105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0413 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0413  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  535  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00475452  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1090  putative cyclopropane/cyclopropene fatty acid synthesis protein  57.55 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2753  hypothetical protein  57.14 
 
 		 249 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.948566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2938  hypothetical protein  55.92 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.064452  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4019  hypothetical protein  56.68 
 
 		 254 aa  278  6e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0368  protein of unknown function DUF1365  53.25 
 
 		 252 aa  269  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1389  hypothetical protein  37.9 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1054  protein of unknown function DUF1365  39.6 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1972  hypothetical protein  37.11 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3432  hypothetical protein  37.86 
 
 		 292 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1450  hypothetical protein  34.87 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1621  protein of unknown function DUF1365  39.92 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6582  hypothetical protein  36.69 
 
 		 284 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1803  protein of unknown function DUF1365  37.55 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  hitchhiker  0.000000430371 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0912  hypothetical protein  35.41 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4727  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0235  hypothetical protein  34.8 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.964457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1046  protein of unknown function DUF1365  38.68 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.616737 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1617  hypothetical protein  38.12 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1442  protein of unknown function DUF1365  37.8 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.328576 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0491  hypothetical protein  37.86 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.853849 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1556  hypothetical protein  33.87 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5885  hypothetical protein  35.06 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.192815  normal  0.239276 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1870  hypothetical protein  33.87 
 
 		 268 aa  125  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651772 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1891  protein of unknown function DUF1365  33.07 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0326  hypothetical protein  37.1 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000101488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5829  hypothetical protein  36.8 
 
 		 284 aa  122  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2970  hypothetical protein  36.15 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  0.71112 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2397  protein of unknown function DUF1365  36.15 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2905  hypothetical protein  36.67 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0463  hypothetical protein  34.92 
 
 		 276 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0724  hypothetical protein  34.71 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00450807  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2555  hypothetical protein  35.22 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6097  hypothetical protein  35.64 
 
 		 253 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0297528  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4843  hypothetical protein  35.22 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.49195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2566  hypothetical protein  34.58 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2839  protein of unknown function DUF1365  35.02 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.172989  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3572  hypothetical protein  30.57 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884877 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1486  hypothetical protein  32.28 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.735841  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0087  hypothetical protein  29.05 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2024  protein of unknown function DUF1365  32.24 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0297  protein of unknown function DUF1365  35 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2361  hypothetical protein  32.64 
 
 		 242 aa  99.4  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.292308  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0349  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.22 
 
 		 656 aa  99  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3929  hypothetical protein  34.31 
 
 		 280 aa  95.5  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.368469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4723  protein of unknown function DUF1365  31.54 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1488  hypothetical protein  39.33 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2920  hypothetical protein  31.88 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2121  protein of unknown function DUF1365  30.49 
 
 		 260 aa  92  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000114198 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1251  protein of unknown function DUF1365  28.15 
 
 		 291 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00207378  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3584  protein of unknown function DUF1365  31.44 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.33232  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2735  hypothetical protein  33.19 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3018  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0272  hypothetical protein  31.91 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.944039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3174  hypothetical protein  33.05 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1176  protein of unknown function DUF1365  33.33 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0957  hypothetical protein  32.22 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1067  hypothetical protein  32.2 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2097  hypothetical protein  31.38 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0128  hypothetical protein  29.66 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1955  protein of unknown function DUF1365  32.18 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116158 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2436  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.17 
 
 		 658 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2773  hypothetical protein  27.62 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.725138  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3380  hypothetical protein  29.28 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1483  hypothetical protein  28.81 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0639  hypothetical protein  27.64 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000143987  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2099  hypothetical protein  37.09 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.658996  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1117  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01778  hypothetical protein  27.14 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.145223  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2467  hypothetical protein  26.64 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4740  hypothetical protein  29.96 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.861039  normal  0.274237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10454  hypothetical protein  31.32 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3050  hypothetical protein  28.2 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3064  hypothetical protein  28.2 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3207  hypothetical protein  27.24 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1313  protein of unknown function DUF1365  27.44 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.91577 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1238  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  43.62 
 
 		 683 aa  73.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.306171  normal  0.747537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0101  protein of unknown function DUF1365  28.57 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00443517  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1002  hypothetical protein  27 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.160897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01817  hypothetical protein  28.48 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1384  hypothetical protein  30.77 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3369  hypothetical protein  26.61 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1169  hypothetical protein  26.8 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4268  protein of unknown function DUF1365  29.87 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.624218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0815  hypothetical protein  27.27 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1240  hypothetical protein  26.29 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1170  hypothetical protein  26.98 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3032  hypothetical protein  25 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0801667  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4071  hypothetical protein  24.38 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003862  hypothetical protein  26.58 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1819  hypothetical protein  29.24 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48601  predicted protein  24.38 
 
 		 360 aa  67  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1327  hypothetical protein  26.41 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01432  hypothetical protein  32.21 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4926  hypothetical protein  26.06 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39839  predicted protein  25.2 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00891557  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2710  hypothetical protein  25.37 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.784131  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4370  hypothetical protein  30.36 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.686626  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4457  hypothetical protein  30.36 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.163875  normal  0.0342696 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4751  hypothetical protein  30.36 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.307651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4537  hypothetical protein  28.14 
 
 		 667 aa  63.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.229647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>