244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0298 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0298  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
141 aa  290  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2531  GCN5-related N-acetyltransferase  41.27 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.801418  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0333  putative acetyltransferase  44 
 
 
148 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2038  acetyltransferase  45.24 
 
 
150 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0750  GCN5-related N-acetyltransferase  45.24 
 
 
150 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.620129  normal  0.699411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03080  putative acetyltransferase  43.7 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.043111  hitchhiker  0.000000418367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2585  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
150 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000324557 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2607  acetyltransferase  36.17 
 
 
142 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2857  GCN5-related N-acetyltransferase  45.97 
 
 
146 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42306  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0736  GCN5-related N-acetyltransferase  42.4 
 
 
149 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1581  GCN5-related N-acetyltransferase  43.2 
 
 
150 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0579775  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0039  GCN5-related N-acetyltransferase  34.06 
 
 
151 aa  98.2  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0436  GCN5-related N-acetyltransferase  36.5 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189459  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3786  hypothetical protein  40.94 
 
 
151 aa  95.5  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0020  hypothetical protein  40.94 
 
 
151 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142061  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4133  hypothetical protein  40.94 
 
 
151 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3857  hypothetical protein  40 
 
 
146 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3838  hypothetical protein  40 
 
 
146 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4026  hypothetical protein  40 
 
 
146 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3965  hypothetical protein  40 
 
 
146 aa  94  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.819942  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1998  acetyltransferase (GNAT) family protein  35.04 
 
 
140 aa  94  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0762765  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3922  hypothetical protein  40 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.768766 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1519  GCN5-related N-acetyltransferase  35.51 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0922659  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4453  hypothetical protein  33.09 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.767162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4171  hypothetical protein  33.09 
 
 
157 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0174  hypothetical protein  35.51 
 
 
148 aa  92  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2481  GCN5-related N-acetyltransferase  34.11 
 
 
163 aa  87.4  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000827608  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0432  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.617149  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0731728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0057  GCN5-related N-acetyltransferase  33.6 
 
 
149 aa  80.1  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0063  hypothetical protein  33.86 
 
 
152 aa  80.1  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1398  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
147 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0724  acetyltransferase  28.47 
 
 
154 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.268912  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4128  GCN5-related N-acetyltransferase  32.85 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000338404  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0469  GCN5-related N-acetyltransferase  35.51 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03400  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  31.67 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03351  hypothetical protein  31.67 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3975  hypothetical protein  30.83 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0162  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4927  hypothetical protein  31.67 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3901  acetyltransferase  34.45 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0744234  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0148  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0166  hypothetical protein  30.83 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3872  hypothetical protein  30.83 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3751  hypothetical protein  30.83 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4046  hypothetical protein  30.83 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0329  putative acetyltransferase  34.53 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1583  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2073  acetyltransferase  33.33 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.539818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3445  GCN5-related N-acetyltransferase  34.45 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4590  hypothetical protein  35.29 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.992434  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4517  hypothetical protein  35.29 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0536703  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4427  hypothetical protein  35.29 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.499385  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4514  hypothetical protein  35.29 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4392  hypothetical protein  35.29 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.72967  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6096  hypothetical protein  36.89 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.164941  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1981  hypothetical protein  36.89 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2340  GCN5-related N-acetyltransferase  32.31 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2005  hypothetical protein  38.52 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4246  hypothetical protein  34.45 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4554  hypothetical protein  34.45 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.321988  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5482  hypothetical protein  34.45 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03884  predicted acetyltransferase  33.61 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3985  GCN5-related N-acetyltransferase  33.61 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4018  hypothetical protein  33.61 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.131237 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0463  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03844  hypothetical protein  33.61 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.194334  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4188  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
163 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487702  normal  0.251974 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5293  hypothetical protein  36.89 
 
 
173 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0283195 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0122  hypothetical protein  33.05 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0546577 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3359  hypothetical protein  32.2 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2972  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0451042 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2287  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.795815  normal  0.63662 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  45 
 
 
154 aa  57.8  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4376  GCN5-related N-acetyltransferase  33.61 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.246785 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1746  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45980  putative acetyltransferase  35.29 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2949  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0839  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
165 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.020664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2393  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
170 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0945541  hitchhiker  0.000263761 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1722  GCN5-related N-acetyltransferase  26.12 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00703201  hitchhiker  0.00198196 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2741  GCN5-related N-acetyltransferase  26.12 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.326397  normal  0.640285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
237 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.609857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4578  putative GCN5-related N-acetyltransferase (GNAT)  46.15 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140894  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2176  acetyltransferase  43.24 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144066  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2662  GCN5-related N-acetyltransferase  26.12 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.362327  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2187  GCN5-related N-acetyltransferase  28.33 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.937867  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2628  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
278 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1897  acetyltransferase  43.24 
 
 
161 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.900785  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1944  acetyltransferase  43.24 
 
 
161 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2122  acetyltransferase, GNAT family  43.24 
 
 
161 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2091  acetyltransferase  43.24 
 
 
161 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2190  acetyltransferase, GNAT family  41.89 
 
 
161 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.600718  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  32.2 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1908  acetyltransferase  41.89 
 
 
161 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15247  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  28.67 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3224  acetyltransferase, GNAT family  41.89 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.62 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.291315  normal  0.765144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>