More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0222 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0222  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 267 aa  527  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.671513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  78.85 
 
 		 272 aa  416  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3584  tryptophan synthase subunit alpha  79.31 
 
 		 263 aa  411  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  77.51 
 
 		 263 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  77.51 
 
 		 263 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0349  tryptophan synthase subunit alpha  75.5 
 
 		 263 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0121944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0333  tryptophan synthase subunit alpha  67.68 
 
 		 265 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0198  tryptophan synthase subunit alpha  73 
 
 		 278 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0391  tryptophan synthase subunit alpha  64.81 
 
 		 277 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  70.46 
 
 		 278 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  70.04 
 
 		 278 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0062  tryptophan synthase subunit alpha  67.19 
 
 		 278 aa  341  9e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  68.75 
 
 		 279 aa  340  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2108  tryptophan synthase subunit alpha  69.17 
 
 		 279 aa  340  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.438972  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0054  tryptophan synthase subunit alpha  68.6 
 
 		 278 aa  339  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.130781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  62.98 
 
 		 269 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2024  tryptophan synthase subunit alpha  68.75 
 
 		 279 aa  337  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.014662  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  62.96 
 
 		 279 aa  336  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  62.6 
 
 		 269 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0073  tryptophan synthase subunit alpha  70.04 
 
 		 278 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0126825  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  62.6 
 
 		 269 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  62.21 
 
 		 269 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3955  tryptophan synthase subunit alpha  62.69 
 
 		 279 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.157341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  61.13 
 
 		 269 aa  332  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4282  tryptophan synthase subunit alpha  62.31 
 
 		 279 aa  332  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0021  tryptophan synthase subunit alpha  61.57 
 
 		 279 aa  328  8e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  61.07 
 
 		 270 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3238  tryptophan synthase subunit alpha  60.45 
 
 		 279 aa  325  7e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0664  tryptophan synthase subunit alpha  59.63 
 
 		 281 aa  322  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1988  tryptophan synthase subunit alpha  68.22 
 
 		 277 aa  321  8e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.011593 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0104  tryptophan synthase subunit alpha  59.16 
 
 		 270 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  61.99 
 
 		 278 aa  319  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  59.54 
 
 		 269 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02130  tryptophan synthase subunit alpha  58.78 
 
 		 269 aa  314  8e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  58.4 
 
 		 268 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  57.63 
 
 		 268 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4910  tryptophan synthase subunit alpha  59.78 
 
 		 280 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381713  normal  0.738486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4960  tryptophan synthase subunit alpha  59.78 
 
 		 278 aa  308  8e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126491  normal  0.0842715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4446  tryptophan synthase subunit alpha  59.78 
 
 		 280 aa  308  8e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.926362 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0477  tryptophan synthase subunit alpha  60.89 
 
 		 275 aa  305  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178989  hitchhiker  0.00299272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1402  tryptophan synthase subunit alpha  69.62 
 
 		 282 aa  300  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.362344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1695  tryptophan synthase subunit alpha  66.25 
 
 		 281 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  hitchhiker  0.000000673783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3382  tryptophan synthase subunit alpha  65.25 
 
 		 279 aa  299  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  58.62 
 
 		 271 aa  278  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0090  tryptophan synthase, alpha chain  55.73 
 
 		 265 aa  256  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4977  tryptophan synthase subunit alpha  59.17 
 
 		 275 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  53.75 
 
 		 271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  50.19 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1329  tryptophan synthase subunit alpha  54.73 
 
 		 276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0798301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  50.57 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  50.85 
 
 		 266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  48.45 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  46.9 
 
 		 267 aa  229  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2078  tryptophan synthase, alpha chain  46.96 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1965  tryptophan synthase subunit alpha  54.13 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1063  tryptophan synthase subunit alpha  49.42 
 
 		 264 aa  223  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  45.75 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0756  tryptophan synthase subunit alpha  45.34 
 
 		 275 aa  218  7e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000897023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  43.68 
 
 		 265 aa  218  7.999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2879  tryptophan synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 270 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.526675  normal  0.678186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1254  tryptophan synthase subunit alpha  45.34 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.521537  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1238  tryptophan synthase subunit alpha  50.85 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0468  tryptophan synthase subunit alpha  45.34 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.270777  normal  0.54371 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  51.27 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  44.35 
 
 		 268 aa  216  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  42.19 
 
 		 262 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  42.86 
 
 		 271 aa  214  8e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0433  tryptophan synthase subunit alpha  44.92 
 
 		 278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  43.64 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  40.77 
 
 		 265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2043  tryptophan synthase, alpha subunit  43.62 
 
 		 268 aa  211  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3061  tryptophan synthase subunit alpha  43.58 
 
 		 273 aa  211  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.691783  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3280  tryptophan synthase subunit alpha  49.32 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4174  tryptophan synthase, alpha subunit  45.35 
 
 		 285 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1268  tryptophan synthase subunit alpha  43.1 
 
 		 272 aa  208  9e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0871  tryptophan synthase, alpha chain  46.48 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.675089  hitchhiker  0.00834843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6840  tryptophan synthase subunit alpha  46.61 
 
 		 270 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.76658  normal  0.863565 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  42.91 
 
 		 272 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4376  tryptophan synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 271 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3350  tryptophan synthase subunit alpha  44.3 
 
 		 272 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4201  tryptophan synthase, alpha subunit  45.95 
 
 		 285 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0269054  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  43.1 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  43.92 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1803  tryptophan synthase, alpha subunit  44.76 
 
 		 273 aa  205  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4620  tryptophan synthase subunit alpha  45.76 
 
 		 271 aa  205  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.26381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2123  tryptophan synthase subunit alpha  44.49 
 
 		 271 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.689803  normal  0.0114764 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3855  tryptophan synthase subunit alpha  44.07 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1770  tryptophan synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  41.29 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4058  tryptophan synthase, alpha chain  44.96 
 
 		 285 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2465  tryptophan synthase subunit alpha  44.92 
 
 		 265 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1913  tryptophan synthase, alpha chain  42.42 
 
 		 273 aa  202  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.075631  normal  0.497259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0804  tryptophan synthase, alpha subunit  42.21 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.28241  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0729  tryptophan synthase subunit alpha  45.11 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  45.53 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1237  tryptophan synthase subunit alpha  43.48 
 
 		 274 aa  202  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763489 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0645  tryptophan synthase subunit alpha  45.11 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1333  tryptophan synthase, alpha subunit  44.61 
 
 		 277 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  43.39 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>