More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0689 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0689  cell division protein FtsZ  100 
 
 
557 aa  1110    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.0000000108594  decreased coverage  0.000313873 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2114  cell division protein FtsZ  65.91 
 
 
552 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0790  cell division protein FtsZ  65.91 
 
 
552 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.461574  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2416  cell division protein FtsZ  65.19 
 
 
531 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000147556  normal  0.595095 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0700  cell division protein FtsZ  66.14 
 
 
551 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.502666  normal  0.627265 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2750  cell division protein FtsZ  65.61 
 
 
547 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000196977  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4487  cell division protein FtsZ  60.73 
 
 
544 aa  540  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0148758  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2427  cell division protein FtsZ  53.65 
 
 
591 aa  452  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000809973  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2070  cell division protein FtsZ  52.94 
 
 
543 aa  435  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.289447  normal  0.358152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1139  cell division protein FtsZ  66.18 
 
 
491 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2845  cell division protein FtsZ  52.22 
 
 
572 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287713  hitchhiker  0.00902065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3386  cell division protein FtsZ  73.12 
 
 
595 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.631027  normal  0.0328355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4040  cell division protein FtsZ  72.5 
 
 
591 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.433959  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1058  cell division protein FtsZ  71 
 
 
603 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154348  normal  0.753421 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2004  cell division protein FtsZ  72.5 
 
 
597 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.298941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3298  cell division protein FtsZ  71.04 
 
 
592 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2882  cell division protein FtsZ  71.56 
 
 
619 aa  405  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139888  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2586  cell division protein FtsZ  72.5 
 
 
571 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0982518  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1875  cell division protein FtsZ  65.99 
 
 
482 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.487972  normal  0.232023 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0925  cell division protein FtsZ  69.66 
 
 
420 aa  397  1e-109  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0328  cell division protein FtsZ  74.06 
 
 
590 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126333  normal  0.436699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6166  cell division protein FtsZ  69.97 
 
 
610 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0482402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7436  cell division protein FtsZ  70.62 
 
 
606 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6697  cell division protein FtsZ  70.94 
 
 
616 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3657  cell division protein FtsZ  68.88 
 
 
504 aa  395  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3940  cell division protein FtsZ  67.16 
 
 
495 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3495  cell division protein FtsZ  49.42 
 
 
569 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.417805 
 
 
-
 
NC_004310  BR1425  cell division protein FtsZ  50.74 
 
 
566 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0986259  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1750  cell division protein FtsZ  72.81 
 
 
565 aa  392  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000567765  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1382  cell division protein FtsZ  51.32 
 
 
566 aa  391  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.882366  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0698  cell division protein FtsZ  71.56 
 
 
610 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.591977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2949  cell division protein FtsZ  70.62 
 
 
585 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0151858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3176  cell division protein FtsZ  70.62 
 
 
585 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0782818  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3133  cell division protein FtsZ  70.62 
 
 
588 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.170278  normal  0.169763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3164  cell division protein FtsZ  66.77 
 
 
479 aa  386  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.972312 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0941  cell division protein FtsZ  72.19 
 
 
592 aa  387  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211143  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2001  cell division protein FtsZ  49.17 
 
 
552 aa  388  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000263302  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0723  cell division protein FtsZ  66.08 
 
 
398 aa  382  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0809935  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1153  cell division protein FtsZ  69.97 
 
 
421 aa  385  1e-105  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.872547  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0069  cell division protein FtsZ  49.21 
 
 
522 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1943  cell division protein FtsZ  65.09 
 
 
345 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.253692 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2172  cell division protein FtsZ  60.99 
 
 
513 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0335477  normal  0.0236284 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2618  cell division protein FtsZ  66.67 
 
 
339 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12624  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0944  cell division protein FtsZ  69.02 
 
 
665 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2285  cell division protein FtsZ  67.31 
 
 
340 aa  362  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0116  cell division protein FtsZ  66.12 
 
 
317 aa  352  7e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.138095  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0342  cell division protein FtsZ  60.3 
 
 
372 aa  338  1.9999999999999998e-91  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.000000128009  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2782  cell division protein FtsZ  48.15 
 
 
391 aa  330  4e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000504391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5214  cell division protein FtsZ  58.03 
 
 
587 aa  324  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.945677  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0305  cell division protein FtsZ  51.14 
 
