More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0183 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0183  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 
142 aa  296  8e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1652  ferric uptake regulator family protein  66.67 
 
 
174 aa  192  9e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0785232  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1011  ferric uptake regulator  69.23 
 
 
138 aa  190  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3937  hypothetical protein  61.31 
 
 
146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.303418  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3179  ferric-uptake regulator  59.85 
 
 
146 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3916  ferric uptake regulator family protein  59.85 
 
 
146 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.766426  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3451  ferric uptake regulator family protein  53.19 
 
 
140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4055  ferric uptake regulator, Fur family  58.73 
 
 
139 aa  143  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3940  ferric uptake regulator family protein  56 
 
 
136 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648829  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4376  ferric uptake regulator, Fur family  57.94 
 
 
139 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154466  normal  0.217188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2230  ferric uptake regulator family protein  54.76 
 
 
164 aa  143  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0548087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0381  ferric uptake regulator, Fur family  54.76 
 
 
164 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0493  ferric uptake regulator, Fur family  54.62 
 
 
166 aa  140  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.147436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2686  ferric uptake regulator family protein  54.62 
 
 
171 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.176572  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2086  ferric uptake regulator family protein  53.85 
 
 
147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.941091  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2174  ferric uptake regulator family protein  53.85 
 
 
147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0071  ferric uptake regulator family protein  51.91 
 
 
165 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0428  ferric uptake regulator, Fur family  51.52 
 
 
149 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0043  ferric uptake regulator family protein  51.15 
 
 
165 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0035  ferric-uptake regulator  51.15 
 
 
168 aa  137  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0183  transcriptional regulator Fur family  55.12 
 
 
138 aa  137  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3637  ferric uptake regulator family protein  53.66 
 
 
143 aa  136  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000386117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0614  ferric uptake regulator family protein  50 
 
 
162 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0219  ferric-uptake regulator  49.24 
 
 
162 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.690506  normal  0.0874636 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0738  ferric uptake regulator family protein  50.38 
 
 
145 aa  134  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0350  ferric uptake regulator family protein  49.61 
 
 
164 aa  131  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1267  iron response regulator Irr  50.38 
 
 
147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2583  ferric uptake regulator, Fur family  48.09 
 
 
163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0134426  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3788  ferric uptake regulator family protein  52.03 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0364  FUR family transcriptional regulator  46.32 
 
 
152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0380  FUR family transcriptional regulator  46.32 
 
 
195 aa  126  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3651  ferric uptake regulator, Fur family  51.61 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.334174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0423  ferric-uptake regulator  53.85 
 
 
166 aa  124  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.228905  normal  0.25434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0456  ferric uptake regulator, Fur family  53.85 
 
 
166 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.190057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3845  ferric uptake regulator family protein  51.69 
 
 
208 aa  123  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0310  ferric uptake regulator family protein  50.35 
 
 
143 aa  122  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0977  ferric uptake regulator family protein  50.38 
 
 
147 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.053253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5877  FUR family transcriptional regulator  46.83 
 
 
164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.200275  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1272  ferric uptake regulator, Fur family  43.31 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2346  ferric uptake regulator, Fur family  44.09 
 
 
164 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.766675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3691  ferric uptake regulator, Fur family  43.28 
 
 
158 aa  98.6  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0313697 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2466  ferric uptake regulator, Fur family  34.88 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0491  ferric uptake regulator family protein  40.48 
 
 
161 aa  91.7  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.781882  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3233  ferric uptake regulator family protein  33.58 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1714  ferric uptake regulator family protein  34.59 
 
 
136 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.382705  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1623  ferric uptake regulator, Fur family  37.14 
 
 
141 aa  82  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.507578  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1955  transcriptional regulator, Fur family  38.58 
 
 
131 aa  80.9  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0122118  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1536  ferric uptake regulator, Fur family  36.13 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.514576  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1915  ferric uptake regulator family protein  39 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3521  ferric uptake regulator, Fur family  30.94 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1949  ferric-uptake regulator  39 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.869616  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1398  FUR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1597  ferric uptake regulator, Fur family  34.38 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.231223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3531  ferric uptake regulator, Fur family  38.83 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  33.85 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  36 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1300  ferric uptake regulator family protein  36 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0844  ferric uptake regulator, Fur family  31.91 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126283  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  37.5 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1296  FUR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  36.54 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  36.54 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2723  ferric uptake regulation protein  29.85 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.259626  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  36.54 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  36.54 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0122  ferric uptake regulation protein  35.04 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00816522  normal  0.910281 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  36.54 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1420  FUR family transcriptional regulator  33 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0522352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  33.02 
 
 
143 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0615  ferric uptake regulator, Fur family  35.11 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.12884  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0486  ferric uptake regulator, Fur family  28.33 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.53591  normal  0.162007 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  33.64 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  33.64 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  32.33 
 
 
135 aa  57  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  34.26 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1672  FUR family transcriptional regulator  32 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01084  ferric uptake regulator  34.88 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00618384  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0222  ferric-uptake regulator  27.42 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  32.35 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  32.35 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  32.69 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  34.74 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  32.69 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1037  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0953137  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4167  ferric uptake regulator family protein  30.23 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  32.35 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3627  ferric uptake regulator family protein  32.84 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  32.35 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  32.35 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  32.69 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  32.69 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  32.69 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  34.04 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  33.67 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  33.67 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  37.5 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  33.67 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>