129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0651 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  100 
 
 		 646 aa  1275    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  32.33 
 
 		 675 aa  289  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  31.73 
 
 		 660 aa  276  9e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  31.73 
 
 		 660 aa  275  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  29.28 
 
 		 656 aa  239  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  26.83 
 
 		 709 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  24.32 
 
 		 712 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  23.54 
 
 		 614 aa  108  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  24.09 
 
 		 640 aa  107  7e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  23.13 
 
 		 649 aa  106  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  23.56 
 
 		 654 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  23.64 
 
 		 606 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  22.94 
 
 		 655 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  25.29 
 
 		 696 aa  98.2  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  23.78 
 
 		 612 aa  96.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  23.41 
 
 		 648 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  22.76 
 
 		 607 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  23.97 
 
 		 643 aa  93.6  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  22.88 
 
 		 645 aa  92.8  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  22.64 
 
 		 606 aa  91.7  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  23.65 
 
 		 606 aa  90.5  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  22.6 
 
 		 607 aa  90.5  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  22.02 
 
 		 656 aa  89  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  22.31 
 
 		 606 aa  88.2  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  21.79 
 
 		 695 aa  87.8  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  21.07 
 
 		 695 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  23.33 
 
 		 649 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  23.85 
 
 		 645 aa  85.5  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  22.6 
 
 		 607 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  23.82 
 
 		 632 aa  84  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  23.99 
 
 		 1013 aa  83.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  26.61 
 
 		 640 aa  82  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  25.1 
 
 		 893 aa  81.3  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  23.24 
 
 		 705 aa  80.9  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_004310  BR1608  AsmA family protein  23.65 
 
 		 645 aa  79.3  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0438435  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  24.52 
 
 		 602 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  28.57 
 
 		 502 aa  76.3  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  22.96 
 
 		 508 aa  75.5  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1137  AsmA family protein  22.67 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0909358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  25.22 
 
 		 655 aa  74.3  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  21.91 
 
 		 604 aa  72  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  23.02 
 
 		 699 aa  72  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  22.56 
 
 		 656 aa  71.6  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  23.11 
 
 		 704 aa  70.9  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  22.47 
 
 		 725 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  25.63 
 
 		 732 aa  70.1  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  25.08 
 
 		 657 aa  69.7  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  25.54 
 
 		 606 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  26.46 
 
 		 742 aa  69.3  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  22.8 
 
 		 614 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  24.02 
 
 		 654 aa  68.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  24.83 
 
 		 812 aa  68.2  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  28.34 
 
 		 677 aa  68.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  22.39 
 
 		 669 aa  67.8  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  24.48 
 
 		 611 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  24.39 
 
 		 649 aa  67.4  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  25.23 
 
 		 606 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  26.88 
 
 		 797 aa  66.6  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  22.2 
 
 		 664 aa  67  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  23.95 
 
 		 599 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3924  AsmA family protein  22.04 
 
 		 649 aa  67  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  24.86 
 
 		 794 aa  63.9  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  26.42 
 
 		 737 aa  62.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0167  AsmA  22.63 
 
 		 603 aa  62.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  26.14 
 
 		 611 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  21.66 
 
 		 719 aa  61.6  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2451  putative assembly protein  20.96 
 
 		 618 aa  61.6  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3193  putative assembly protein  20.96 
 
 		 618 aa  61.6  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.182103  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2550  putative assembly protein  20.96 
 
 		 618 aa  61.6  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208031  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  25.29 
 
 		 741 aa  61.6  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  24.63 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  19.57 
 
 		 703 aa  59.3  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  24.58 
 
 		 1077 aa  58.5  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1230 aa  58.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  23.39 
 
 		 608 aa  58.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  25.82 
 
 		 587 aa  57  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  27.78 
 
 		 667 aa  56.6  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  21.28 
 
 		 617 aa  55.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  28.64 
 
 		 701 aa  55.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  21.09 
 
 		 617 aa  55.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  22.81 
 
 		 609 aa  54.7  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  21.09 
 
 		 617 aa  55.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  21.09 
 
 		 617 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  22.97 
 
 		 711 aa  53.9  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  21.09 
 
 		 617 aa  53.9  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  21.09 
 
 		 617 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  21.09 
 
 		 617 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  21.09 
 
 		 617 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  18.99 
 
 		 762 aa  52.4  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1785  hypothetical protein  29.19 
 
 		 470 aa  51.2  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1095 aa  51.2  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  20.16 
 
 		 615 aa  50.8  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  20.12 
 
 		 617 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  28 
 
 		 740 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  22.64 
 
 		 630 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0212  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1217 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0447715 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  28.46 
 
 		 789 aa  48.9  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1659  AsmA family protein  25 
 
 		 1191 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  20.44 
 
 		 670 aa  48.9  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4317  AsmA family protein  25 
 
 		 939 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>