More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0667 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0667  phosphate transporter  100 
 
 		 496 aa  980    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2170  inorganic phosphate transporter  52.16 
 
 		 505 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0842  phosphate transporter  51.96 
 
 		 505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0133767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2323  phosphate transporter  49.6 
 
 		 504 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0608  phosphate transporter  48.91 
 
 		 494 aa  425  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0822433  normal  0.70897 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0487  phosphate transporter  47.5 
 
 		 499 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5782  phosphate permease  46.65 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0443  phosphate transporter  46.4 
 
 		 499 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2034  phosphate transporter  47.48 
 
 		 498 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1333  phosphate transporter  46.46 
 
 		 520 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383309  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0389  phosphate transporter  44.09 
 
 		 501 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.797462 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0543  phosphate transporter  41.62 
 
 		 523 aa  378  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0665  phosphate transporter  51.68 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393628  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0900  phosphate transporter  45.02 
 
 		 502 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0542  phosphate transporter  41.95 
 
 		 542 aa  364  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3122  phosphate permease  39.64 
 
 		 514 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.669581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3279  phosphate transporter  41.91 
 
 		 524 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.854272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1670  phosphate transporter  42.71 
 
 		 526 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0503  phosphate transporter  39.28 
 
 		 549 aa  325  1e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3586  phosphate transporter  42.17 
 
 		 521 aa  325  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1850  phosphate transporter  40.56 
 
 		 535 aa  301  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0634  phosphate transporter  40.93 
 
 		 474 aa  252  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0419922  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0492  phosphate transporter  33.71 
 
 		 401 aa  241  2.9999999999999997e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000002295  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0229  phosphate transporter  34.45 
 
 		 422 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.81942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00862  hypothetical protein  35.59 
 
 		 419 aa  236  8e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1922  phosphate transporter  35.17 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00186941  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3456  phosphate transporter  37.06 
 
 		 429 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000664139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0916  phosphate transporter  37.06 
 
 		 429 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000785121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0882  phosphate transporter  37.06 
 
 		 429 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102978  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0906  phosphate transporter  37.06 
 
 		 429 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3097  phosphate transporter  37.56 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000238247  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0821  phosphate transporter  37.06 
 
 		 429 aa  230  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000102256  normal  0.247427 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004529  probable low-affinity inorganic phosphate transporter  34.89 
 
 		 419 aa  230  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000555877  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3120  phosphate transporter  37.06 
 
 		 429 aa  230  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000658965  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0352  phosphate transporter  32.81 
 
 		 423 aa  229  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2020  pho4 family protein  34.37 
 
 		 433 aa  228  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0852  phosphate transporter  37.06 
 
 		 429 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000695  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3844  phosphate transporter  36.46 
 
 		 422 aa  226  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000689956  hitchhiker  0.0000000351014 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2682  putative phosphate transporter  34.98 
 
 		 428 aa  226  9e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0617  phosphate transporter  37.01 
 
 		 422 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00080606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0716  phosphate transporter  37.21 
 
 		 422 aa  225  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000146128  unclonable  0.000000015476 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2469  phosphate transporter  33.56 
 
 		 423 aa  223  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3488  phosphate transporter  37.11 
 
 		 422 aa  223  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000339536  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1147  phosphate transporter  33.56 
 
 		 411 aa  222  9.999999999999999e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.367938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3771  phosphate transporter, putative  35.77 
 
 		 424 aa  219  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3781  sodium/phosphate symporter  34.5 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03147  Phosphate permease  35.2 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0428562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2674  phosphate transporter  37.27 
 
 		 423 aa  217  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00487764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5952  phosphate transporter  36.52 
 
 		 422 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3319  phosphate transporter  35.46 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68780  phosphate transporter  36.27 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0142  phosphate transporter  36.47 
 
 		 418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.983377  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3637  phosphate transporter family protein  33.48 
 
 		 431 aa  214  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0566  phosphate transporter  35.84 
 
 		 422 aa  212  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0137  low-affinity inorganic phosphate transporter  34.09 
 
 		 417 aa  209  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2189  phosphate transporter family protein  33.84 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0691  phosphate transporter  35.36 
 
 		 422 aa  206  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000075079  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1191  phosphate permease  30.68 
 
 		 420 aa  204  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0687  phosphate transporter  33.03 
 
 		 402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000146825  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0663  phosphate transporter  33.7 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143289  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0712  phosphate transporter  35.48 
 
 		 423 aa  197  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0180  phosphate transporter  34.96 
 
 		 421 aa  196  9e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0617  hypothetical protein  32.56 
 
 		 417 aa  193  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0633  hypothetical protein  32.56 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0155  phosphate transporter  30.12 
 
 		 461 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610191  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3724  phosphate transporter  31.94 
 
 		 429 aa  190  5e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3225  phosphate transporter  34.56 
 
 		 411 aa  190  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2826  phosphate transporter  32.12 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1053  phosphate transporter  34.47 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.036629  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0929  putative phosphate-transport permease PitB  26.89 
 
 		 506 aa  178  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2045  phosphate transporter  28.2 
 
 		 346 aa  157  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000973225  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0064  phosphate permease family protein  31.12 
 
 		 426 aa  156  6e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1966  phosphate transporter  28.6 
 
 		 391 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0416469 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0788  phosphate transporter  40.69 
 
 		 535 aa  138  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0716  inorganic phosphate transporter  42.86 
 
 		 535 aa  137  5e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0400057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0691  phosphate transporter  42.31 
 
 		 535 aa  136  9e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08680  phosphate/sulfate permease  43.88 
 
 		 599 aa  131  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.093413  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1218  phosphate transporter family protein  37.93 
 
 		 512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.5175  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1957  phosphate transporter family protein  37.63 
 
 		 514 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1129  phosphate-transport permease PitB  37.57 
 
 		 522 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.371556  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0682  phosphate transporter family protein  35.41 
 
 		 516 aa  121  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1328  phosphate transporter family protein  36.61 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.787742  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0535  phosphate transporter family protein  37.08 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.90245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1209  phosphate transporter family protein  36.61 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00270  phosphate/sulfate permease  44.07 
 
 		 539 aa  116  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.382263 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1021  phosphate transporter  22.86 
 
 		 391 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.335253 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23830  predicted protein  31.25 
 
 		 497 aa  110  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.028524  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0998  hypothetical protein  26.02 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.06049  normal  0.558836 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12304  phosphate-transport system permease pitB  37.5 
 
 		 552 aa  103  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5202  phosphate transporter  31.34 
 
 		 334 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1038  phosphate transporter  27.59 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42057  PiT family transporter: phosphate  39.46 
 
 		 538 aa  99.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.870144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119536  high affinity phosphate transporter, probable  39.46 
 
 		 600 aa  99.4  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0681687  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1023  phosphate transporter  24.21 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.880841 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08956  phosphate-repressible phosphate permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01850)  30.04 
 
 		 571 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5472  phosphate transporter  31 
 
 		 333 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0764  phosphate transporter  24.65 
 
 		 397 aa  97.4  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.609739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3393  phosphate transporter  30.93 
 
 		 334 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5972  phosphate transporter  32.34 
 
 		 334 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10556  low affinity inorganic phosphate transporter integral membrane protein pitA  24.53 
 
 		 417 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0205313  normal  0.167951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>