More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0337 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 146 aa  303  5.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  64.79 
 
 		 148 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  63.01 
 
 		 148 aa  197  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  67.63 
 
 		 151 aa  193  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  67.63 
 
 		 151 aa  193  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  67.63 
 
 		 151 aa  193  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  65.71 
 
 		 147 aa  192  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  65.28 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  66.91 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  65 
 
 		 147 aa  191  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  66.91 
 
 		 151 aa  191  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  66.42 
 
 		 151 aa  189  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  64.08 
 
 		 147 aa  187  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  61.43 
 
 		 146 aa  186  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  63.38 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  62.14 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  63.77 
 
 		 151 aa  185  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  63.31 
 
 		 151 aa  184  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  65.94 
 
 		 160 aa  184  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  56.16 
 
 		 147 aa  183  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  60.56 
 
 		 152 aa  183  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  60.56 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  59.18 
 
 		 148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  61.27 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  59.18 
 
 		 148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  60.56 
 
 		 152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  63.12 
 
 		 193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  62.68 
 
 		 151 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  62.68 
 
 		 151 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  63.12 
 
 		 193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  62.68 
 
 		 151 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 149 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  61.15 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  62.68 
 
 		 151 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  62.04 
 
 		 149 aa  181  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  60.99 
 
 		 176 aa  181  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  62.77 
 
 		 193 aa  181  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  62.41 
 
 		 193 aa  181  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  62.94 
 
 		 149 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  60.99 
 
 		 157 aa  179  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  63.38 
 
 		 155 aa  179  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  60.99 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  57.97 
 
 		 148 aa  174  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 145 aa  173  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  60.43 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  58.62 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  55.78 
 
 		 151 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  57.55 
 
 		 153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 145 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  56.74 
 
 		 153 aa  169  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5950  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375239  normal  0.0174964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  57.45 
 
 		 153 aa  168  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  57.35 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  57.46 
 
 		 145 aa  168  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  52.41 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.7 
 
 		 165 aa  167  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.87 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  59.7 
 
 		 156 aa  167  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3443  3-dehydroquinate dehydratase, type II  59.15 
 
 		 146 aa  167  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 145 aa  167  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0294  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 143 aa  166  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1784  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 147 aa  166  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  57.64 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  55.03 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  60.31 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  59.03 
 
 		 156 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  58.33 
 
 		 178 aa  164  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4756  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 		 159 aa  164  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7090  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  62.69 
 
 		 141 aa  163  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3860  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0470796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3205  3-dehydroquinate dehydratase  60.74 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  57.86 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.32 
 
 		 156 aa  161  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  53.42 
 
 		 151 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2337  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.07 
 
 		 148 aa  160  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  52.38 
 
 		 156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1476  3-dehydroquinate dehydratase  57.64 
 
 		 178 aa  161  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  63.91 
 
 		 150 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  53.79 
 
 		 151 aa  160  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  57.35 
 
 		 144 aa  159  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  62.41 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2864  3-dehydroquinate dehydratase  59.85 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  61.15 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0813  3-dehydroquinate dehydratase  58.82 
 
 		 146 aa  159  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  62.41 
 
 		 150 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2570  3-dehydroquinate dehydratase  53.69 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0197  3-dehydroquinate dehydratase  58.39 
 
 		 153 aa  158  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  61.15 
 
 		 151 aa  158  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0376  3-dehydroquinate dehydratase  58.39 
 
 		 153 aa  158  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.071732  normal  0.0167457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>