More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0942 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  100 
 
 		 278 aa  553  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  57.66 
 
 		 275 aa  287  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  55.56 
 
 		 278 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1551  HemK family modification methylase  56.25 
 
 		 278 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00225309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  56.62 
 
 		 278 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  51.79 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  46.36 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  45.49 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.01 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.29 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.17 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.65 
 
 		 299 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  41.99 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.86 
 
 		 283 aa  179  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.64 
 
 		 279 aa  178  8e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  40.86 
 
 		 283 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  42.91 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  41.89 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0893  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.61 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  38.79 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  41.76 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  41.73 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  40.21 
 
 		 288 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  41.43 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  39.13 
 
 		 287 aa  168  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  44.79 
 
 		 270 aa  168  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  38.03 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.3 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  35.94 
 
 		 286 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.32 
 
 		 296 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  38.93 
 
 		 280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  42.48 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.43 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  42.05 
 
 		 289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  37.02 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  39.71 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0855  modification methylase HemK  34.42 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  41.67 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  38.46 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  43.56 
 
 		 286 aa  158  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  33.81 
 
 		 361 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  34.41 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  38.62 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  42.31 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  42.31 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1063  HemK family modification methylase  33.71 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273946  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  38.08 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  36.8 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.04 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2889  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.56 
 
 		 280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.479944 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.99 
 
 		 284 aa  155  8e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.531289  normal  0.236776 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.96 
 
 		 280 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  39.05 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  39.71 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1530  HemK family modification methylase  38.89 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0010  HemK family modification methylase  33.45 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.175416  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.43 
 
 		 293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  41.37 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2476  HemK family modification methylase  39.77 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0413  HemK family modification methylase  43.22 
 
 		 280 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  42.05 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3832  hemK family protein  37.09 
 
 		 286 aa  149  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0851  protoporphyrinogen oxidase  39.22 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1425  modification methylase, HemK family  41.02 
 
 		 289 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949307  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  40.15 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  32.49 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  38.38 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0765  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.61 
 
 		 275 aa  148  8e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.267052  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  37.32 
 
 		 284 aa  148  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  34.36 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0798  HemK family modification methylase  35.25 
 
 		 286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0770  HemK family modification methylase  35.25 
 
 		 286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.163126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  38.17 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  39.62 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0435  modification methylase HemK  39.56 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3168  HemK family modification methylase  35.25 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  34.18 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.15 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0439  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.33 
 
 		 280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  40.64 
 
 		 311 aa  145  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  41.49 
 
 		 284 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3736  modification methylase, HemK family  35 
 
 		 282 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3545  modification methylase, HemK family  35 
 
 		 282 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.180867  hitchhiker  0.0000397917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3613  HemK family modification methylase  35 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0734188  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.25 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.044842  normal  0.135184 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0697  HemK family modification methylase  35 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2903  methyltransferase protein  39.57 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.907973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2911  HemK family modification methylase  35.59 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  35.13 
 
 		 283 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2931  hemK protein  39.93 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  37.83 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  37.88 
 
 		 284 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  36.96 
 
 		 288 aa  143  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  37.06 
 
 		 304 aa  142  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2494  modification methylase HemK  41.04 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  35.25 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  34.64 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0166  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  30.88 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  32.63 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  34.66 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>