More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0163 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  53.25 
 
 		 256 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  51.63 
 
 		 256 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  50.41 
 
 		 258 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  50.2 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1639  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  48.06 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.866328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  43.72 
 
 		 253 aa  191  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  37.34 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  35.68 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  44.26 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3473  PEP phosphonomutase  41.15 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0613154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  43.97 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2281  hypothetical protein  44.35 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5295  PEP phosphonomutase  40.33 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0426519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  44.35 
 
 		 278 aa  161  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  39.48 
 
 		 269 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  41.99 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3563  PEP phosphonomutase  43.32 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  35.29 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  45.53 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3957  PEP phosphonomutase  40.49 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.217793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  41.92 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2560  PEP phosphonomutase  38.78 
 
 		 253 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  33.06 
 
 		 266 aa  144  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2982  PEP phosphonomutase  39.5 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  35.1 
 
 		 269 aa  135  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  41.48 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  36.09 
 
 		 277 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  37.17 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  43.16 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  36.52 
 
 		 282 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  36.09 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  35.74 
 
 		 282 aa  129  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  35.65 
 
 		 282 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  40 
 
 		 294 aa  128  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  35.62 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  37.17 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  40.89 
 
 		 273 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  35.97 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  40.44 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  36.84 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  36.68 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  36.68 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  35.34 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  39.48 
 
 		 286 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  36.68 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12660  PEP phosphonomutase-like enzyme  41.42 
 
 		 271 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0289  hypothetical protein  36.52 
 
 		 252 aa  122  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  35.32 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  31.44 
 
 		 289 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  40.89 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.327181 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  34.91 
 
 		 274 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  34.35 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4484  PEP phosphonomutase  43.36 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000284716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  37.39 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  35.47 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1447  PEP phosphonomutase and related enzymes  35.5 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  34.05 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  36.86 
 
 		 425 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  34.21 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06151  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein (AFU_orthologue; AFUA_5G07230)  31.76 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0384157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  36.44 
 
 		 279 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  35.47 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  35.47 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  35.47 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  33.05 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  33.19 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3519  hypothetical protein  38.43 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.596575  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  35.09 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  32.05 
 
 		 271 aa  101  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.19 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  35.5 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  34.15 
 
 		 278 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  32.62 
 
 		 275 aa  99  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  31.38 
 
 		 275 aa  99  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  35.71 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  33.19 
 
 		 281 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  40.35 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  32.77 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  36.44 
 
 		 279 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  32.91 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  34.91 
 
 		 286 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  34.87 
 
 		 274 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  32.48 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  32.22 
 
 		 275 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  35.9 
 
 		 279 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  34.55 
 
 		 274 aa  92  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2418  hypothetical protein  36.16 
 
 		 242 aa  92  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206237  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  31.51 
 
 		 276 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  31.93 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  31.22 
 
 		 276 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  31.73 
 
 		 280 aa  89  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  29.79 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  31.8 
 
 		 276 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  34.19 
 
 		 286 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  33.91 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  29.36 
 
 		 271 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  30.64 
 
 		 275 aa  85.5  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  28.87 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  35.47 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>