.06 
 
 		 94 aa  86.7  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  46.59 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  47.06 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  47.73 
 
 		 108 aa  85.9  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  48.81 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  44.05 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  53.25 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  47.56 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  46.43 
 
 		 113 aa  84.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  47.56 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  45.74 
 
 		 111 aa  84  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  43.53 
 
 		 92 aa  83.6  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  48.81 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  48.19 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  47.56 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  47.56 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  43.96 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  52 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  44.05 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 109 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  44.05 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0814  protein translocase subunit yajC  44.68 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.0000182251  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  40.45 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  42.7 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  48.19 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>