165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0619 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0619  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  719    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.770562  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0259  hypothetical protein  60.28 
 
 
353 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.655158 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2650  hypothetical protein  60.29 
 
 
363 aa  371  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0231  hypothetical protein  61.8 
 
 
353 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1579  hypothetical protein  65.4 
 
 
351 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3334  hypothetical protein  54.93 
 
 
371 aa  333  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2212  hypothetical protein  54.65 
 
 
355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2261  hypothetical protein  50.7 
 
 
356 aa  298  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0760  hypothetical protein  45.45 
 
 
366 aa  284  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.562403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2549  hypothetical protein  49.03 
 
 
368 aa  279  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569612  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2151  hypothetical protein  44.51 
 
 
358 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0956088  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3094  hypothetical protein  42.9 
 
 
375 aa  257  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3172  hypothetical protein  43.14 
 
 
377 aa  253  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0778857  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2503  hypothetical protein  42.78 
 
 
390 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156222  normal  0.549612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3876  hypothetical protein  43.59 
 
 
376 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234317  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1412  hypothetical protein  42.42 
 
 
375 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00525557  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5254  protein of unknown function DUF185  47.99 
 
 
367 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1134  protein of unknown function DUF185  44.54 
 
 
369 aa  248  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0347191 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4843  protein of unknown function DUF185  43.42 
 
 
379 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1638  hypothetical protein  42.17 
 
 
363 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3022  protein of unknown function DUF185  42.7 
 
 
366 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.838138  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2759  protein of unknown function DUF185  43.26 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511112  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1764  hypothetical protein  42.19 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526416  normal  0.881912 
 
 
-
 
NC_004310  BR1529  hypothetical protein  42.21 
 
 
365 aa  243  3e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0673  hypothetical protein  40.95 
 
 
402 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1478  hypothetical protein  41.93 
 
 
365 aa  242  7.999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00590219  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2253  hypothetical protein  42.07 
 
 
367 aa  239  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262355  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0995  hypothetical protein  39.19 
 
 
366 aa  238  9e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.199095  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4165  hypothetical protein  42 
 
 
376 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.576249  normal  0.0725771 
 
 
-
 
NC_002978  WD0717  hypothetical protein  36.18 
 
 
349 aa  233  3e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3534  hypothetical protein  41.84 
 
 
386 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.196392  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0642  hypothetical protein  45.06 
 
 
364 aa  230  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175347  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0424  hypothetical protein  45.86 
 
 
324 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5412  hypothetical protein  48.14 
 
 
356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3290  hypothetical protein  46.05 
 
 
367 aa  226  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0487  hypothetical protein  43.57 
 
 
356 aa  222  6e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0762  hypothetical protein  34.39 
 
 
335 aa  219  5e-56  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.244362  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0313  hypothetical protein  35.95 
 
 
335 aa  218  1e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.368023  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3007  protein of unknown function DUF185  47.86 
 
 
362 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0679  hypothetical protein  42.54 
 
 
351 aa  211  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3110  protein of unknown function DUF185  47.26 
 
 
361 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.922104  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1230  hypothetical protein  41.57 
 
 
351 aa  209  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369365  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2884  hypothetical protein  47.26 
 
 
361 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.43196  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1092  protein of unknown function DUF185  44.83 
 
 
339 aa  206  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.192418  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0601  hypothetical protein  34.85 
 
 
323 aa  195  9e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.434393  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00510  conserved hypothetical protein  33.69 
 
 
449 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68115  predicted protein  31.31 
 
 
515 aa  181  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41366  predicted protein  37.19 
 
 
461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151662  normal  0.0721349 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06041  DUF185 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09740)  29.53 
 
 
504 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.115857  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4813  hypothetical protein  30.83 
 
 
397 aa  146  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1091  hypothetical protein  33.06 
 
 
387 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.25042  decreased coverage  0.00000118713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2755  hypothetical protein  32.33 
 
 
370 aa  143  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3621  hypothetical protein  30.42 
 
 
393 aa  135  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000385343  normal  0.0821404 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2597  protein of unknown function DUF185  33.42 
 
 
384 aa  135  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3205  hypothetical protein  31.88 
 
 
404 aa  132  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0626  protein of unknown function DUF185  27.93 
 
 
384 aa  129  9.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.925683  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3886  hypothetical protein  32.5 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.643173  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0153  protein of unknown function DUF185  35.67 
 
 
398 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.850011  normal  0.50101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3044  protein of unknown function DUF185  29.94 
 
 
387 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6326  hypothetical protein  33.61 
 
 
397 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883144  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2997  hypothetical protein  33.42 
 
 
396 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2330  hypothetical protein  34.44 
 
 
394 aa  123  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0230  hypothetical protein  32.01 
 
 
386 aa  122  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.885139 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0057  hypothetical protein  31.86 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2027  hypothetical protein  31.86 
 
 
388 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0476  hypothetical protein  32.39 
 
 
386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3084  hypothetical protein  30.97 
 
 
385 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2351  protein of unknown function DUF185  30.69 
 
 
410 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2887  hypothetical protein  32.17 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2363  hypothetical protein  33.15 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421927  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2977  hypothetical protein  33.15 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0977  protein of unknown function DUF185  31.86 
 
 
360 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3733  protein of unknown function DUF185  30.25 
 
 
396 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0278081  normal  0.709484 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0203  hypothetical protein  29.32 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15641  predicted protein  31.42 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0337  hypothetical protein  30.88 
 
 
424 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1418  protein of unknown function DUF185  29.67 
 
 
385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.54059e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2793  protein of unknown function DUF185  29.67 
 
 
386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.425322  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0697  protein of unknown function DUF185  33.7 
 
 
391 aa  109  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1649  protein of unknown function DUF185  26.52 
 
 
386 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0325386  hitchhiker  0.0000000752417 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1815  hypothetical protein  30.21 
 
 
394 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.520553  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0329  protein of unknown function DUF185  33.61 
 
 
393 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0104  hypothetical protein  32.13 
 
 
404 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2972  hypothetical protein  31.87 
 
 
396 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852457  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2922  hypothetical protein  27.15 
 
 
370 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2776  hypothetical protein  27.42 
 
 
370 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3024  hypothetical protein  32.17 
 
 
396 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2895  hypothetical protein  30.14 
 
 
397 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0689127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0943  hypothetical protein  28.49 
 
 
385 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000189258  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0602  protein of unknown function DUF185  29.95 
 
 
398 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.758537  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3870  protein of unknown function DUF185  29.56 
 
 
377 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0551  hypothetical protein  31.5 
 
 
358 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0037  hypothetical protein  29.91 
 
 
393 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0224  hypothetical protein  32.1 
 
 
400 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1049  hypothetical protein  30.67 
 
 
392 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0950573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0383  protein of unknown function DUF185  29.16 
 
 
378 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000105312  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0045  protein of unknown function DUF185  30.81 
 
 
397 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3820  protein of unknown function DUF185  29.25 
 
 
377 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4140  hypothetical protein  32.48 
 
 
386 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07411  hypothetical protein  28.45 
 
 
400 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>