64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0687 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0687  cell division protein FtsQ  100 
 
 
299 aa  580  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0983299  decreased coverage  0.000241 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0788  cell division protein FtsQ  51.7 
 
 
308 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.290421  normal  0.28339 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2112  cell division septal protein FtsQ  51.36 
 
 
308 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2752  cell division protein FtsQ  47.44 
 
 
311 aa  247  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.417111  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0698  cell division protein FtsQ  51.09 
 
 
304 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.68062  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2418  putative cell division protein FtsQ  46.5 
 
 
297 aa  243  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000895115  normal  0.230977 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4489  cell division protein FtsQ  47.17 
 
 
340 aa  228  9e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681161  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1748  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.48 
 
 
295 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1384  putative cell division protein FtsQ  33.99 
 
 
295 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1427  cell division protein FtsQ, putative  33.99 
 
 
288 aa  102  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.387977  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2076  cell division protein FtsQ  30.2 
 
 
309 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000439977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2003  cell division protein FtsQ  31.22 
 
 
291 aa  96.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1056  cell division protein FtsQ  29.48 
 
 
340 aa  96.3  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0943  cell division protein FtsQ  29.34 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489115  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3174  cell division protein FtsQ  33.84 
 
 
312 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0135629  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2947  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.33 
 
 
312 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.351672  normal  0.0843498 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1284  cell division protein FtsQ  27.69 
 
 
346 aa  92.4  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3131  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  33.33 
 
 
312 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4042  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  28.15 
 
 
329 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2352  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.32 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.439239 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3659  cell division protein FtsQ  32.62 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.203733 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3388  cell division protein FtsQ  28.69 
 
 
330 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437684 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2425  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.18 
 
 
334 aa  86.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00120327  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2885  cell division protein  29.35 
 
 
309 aa  85.9  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2588  cell division protein FtsQ  29.74 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2002  cell division protein FtsQ  27.85 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2847  cell division protein FtsQ  29.74 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00692899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6168  cell division protein FtsQ  26.47 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0734462 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3493  cell division protein FtsQ  28.51 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.951015 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3300  cell division protein FtsQ  28.86 
 
 
302 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0946  cell division protein FtsQ  29 
 
 
331 aa  79  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0427417  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7438  cell division protein FtsQ  28.26 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3942  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.33 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0326  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.72 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256258  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6699  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.7 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.71 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  0.309668 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1877  cell division protein FtsQ  28.09 
 
 
312 aa  70.9  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566658  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_002978  WD0096  cell division protein FtsQ, putative  20.55 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3166  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  30.81 
 
 
382 aa  69.3  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2073  cell division protein FtsQ  29.08 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.313808 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1137  cell division protein FtsQ  29.68 
 
 
320 aa  63.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0669  cell division protein FtsQ  25.5 
 
 
275 aa  59.3  0.00000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.809619  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0067  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.54 
 
 
292 aa  57.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0337  putative cell division protein FtsQ  24.87 
 
 
271 aa  55.5  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.448058  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3516  cell division protein FtsQ  29.55 
 
 
253 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.320398  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3467  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  29.38 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000457508  hitchhiker  0.00184571 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0415  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.12 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235658  hitchhiker  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0404  cell division protein FtsQ  26.69 
 
 
262 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00313866  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0429  cell division protein FtsQ  26.69 
 
 
249 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000800756  hitchhiker  0.0000000000534186 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.12 
 
 
262 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000561241  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0489  putative cell division transmembrane protein, FtsQ  27.88 
 
 
250 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0227105  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3648  cell division protein FtsQ  27.67 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0726048  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3809  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.22 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000142789  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4217  cell division protein FtsQ  27.65 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0388  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.33 
 
 
249 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.109832  hitchhiker  0.00233636 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3741  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.52 
 
 
249 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0016419  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5024  Polypeptide-transport-associated domain protein FtsQ-type  34.95 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.763504 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0466  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.7 
 
 
250 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0206402  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0491  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.7 
 
 
250 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00415174  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3568  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.33 
 
 
249 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00488652  hitchhiker  0.0000000422237 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0356  cell division protein FtsQ  25.56 
 
 
274 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0290766  hitchhiker  0.000649691 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0562  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.18 
 
 
250 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000118415  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0080  cell division protein FtsQ  27.18 
 
 
250 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0168578  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0533  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.18 
 
 
250 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000284929  normal  0.537044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>