 
399 aa  315  9.999999999999999e-85  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2890  cell division protein FtsZ  43.8 
 
 
430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0751  cell division protein FtsZ  55.73 
 
 
424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2517  cell division protein FtsZ  48.71 
 
 
420 aa  307  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2498  cell division protein FtsZ  44.81 
 
 
430 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.103789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2064  cell division protein FtsZ  49.03 
 
 
380 aa  307  4.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000128315  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4732  cell division protein FtsZ  55.11 
 
 
454 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0747  cell division protein FtsZ  57.73 
 
 
432 aa  306  6e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100663  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6104  cell division protein FtsZ  49.44 
 
 
395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0530427  normal  0.0566942 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0059  cell division protein FtsZ  46.18 
 
 
427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000225371  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2003  cell division protein FtsZ  54.33 
 
 
357 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00598535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4057  cell division protein FtsZ  57.68 
 
 
353 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000125152  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1064  cell division protein FtsZ  57.99 
 
 
353 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.503416  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0497  cell division protein FtsZ  53.92 
 
 
386 aa  302  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000633261  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0514  cell division protein FtsZ  49.28 
 
 
386 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0850  cell division protein FtsZ  57.34 
 
 
355 aa  300  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000127363  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3766  cell division protein FtsZ  53.5 
 
 
423 aa  301  3e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0240181 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2378  cell division protein FtsZ  56.79 
 
 
393 aa  300  4e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.267634 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2716  cell division protein FtsZ  49.51 
 
 
431 aa  300  7e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0707942  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09130  cell division protein FtsZ  56.95 
 
 
354 aa  298  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000171121  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0783  cell division protein FtsZ  50.6 
 
 
360 aa  298  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000321341  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1047  cell division protein FtsZ  56.55 
 
 
435 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000157596  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1555  cell division protein FtsZ  53.07 
 
 
351 aa  298  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000489929  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19971  cell division protein FtsZ  53.63 
 
 
387 aa  297  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.207905 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0951  cell division protein FtsZ  57.48 
 
 
429 aa  297  4e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.261206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5023  cell division protein FtsZ  55.48 
 
 
418 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2018  cell division protein FtsZ  49.57 
 
 
381 aa  296  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000169296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1735  cell division protein FtsZ  49.57 
 
 
381 aa  296  5e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000316509  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004486  cell division protein FtsZ  54.45 
 
 
412 aa  296  8e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000238427  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00906  cell division protein FtsZ  54.11 
 
 
415 aa  296  9e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1270  cell division protein FtsZ  52.3 
 
 
390 aa  295  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0746  cell division protein FtsZ  56.29 
 
 
449 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0186189  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2258  cell division protein FtsZ  49.33 
 
 
428 aa  295  1e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000330912  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4459  cell division protein FtsZ  51.46 
 
 
386 aa  295  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0417  cell division protein FtsZ  54.07 
 
 
384 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857651  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1975  cell division protein FtsZ  50.44 
 
 
398 aa  294  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000804348  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1288  cell division protein FtsZ  54.58 
 
 
379 aa  293  4e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.848235  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1012  cell division protein FtsZ  54.27 
 
 
462 aa  293  7e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0217223 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15081  cell division protein FtsZ  51.59 
 
 
371 aa  293  8e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1428  cell division protein FtsZ  55.9 
 
 
350 aa  293  8e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000540584  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2105  cell division protein FtsZ  45.3 
 
 
436 aa  293  8e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.535546  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2859  cell division protein FtsZ  52.33 
 
 
394 aa  292  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000662762  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2423  cell division protein FtsZ  53.62 
 
 
382 aa  292  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0258249  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14951  cell division protein FtsZ  53.7 
 
 
371 aa  292  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0684  cell division protein FtsZ  56.04 
 
 
350 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000745989  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3968  cell division protein FtsZ  51.3 
 
 
383 aa  292  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2085  cell division protein FtsZ  54.45 
 
 
386 aa  291  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.150448  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3757  cell division protein FtsZ  50 
 
 
363 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.853491  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0125  cell division protein FtsZ  54.13 
 
 
380 aa  291  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0593594  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3587  cell division protein FtsZ  54.45 
 
 
383 aa  291  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00015207  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0653  cell division protein FtsZ  54.11 
 
 
383 aa  290  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>