More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0635 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1251  aspartyl-tRNA synthetase  64.08 
 
 		 596 aa  803    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4005  aspartyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 		 614 aa  700    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0504  aspartyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 625 aa  710    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0413061  normal  0.734988 
 
 
-
 
NC_002978  WD0413  aspartyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 		 600 aa  642    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3453  aspartyl-tRNA synthetase  66.44 
 
 		 591 aa  840    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0866598  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2472  aspartyl-tRNA synthetase  81.31 
 
 		 591 aa  1014    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0952045 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2633  aspartyl-tRNA synthetase  83.64 
 
 		 590 aa  1041    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530132  normal  0.0940983 
 
 
-
 
NC_004310  BR0751  aspartyl-tRNA synthetase  64.42 
 
 		 595 aa  816    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.220186  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0450  aspartyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 		 599 aa  721    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3140  aspartyl-tRNA synthetase  63.56 
 
 		 623 aa  820    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545815 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0868  aspartyl-tRNA synthetase  61.95 
 
 		 596 aa  785    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.925972  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0672  aspartyl-tRNA synthetase  53.29 
 
 		 590 aa  652    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.301206  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1104  aspartyl-tRNA synthetase  64.59 
 
 		 596 aa  809    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1588  aspartyl-tRNA synthetase  65.88 
 
 		 590 aa  832    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.858986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2168  aspartyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 		 604 aa  703    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271234  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0815  aspartyl-tRNA synthetase  81.31 
 
 		 591 aa  1014    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1592  aspartyl-tRNA synthetase  62.37 
 
 		 601 aa  777    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409967  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3302  aspartyl-tRNA synthetase  63.5 
 
 		 607 aa  784    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2072  aspartyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 		 606 aa  724    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2496  aspartyl-tRNA synthetase  65.93 
 
 		 590 aa  829    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1338  aspartyl-tRNA synthetase  60.67 
 
 		 593 aa  743    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.427897  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0334  aspartyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 		 590 aa  659    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3166  aspartyl-tRNA synthetase  82.46 
 
 		 591 aa  1039    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2336  aspartyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 590 aa  835    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.544435  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2557  aspartyl-tRNA synthetase  61.58 
 
 		 609 aa  769    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2947  aspartyl-tRNA synthetase  66.78 
 
 		 590 aa  835    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1396  aspartyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 597 aa  698    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2111  aspartyl-tRNA synthetase  65.88 
 
 		 590 aa  839    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3864  aspartyl-tRNA synthetase  65.93 
 
 		 590 aa  830    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0635  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 594 aa  1228    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.312658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1751  aspartyl-tRNA synthetase  60.88 
 
 		 619 aa  755    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96886  normal  0.294173 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2364  aspartyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 		 595 aa  728    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1122  aspartyl-tRNA synthetase  66.28 
 
 		 594 aa  829    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403181  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0802  aspartyl-tRNA synthetase  63.47 
 
 		 595 aa  798    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336028 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4374  aspartyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 		 604 aa  698    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2541  aspartyl-tRNA synthetase  63.91 
 
 		 595 aa  808    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210193  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0365  aspartyl-tRNA synthetase  81.31 
 
 		 591 aa  1011    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.747846 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1258  aspartyl-tRNA synthetase  64.34 
 
 		 605 aa  803    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886805 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0209  aspartyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 623 aa  670    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.789469 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0745  aspartyl-tRNA synthetase  64.42 
 
 		 595 aa  816    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4486  aspartyl-tRNA synthetase  58.83 
 
 		 604 aa  707    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2183  aspartyl-tRNA synthetase  77.1 
 
 		 591 aa  956    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.403701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0043  aspartyl-tRNA synthetase  62.02 
 
 		 593 aa  757    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000554718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2465  aspartyl-tRNA synthetase  59.6 
 
 		 604 aa  711    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858075  normal  0.022913 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0477  aspartyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 588 aa  634  1e-180  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000218693  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1469  aspartyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 608 aa  625  1e-178  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000021993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0932  aspartyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 605 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000107292  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1519  aspartyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 605 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000463103  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1016  aspartyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 608 aa  595  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90482  normal  0.914473 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1620  aspartyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 601 aa  593  1e-168  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0865646  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1320  aspartyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 604 aa  590  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0251551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1650  aspartyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 		 606 aa  589  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1543  aspartyl-tRNA synthetase  49.75 
 
 		 581 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00178145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 594 aa  512  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 600 aa  510  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 588 aa  504  1e-141  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 603 aa  496  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 589 aa  491  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 594 aa  490  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 592 aa  488  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 619 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 593 aa  479  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 589 aa  479  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 590 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 593 aa  478  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1587  aspartyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 590 aa  473  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000320348  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1981  aspartyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 585 aa  474  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000379313  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 595 aa  473  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0649  aspartyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 583 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.176198  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 598 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 593 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 589 aa  465  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 586 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0743  aspartyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 583 aa  462  1e-129  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.853011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 592 aa  462  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 593 aa  462  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 593 aa  462  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0668  aspartyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 583 aa  463  1e-129  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.530416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 613 aa  463  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0653  aspartyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 582 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0244847  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 594 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 591 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 591 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 591 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 591 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 591 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 599 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 598 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 591 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 600 aa  460  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 591 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 595 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 		 627 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 591 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1359  aspartyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 583 aa  461  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.400527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 591 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 594 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 594 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 596 aa  456  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000708268  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1086  aspartyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 580 aa  456  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.989132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>