More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0491 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0491  aldo/keto reductase  100 
 
 		 334 aa  683    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00588566  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0539  oxidoreductase  60.59 
 
 		 312 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  43.41 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  36.1 
 
 		 355 aa  188  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  35.54 
 
 		 354 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  38.92 
 
 		 344 aa  172  7.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  38.22 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  37.3 
 
 		 327 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  34.73 
 
 		 332 aa  169  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  35.76 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  35.05 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  35.11 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3226  aldo/keto reductase  35.86 
 
 		 345 aa  165  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  33.01 
 
 		 349 aa  165  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2701  aldo/keto reductase  35.9 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.117556  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0085  putative norsolorinic acid reductase  36.57 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  34.41 
 
 		 351 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  36.07 
 
 		 346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  35.62 
 
 		 348 aa  162  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  32.26 
 
 		 344 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  33.65 
 
 		 344 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  35.59 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  33.97 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  34.31 
 
 		 335 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  35.16 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  35.4 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  35.33 
 
 		 349 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  35.59 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  33.98 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  31.95 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  35.46 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  33.12 
 
 		 340 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  32.29 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  34.77 
 
 		 349 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  34.77 
 
 		 349 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  33.44 
 
 		 346 aa  159  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1189  aldo/keto reductase  35.06 
 
 		 349 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.712785  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  35.65 
 
 		 343 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.33 
 
 		 335 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  35.65 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  35.33 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2573  aldo/keto reductase  35.24 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  34.87 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  34.87 
 
 		 323 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  35.65 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20030  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  34.44 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  34.97 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  32.83 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4249  aldo/keto reductase  33.92 
 
 		 343 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3492  aldo/keto reductase  34.95 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  33.45 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  34.41 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  32.77 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2301  aldo/keto reductase  32.59 
 
 		 332 aa  157  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  32.7 
 
 		 358 aa  156  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  33.01 
 
 		 334 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 337 aa  155  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0538  aldo/keto reductase  35.92 
 
 		 350 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1182  aldo/keto reductase  32.6 
 
 		 334 aa  155  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  32.26 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  34.02 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  34.02 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  34.02 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0885  aldo/keto reductase  33.02 
 
 		 341 aa  154  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  33.93 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  33.12 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  35.96 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  32.2 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  35.05 
 
 		 343 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3311  aldo/keto reductase  33.55 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917987  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  34.9 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4424  aldo/keto reductase  32.08 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00178858  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  33.79 
 
 		 344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2875  aldo/keto reductase  33.89 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.536931  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  32.2 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  33.79 
 
 		 389 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1533  aldo/keto reductase  33.67 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.666942 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  32.72 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  35.46 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  36.65 
 
 		 350 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  32.05 
 
 		 342 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  32 
 
 		 345 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  32.05 
 
 		 342 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5072  aldo/keto reductase  33.88 
 
 		 325 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  32.7 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  33.76 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  34.71 
 
 		 344 aa  152  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  33.66 
 
 		 335 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  31.94 
 
 		 317 aa  152  7e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  33.55 
 
 		 337 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5669  aldo/keto reductase  32.89 
 
 		 322 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3993  oxidoreductase  32.83 
 
 		 365 aa  152  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  32.99 
 
 		 345 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  33.33 
 
 		 345 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3378  aldo/keto reductase  35.35 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  32.99 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0701  aldo/keto reductase  35.83 
 
 		 348 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0151  oxidoreductase  35.55 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  34.91 
 
 		 344 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  33.22 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>