More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0954 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  55.65 
 
 		 629 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  54.93 
 
 		 627 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  71.79 
 
 		 615 aa  898    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  68.28 
 
 		 615 aa  845    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  71.96 
 
 		 615 aa  897    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  68.06 
 
 		 615 aa  828    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  71.84 
 
 		 642 aa  896    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  71.88 
 
 		 618 aa  879    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  100 
 
 		 633 aa  1277    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  55.27 
 
 		 627 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  53.4 
 
 		 625 aa  632  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.21 
 
 		 639 aa  632  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  52.56 
 
 		 625 aa  632  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  52.46 
 
 		 637 aa  629  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  51.62 
 
 		 627 aa  624  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1754  ABC transporter related  53.42 
 
 		 625 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544165  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  52.18 
 
 		 627 aa  608  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  53.02 
 
 		 625 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3835  ABC transporter ATP-binding protein  55.21 
 
 		 622 aa  609  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.551802 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 		 640 aa  607  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  52.56 
 
 		 627 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  49.53 
 
 		 645 aa  598  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2484  ABC transporter related  51.94 
 
 		 625 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.814906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2317  ABC transporter related  50.89 
 
 		 627 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6763  ABC transporter related  55.01 
 
 		 623 aa  591  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2962  ABC transporter related  51.36 
 
 		 619 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0574525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  53.52 
 
 		 621 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  53.25 
 
 		 621 aa  585  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  53.52 
 
 		 621 aa  587  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1232  ABC transporter related  51.86 
 
 		 626 aa  580  1e-164  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.072507  normal  0.215663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6573  ABC transporter related  54.16 
 
 		 623 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  51.76 
 
 		 620 aa  571  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2428  ABC transporter related  50.49 
 
 		 625 aa  568  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0904  ABC transporter related  55.13 
 
 		 527 aa  567  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467195  decreased coverage  0.00659199 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0972  ABC transporter related  49.3 
 
 		 626 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066159 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0238  ABC transporter related  51.33 
 
 		 625 aa  555  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.773221  normal  0.692019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1348  ABC transporter related  47.12 
 
 		 625 aa  548  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2537  ABC transporter related  48.95 
 
 		 627 aa  546  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.265447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3480  ABC transporter related  46.37 
 
 		 634 aa  535  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1310  ABC transporter related  51.89 
 
 		 622 aa  533  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142081  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2171  ABC transporter related  53.69 
 
 		 542 aa  530  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3118  ABC transporter related  47.7 
 
 		 631 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0572  ABC transporter related  43.89 
 
 		 628 aa  511  1e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.76 
 
 		 637 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  42.76 
 
 		 637 aa  497  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.93 
 
 		 637 aa  498  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.76 
 
 		 637 aa  497  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.76 
 
 		 637 aa  497  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.76 
 
 		 637 aa  497  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  42.76 
 
 		 637 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 		 637 aa  495  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.76 
 
 		 637 aa  497  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.76 
 
 		 637 aa  498  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.02 
 
 		 635 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.02 
 
 		 635 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.08 
 
 		 639 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.02 
 
 		 635 aa  495  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.69 
 
 		 637 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.02 
 
 		 635 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.02 
 
 		 635 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3197  ABC transporter ATP-binding protein  42.31 
 
 		 638 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.79023  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.69 
 
 		 635 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 635 aa  485  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.49 
 
 		 640 aa  485  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.49 
 
 		 640 aa  484  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.49 
 
 		 640 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  41.48 
 
 		 636 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.93 
 
 		 634 aa  477  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  40 
 
 		 648 aa  472  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  41.65 
 
 		 635 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  41.23 
 
 		 633 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0112  ABC transporter related  42.01 
 
 		 650 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.339786  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  43.37 
 
 		 637 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  43.37 
 
 		 637 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  43.53 
 
 		 637 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  41.31 
 
 		 643 aa  468  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  43.49 
 
 		 636 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  42.81 
 
 		 636 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  42.42 
 
 		 656 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  42.3 
 
 		 637 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  40.76 
 
 		 659 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  42.3 
 
 		 637 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  43.3 
 
 		 636 aa  464  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 		 638 aa  463  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  42.67 
 
 		 636 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  40.85 
 
 		 639 aa  464  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  42.3 
 
 		 637 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 635 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  42.72 
 
 		 637 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  41.11 
 
 		 636 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3178  ABC transporter related  42.18 
 
 		 650 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0886  ABC transporter related  42.14 
 
 		 637 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  43.07 
 
 		 657 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  42.83 
 
 		 634 aa  458  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  42.72 
 
 		 638 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  41.77 
 
 		 635 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  41.21 
 
 		 636 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  41.21 
 
 		 636 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  40.75 
 
 		 643 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  42.11 
 
 		 633 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>