218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0564 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0564  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 		 390 aa  786    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0752699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3395  peptidase M19, renal dipeptidase  64.71 
 
 		 411 aa  479  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1833  peptidase M19, renal dipeptidase  57.45 
 
 		 393 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0282  peptidase M19, renal dipeptidase  53.44 
 
 		 386 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00197146  normal  0.781669 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2359  peptidase M19, renal dipeptidase  49.22 
 
 		 393 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.160596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2447  peptidase M19 renal dipeptidase  50.4 
 
 		 388 aa  355  5e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234226 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3261  peptidase M19, renal dipeptidase  48.57 
 
 		 394 aa  352  8e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35092  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0451  peptidase M19 renal dipeptidase  46.2 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.645242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3564  peptidase M19, renal dipeptidase  47.38 
 
 		 387 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.388396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2850  peptidase M19 renal dipeptidase  48.79 
 
 		 389 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.25923  normal  0.0171201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4040  peptidase M19, renal dipeptidase  46.23 
 
 		 223 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  31.18 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  27.52 
 
 		 402 aa  129  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00224  membrane dipeptidase GliJ (AFU_orthologue; AFUA_6G09650)  30 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152892  normal  0.499822 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  29.78 
 
 		 333 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  31.23 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4785  Membrane dipeptidase  32.88 
 
 		 355 aa  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  28.45 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1915  membrane dipeptidase  31.78 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  30.77 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  30 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3994  Membrane dipeptidase  28.53 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0026  Membrane dipeptidase  28.57 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0134  Membrane dipeptidase  27.78 
 
 		 355 aa  113  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0386  Membrane dipeptidase  28.62 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5916  dipeptidase  25.35 
 
 		 344 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0654  renal dipeptidase family protein  25.56 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0616  renal dipeptidase family protein  25.56 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2460  peptidase M19, renal dipeptidase  26.72 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.133769 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  28.57 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  29.23 
 
 		 602 aa  107  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1304  peptidase M19, renal dipeptidase  30.19 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.53734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1592  peptidase M19, renal dipeptidase  30.19 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0400913 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  27.09 
 
 		 311 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  23.94 
 
 		 438 aa  106  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2183  dipeptidase family protein  31.4 
 
 		 320 aa  106  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.503276  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0802  dipeptidase AC  26.45 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3742  peptidase M19 renal dipeptidase  26.89 
 
 		 346 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  27.05 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3312  membrane dipeptidase  27.89 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.649064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0377  membrane dipeptidase  28.1 
 
 		 355 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  30.17 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  26.71 
 
 		 323 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2447  Membrane dipeptidase  27.88 
 
 		 394 aa  99.8  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0392137  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  27.8 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0941  peptidase M19, renal dipeptidase  26.7 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118584  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  26.13 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  26.13 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  29.2 
 
 		 323 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  29.2 
 
 		 323 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  26.8 
 
 		 323 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  28.09 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  27.8 
 
 		 323 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  24.86 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2542  membrane dipeptidase  26.82 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  27.8 
 
 		 323 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5836  Membrane dipeptidase  30.16 
 
 		 444 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  27.99 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  27.8 
 
 		 323 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  28.04 
 
 		 323 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  28.04 
 
 		 323 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  27.53 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2312  membrane dipeptidase  25.87 
 
 		 419 aa  97.4  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1664  peptidase M19 renal dipeptidase  30.49 
 
 		 312 aa  97.8  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  hitchhiker  0.00631997 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  28.04 
 
 		 323 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  28.04 
 
 		 323 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  28.04 
 
 		 323 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  27.41 
 
 		 323 aa  97.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  25.93 
 
 		 326 aa  97.1  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4032  Membrane dipeptidase  27.39 
 
 		 413 aa  97.4  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.771689  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  25.53 
 
 		 433 aa  97.1  5e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  26.92 
 
 		 323 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  28.96 
 
 		 325 aa  97.1  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  26.09 
 
 		 311 aa  96.7  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  27.68 
 
 		 323 aa  96.3  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6399  peptidase M19 renal dipeptidase  35.37 
 
 		 485 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2427  membrane dipeptidase  28.7 
 
 		 307 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1907  peptidase M19 renal dipeptidase  28.09 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  27.83 
 
 		 297 aa  94.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1550  Membrane dipeptidase  27.74 
 
 		 388 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  25.57 
 
 		 433 aa  93.2  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  27.34 
 
 		 348 aa  92.8  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  28.14 
 
 		 325 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2622  peptidase M19 renal dipeptidase  30.97 
 
 		 310 aa  92.4  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  27.03 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  25.4 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0805  membrane dipeptidase  27.78 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03672  dipeptidase  23.17 
 
 		 409 aa  91.3  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2131  Membrane dipeptidase  26.67 
 
 		 338 aa  92  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248358  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2327  peptidase M19 renal dipeptidase  30.61 
 
 		 353 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3889  dipeptidase  30.52 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.741978  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1093  peptidase M19, renal dipeptidase  30.66 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.620091 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  28.63 
 
 		 325 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3853  peptidase M19 renal dipeptidase  30.34 
 
 		 352 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417509 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  30.23 
 
 		 323 aa  90.9  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  29.86 
 
 		 306 aa  90.5  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3872  Membrane dipeptidase  29.31 
 
 		 412 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  25 
 
 		 363 aa  90.1  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  27.38 
 
 		 320 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4039  Zn-dependent dipeptidase  40.62 
 
 		 155 aa  89.7  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>