More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0192 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 		 508 aa  1005    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  42.56 
 
 		 495 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  42.28 
 
 		 487 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  42.32 
 
 		 495 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  42.42 
 
 		 495 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  38.9 
 
 		 536 aa  259  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  38.89 
 
 		 523 aa  256  5e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  38.89 
 
 		 523 aa  256  5e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  38.09 
 
 		 536 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  39.09 
 
 		 557 aa  252  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  37.74 
 
 		 532 aa  252  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  38.74 
 
 		 541 aa  252  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  37.66 
 
 		 535 aa  250  5e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  36.72 
 
 		 536 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  36.63 
 
 		 536 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  41.99 
 
 		 497 aa  243  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  37.23 
 
 		 532 aa  243  6e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  37.02 
 
 		 532 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  36.89 
 
 		 534 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  36.66 
 
 		 543 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  36.17 
 
 		 528 aa  233  9e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  35.42 
 
 		 534 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  34.64 
 
 		 502 aa  229  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  34.57 
 
 		 534 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  38.65 
 
 		 540 aa  225  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  36.21 
 
 		 543 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  32.48 
 
 		 541 aa  221  3e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  34.7 
 
 		 550 aa  219  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  36.46 
 
 		 567 aa  210  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  36.07 
 
 		 567 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  34.15 
 
 		 525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  32.56 
 
 		 576 aa  201  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  36.03 
 
 		 531 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  35.97 
 
 		 566 aa  196  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 		 489 aa  193  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  30.19 
 
 		 488 aa  188  2e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  32.95 
 
 		 497 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  36.02 
 
 		 528 aa  183  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  32.5 
 
 		 487 aa  178  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  32.28 
 
 		 504 aa  177  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  31.49 
 
 		 507 aa  176  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  30.96 
 
 		 588 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1180  apolipoprotein N-acyltransferase  30.77 
 
 		 509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  31.92 
 
 		 512 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  32.16 
 
 		 506 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  29.72 
 
 		 501 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  31.54 
 
 		 512 aa  173  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  31.73 
 
 		 512 aa  173  6.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  31.92 
 
 		 512 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  35.5 
 
 		 556 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  31.92 
 
 		 512 aa  172  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  30.41 
 
 		 514 aa  172  9e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  31.92 
 
 		 512 aa  172  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  31.92 
 
 		 512 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  35.85 
 
 		 500 aa  172  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  31.73 
 
 		 512 aa  171  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  32.49 
 
 		 507 aa  169  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  31.18 
 
 		 506 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  29.67 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  34.52 
 
 		 553 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3141  apolipoprotein N-acyltransferase  29.98 
 
 		 511 aa  167  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218924  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  32.45 
 
 		 522 aa  166  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  30.66 
 
 		 529 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  32.36 
 
 		 516 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  30.95 
 
 		 506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  30.66 
 
 		 529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  30.66 
 
 		 529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0403  apolipoprotein N-acyltransferase  33.61 
 
 		 503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  30.66 
 
 		 529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0480  apolipoprotein N-acyltransferase  32.14 
 
 		 505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0772251  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0418  apolipoprotein N-acyltransferase  34.46 
 
 		 503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  0.927373 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  33.55 
 
 		 537 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  30.66 
 
 		 529 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  32.43 
 
 		 507 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  32.26 
 
 		 520 aa  164  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  30.91 
 
 		 520 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  29.48 
 
 		 518 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  32.31 
 
 		 509 aa  163  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  31.4 
 
 		 505 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  31.68 
 
 		 525 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  31 
 
 		 510 aa  161  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3307  apolipoprotein N-acyltransferase  29.07 
 
 		 524 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1102  apolipoprotein N-acyltransferase  28.43 
 
 		 524 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000149878 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  31.66 
 
 		 521 aa  161  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3443  apolipoprotein N-acyltransferase  29.26 
 
 		 524 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000768498 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  33.81 
 
 		 523 aa  160  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  30.88 
 
 		 573 aa  160  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  31.38 
 
 		 509 aa  159  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  30.43 
 
 		 518 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  31.43 
 
 		 515 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  30.88 
 
 		 519 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1566  apolipoprotein N-acyltransferase  30.04 
 
 		 500 aa  158  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.910854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 		 505 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  31.86 
 
 		 537 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  33.8 
 
 		 505 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  29.1 
 
 		 524 aa  157  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  32.05 
 
 		 521 aa  158  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  30.44 
 
 		 500 aa  158  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3265  apolipoprotein N-acyltransferase  28.24 
 
 		 524 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  32.09 
 
 		 505 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>