More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0470 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  63.64 
 
 		 648 aa  832    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  63.64 
 
 		 648 aa  832    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  58.86 
 
 		 649 aa  758    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 648 aa  1327    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  62.84 
 
 		 648 aa  826    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  63.88 
 
 		 647 aa  859    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  59.41 
 
 		 647 aa  791    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  47.57 
 
 		 628 aa  569  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  49.01 
 
 		 624 aa  557  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  46.56 
 
 		 681 aa  553  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  44.63 
 
 		 634 aa  521  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  45.08 
 
 		 662 aa  519  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  43.73 
 
 		 689 aa  506  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1763  penicillin-binding protein 2  43.72 
 
 		 658 aa  464  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549162  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  40.87 
 
 		 639 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  40.03 
 
 		 636 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1492  penicillin-binding protein 2  43.66 
 
 		 670 aa  445  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.38 
 
 		 618 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  39.58 
 
 		 609 aa  415  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  39.51 
 
 		 629 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  40.31 
 
 		 619 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  39.44 
 
 		 629 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0497  peptidoglycan glycosyltransferase  38.13 
 
 		 634 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  39.18 
 
 		 629 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  40.5 
 
 		 627 aa  405  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  39.18 
 
 		 629 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  40.13 
 
 		 630 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  39.15 
 
 		 626 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  39.27 
 
 		 631 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  39.04 
 
 		 619 aa  402  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  37.99 
 
 		 611 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  39.83 
 
 		 631 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  39.83 
 
 		 631 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  37.92 
 
 		 639 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  38.68 
 
 		 634 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  37.96 
 
 		 643 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  38.03 
 
 		 631 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  39.27 
 
 		 655 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  35.25 
 
 		 637 aa  389  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  37.07 
 
 		 630 aa  388  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  38.91 
 
 		 630 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  38.84 
 
 		 640 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  35.35 
 
 		 645 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  37.94 
 
 		 667 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  38.41 
 
 		 646 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  37.02 
 
 		 633 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  38.41 
 
 		 646 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  35.52 
 
 		 628 aa  385  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  38.22 
 
 		 636 aa  385  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  37.46 
 
 		 634 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  37.34 
 
 		 634 aa  382  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.03 
 
 		 640 aa  382  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  37.27 
 
 		 642 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  35.7 
 
 		 647 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  35.67 
 
 		 638 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  35.94 
 
 		 618 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  37.89 
 
 		 629 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  36.48 
 
 		 618 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  35.6 
 
 		 626 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  36.48 
 
 		 618 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  36.48 
 
 		 618 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  36.48 
 
 		 618 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  35.56 
 
 		 610 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  35.95 
 
 		 618 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  37.79 
 
 		 629 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  38.41 
 
 		 630 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  37.63 
 
 		 646 aa  371  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  36.33 
 
 		 640 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  36.86 
 
 		 636 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  35.79 
 
 		 618 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  35.79 
 
 		 618 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  35.79 
 
 		 618 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  37.08 
 
 		 632 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  36.09 
 
 		 631 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  34.83 
 
 		 632 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.36 
 
 		 641 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  37.87 
 
 		 630 aa  368  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  34.37 
 
 		 607 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0590  penicillin-binding protein 2  37.69 
 
 		 687 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253689  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  35.71 
 
 		 645 aa  368  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  34.44 
 
 		 643 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  35.76 
 
 		 634 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0671  peptidoglycan glycosyltransferase  37.69 
 
 		 687 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.195303  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  35.51 
 
 		 618 aa  365  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  36.69 
 
 		 631 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  36.41 
 
 		 662 aa  365  2e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  36.69 
 
 		 631 aa  364  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  36.55 
 
 		 678 aa  364  3e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  35.23 
 
 		 646 aa  364  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  36.69 
 
 		 631 aa  363  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  34.73 
 
 		 633 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  34.73 
 
 		 633 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  34.73 
 
 		 633 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  34.73 
 
 		 633 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  34.73 
 
 		 633 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  34.36 
 
 		 641 aa  362  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  34.92 
 
 		 627 aa  361  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  35.83 
 
 		 636 aa  360  3e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  35.74 
 
 		 664 aa  360  4e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  34.89 
 
 		 633 aa  359  9e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>